自定义格式

人工智能在医疗保健中的应用

引言

人工智能（AI）正在迅速改变医疗保健行业。通过利用机器学习、自然语言处理和计算机视觉等技术，AI能够分析大量数据，提供个性化治疗方案，并提高诊断准确性。本文探讨了AI在医疗保健中的各种应用，包括诊断、治疗和患者管理。

诊断

AI在诊断中的应用主要集中在图像分析和数据挖掘。例如，AI算法可以分析医学影像（如X射线、CT扫描和MRI），以检测疾病迹象。此外，AI还可以分析电子健康记录（EHR），识别患者数据中的模式，从而辅助医生进行早期诊断。

医学影像分析

AI在医学影像分析中的应用已经取得了显著进展。深度学习算法能够识别影像中的细微差异，帮助医生更早地发现疾病。例如，AI系统在检测乳腺癌和肺癌方面已经显示出比传统方法更高的准确性。

电子健康记录分析

AI还可以通过分析电子健康记录来辅助诊断。通过挖掘患者的历史数据，AI可以识别出潜在的健康风险因素，并提供个性化的预防建议。此外，AI还可以帮助医生识别出可能被忽视的疾病模式。

治疗

AI在治疗中的应用包括个性化治疗方案的制定和药物研发。通过分析患者的基因信息和临床数据，AI可以为每位患者量身定制最佳治疗方案。此外，AI还可以加速新药的研发过程，减少时间和成本。

个性化治疗

个性化治疗是AI在医疗保健中的一个重要应用领域。通过分析患者的基因组数据和临床表现，AI可以预测患者对不同治疗方法的反应，从而制定出最有效的治疗方案。例如，AI已经被用于预测癌症患者对特定药物的反应。

药物研发

AI在药物研发中的应用正在改变传统的药物开发过程。通过利用机器学习算法，AI可以筛选出最有潜力的药物候选分子，并预测其药效和副作用。这不仅加速了新药的研发过程，还降低了研发成本。

患者管理

AI在患者管理中的应用包括远程监控、健康预测和患者教育。通过利用可穿戴设备和传感器，AI可以实时监控患者的健康状况，并提供及时的干预措施。此外，AI还可以预测患者的健康风险，帮助医生制定预防策略。

远程监控

远程监控是AI在患者管理中的一个重要应用。通过使用可穿戴设备和传感器，AI可以实时收集患者的生理数据，并将其传输到医疗中心。这使得医生能够远程监控患者的健康状况，并在必要时提供及时的干预。

健康预测

AI还可以通过分析患者的健康数据来预测未来的健康风险。例如，AI可以分析患者的血压、血糖和心率数据，预测其患心血管疾病的风险。这使得医生能够提前采取预防措施，降低疾病发生的可能性。

患者教育

AI还可以用于患者教育，帮助患者更好地理解和管理自己的健康。通过提供个性化的健康建议和教育内容，AI可以帮助患者养成健康的生活习惯，并提高其对治疗的依从性。

结论

人工智能在医疗保健中的应用正在改变传统的医疗模式，提高了诊断的准确性、治疗的个性化和患者管理的效率。随着技术的不断进步，AI将在未来继续发挥重要作用，推动医疗保健行业的发展。

概述

Quarto 格式扩展使您能够添加新的格式到已有的内置格式（例如 html、pdf、docx）中。自定义格式可以提供默认的文档选项、样式表、页眉、页脚或徽标元素，甚至可以捆绑其他扩展，如过滤器和短代码。它们是提供组织内文档或演示文稿、特定类型项目或分析或特定出版物的共同基准的绝佳方式。

您可以在 format 键下指定自定义格式，就像指定内置格式一样。例如：

---
title: "我的文档"
format:
   acm-pdf: 
     toc: true
---

所有自定义格式都源自一种基础格式，并包含该基础格式作为后缀。格式还可以提供源自不同基础格式的多种变体。例如：

---
title: "我的文档"
toc: true
format:
   acm-pdf: default
   acm-html: default
---

请注意，我们将 toc 选项移到了顶层，因为它在两种格式之间是共享的。

自定义格式也可以与 quarto render 的 --to 参数一起使用。例如：

终端

quarto render document.qmd --to acm-html

请注意，如果您特别感兴趣的是使用或创建期刊和手稿的自定义格式，您可能希望直接转到期刊文章的文档。

快速开始

在这里，我们将描述如何创建一个简单的基于 HTML 的格式扩展。我们将使用 quarto create 命令来完成此操作。如果您使用的是 VS Code 或 RStudio，您应该在它们各自的集成终端窗格中执行 quarto create。

