pandas 文档字符串指南#
关于文档字符串和标准#
Python 文档字符串是一个用于文档化 Python 模块、类、函数或方法的字符串,这样程序员可以理解它的功能,而无需阅读实现的细节。
此外,从文档字符串自动生成在线(html)文档是一种常见做法。Sphinx 服务于这一目的。
下一个示例展示了docstring的样子:
def add(num1, num2):
"""
Add up two integer numbers.
This function simply wraps the ``+`` operator, and does not
do anything interesting, except for illustrating what
the docstring of a very simple function looks like.
Parameters
----------
num1 : int
First number to add.
num2 : int
Second number to add.
Returns
-------
int
The sum of ``num1`` and ``num2``.
See Also
--------
subtract : Subtract one integer from another.
Examples
--------
>>> add(2, 2)
4
>>> add(25, 0)