要开始，请在您希望创建格式的父目录中执行 quarto create extension format:html：

终端

$ quarto create extension format:html
 ? 扩展名称 › lexdoc

如上所示，系统会提示您输入扩展名称。键入 lexdoc（一个名为 LexCrop 的虚构公司的文档格式）并按下 Enter——自定义格式扩展随即创建：

在 /Users/jjallaire/quarto/dev/lexdoc 创建扩展：
  - 创建了 README.md
  - 创建了 _extensions/lexdoc/custom.scss
  - 创建了 _extensions/lexdoc/_extension.yml
  - 创建了 template.qmd

如果您在 VS Code 或 RStudio 中运行，将打开一个包含扩展项目的新窗口。

请注意，此示例创建了一个源自 Quarto 基础 html 格式的格式。您同样可以创建源自 pdf、docx 和 revealjs 的格式，如下所示：

终端

quarto create extension format:pdf
quarto create extension format:docx
quarto create extension format:revealjs

以下是 _extensions/lexdoc/ 目录中文件的内容：

_extensions/lexdoc/_extension.yml

title: Lexdoc
author: J.J. Allaire
version: 1.0.0
quarto-required: ">=1.2.222"
contributes:
  formats:
    html:
      toc: true
      theme: [yeti, custom.scss]

这里定义的自定义 HTML 格式非常简单。它采用了基础 html 格式，默认启用目录，并将主题设置为 yeti，同时使用 custom.scss 文件进行额外的自定义：

_extensions/lexdoc/custom.css

/*-- scss:defaults --*/

/* TODO: 使用 SCSS 变量自定义外观 */
/* 参见 [HTML 主题](https://quarto.org/docs/output-formats/html-themes.html#theme-options) */

/*-- scss:rules --*/

/* TODO: 提供自定义 CSS 规则 */

最后，template.qmd 为格式用户提供了一个基础示例文章：

template.qmd

---
title: "Lexdoc 示例"
format:
  lexdoc-html: default
author: J.J. Allaire
date: last-modified
---

## 介绍

*TODO* 创建一个示例文件，展示您的格式的格式和功能。

## 更多信息

您可以在此处了解更多关于控制 HTML 输出外观的信息：<https://quarto.org/docs/output-formats/html-basics.html>

要开发您的格式，请渲染/预览 template.qmd，然后在 _extensions 目录中的各个文件中进行更改（当您更改这些文件时，预览会自动刷新）。

示例：Revealjs

接下来，我们将逐步创建一个扩展 revealjs 演示文稿格式的自定义格式。以下是格式扩展的源代码仓库可能的样子：

README.md
LICENSE
template.qmd
_extensions/
  lexconf/
    _extension.yml
    theme.scss
    logo.png
    title.png

注意，目录名称中排除了格式后缀（revealjs）（这是为了考虑到可能存在多种格式，例如 lexconf-revealjs、lexconf-pptx 等）。

与其他类型的扩展一样，唯一严格要求的是 _extensions 目录（其上的任何内容都是为了你自己的目的，并且在格式安装期间会被忽略）。即便如此，包含一个 README.md 和 LICENSE 文件也是一个好的做法。template.qmd 文件有几个用途：

你可以在开发格式时渲染它，以确保一切按预期工作。
它可以作为格式模板的基础（这有助于用户开始使用你的格式）。

以下是 _extension.yml 内容可能的样子：

title: LexConf 2022 Presentation
author: LexCorp
version: 1.0.0
quarto-required: ">=1.2.0"
contributes:
  formats:
    revealjs:
       theme: [default, theme.scss]
       logo: logo.png
       footer: | 
         Copyright 2022 (c) LexCorp, Inc.
       title-slide-attributes:
          data-background-image: title.png
          data-background-size: contain
       preview-links: auto

这种格式主要提供组织级别的内容和主题。如上所述，格式还可以包括过滤器，允许添加自定义的 Markdown 结构和渲染行为。

以下是 template.qmd 内容可能的样子：

---
title: "Presentation"
subtitle: "LexConf 2022"
author: "Your Name"
date: today
format: lexconf-revealjs
---

# Overview

扩展仓库的结构使得你可以通过直接在仓库根目录渲染 template.qmd 文件来测试你的扩展和模板。template.qmd 将能够像安装时一样加载你的扩展，因此测试和迭代应该像在你扩展目录中工作一样简单，直到你满意为止（无需反复安装或更新扩展来测试）。

格式模板

上面我们描述了在扩展旁边包含一个 template.qmd，然后通过以下方式一起安装模板和格式：

Terminal

quarto use template <gh-organization>/<extension>

template.qmd 应该展示格式的功能，并为用户提供一个良好的起点。当扩展模板被复制到目标目录时，template.qmd 将自动重命名为用户为目录提供的名称。

你还可以在 template.qmd 旁边包含其他文件，它们也会被复制。请注意，默认情况下，Quarto 在复制扩展模板时会排除常见的 Github 仓库文件。这包括任何以 . 开头的文件名或目录（例如 .gitignore）、README.md、LICENSE 等。如果你愿意，可以在仓库根目录放置一个 .quartoignore 文件，文件的每一行都是一个描述要忽略的文件（使用类似于 .gitignore 文件的语法）的 glob。

分发格式

你可以通过以下两种方式之一分发格式扩展：

作为包含格式文件和 template.qmd 的模板（template.qmd 会自动重命名为与所在目录同名）。
作为没有模板结构的纯格式（这对于将格式添加到现有文档或项目中很有用）。

如果你有一个包含上述文件的 GitHub 仓库，用户可以按照以下方式安装你的扩展和相关模板（其中 lexcorp 是托管该仓库的 GitHub 组织）：

Terminal

quarto use template lexcorp/lexconf

这通常是开始使用格式时的首选方式，因为它为用户提供了一个开箱即用的工作文档。如果你正在处理现有项目，也可以只安装格式：

Terminal

quarto add lexcorp/lexconf

请注意，可以将扩展打包并分发为简单的 gzip 存档（而不是像上面描述的那样使用 GitHub 仓库）。有关更多详细信息，请参阅分发扩展的文章。

多格式支持

单个格式扩展可以支持多种输出格式。例如，一个扩展可能针对 html 和 pdf 输出。要在扩展中支持多种格式，你可以像这样向 contributes / format 键添加其他基础格式：

contributes:
  format:
    html:
      # html 特定选项
    pdf:
      # pdf 特定选项

通用元数据

如果你的格式扩展针对任何输出格式时都有共同的元数据，你可以将该元数据放在 common 键下。例如：

contributes:
  format:
    common:
      filters:
        - filter.lua
      shortcodes:
        - quarto-ext/fancy-text
    html:
      # html 特定
    pdf:
      # pdf 特定

格式资源

通常，你可以通过将这些文件放在扩展目录中，并在 _extension.yml 元数据文件中使用相对路径来引用它们，从而在格式扩展中包含其他文件和资源。这些相对路径将在扩展的元数据与渲染文档的元数据合并时得到正确处理。

如果你需要将某些资源复制到输入目录中作为渲染文档的一部分（例如，LaTeX 参考文献的 bst 文件或从 LaTeX 模板引用的徽标或其他文件），你可以提供 format-resources，这是一个文件路径列表¹。这些文件将在文档渲染时被复制到包含输入的目录中。例如：

contributes:
  format:
    pdf:
      format-resources:
        - plos2015.bst

扩展嵌入

在某些情况下，格式扩展会希望使用其他扩展。这是允许的，但必须在特殊命令行标志下添加扩展，以确保它们被正确嵌入。

Terminal

quarto create extension format:pdf myformat
cd myformat
quarto add quarto-ext/fancy-text --embed myformat

例如，我们希望使 fancy-text 扩展（为 \(\LaTeX\) 和 BibT_EX 提供特殊格式）对 jss 自定义格式的用户可用：

Terminal

quarto add quarto-ext/fancy-text --embed jss

这将产生以下输出：

Output

quarto-journals/jss
└── _extensions
    └── jss
        ├── _extensions
        │   └── quarto-ext
        │       └── fancy-text
        └── partials

这会将 quarto-ext/fancy-text 扩展添加到 jss 扩展的 _extensions 文件夹中。通过嵌入扩展，你可以在不与用户可能已安装的其他版本的扩展发生潜在冲突的情况下使其可用。

Footnotes

这在基于 PDF 的格式中最为常见，这些格式在将 Pandoc 生成的 LaTeX 转换为 PDF 时有一个次要步骤。如果 LaTeX 间接引用了某些文件，它们需要可被发现，并且通常应被复制到包含 LaTeX 输入的同一目录中。↩︎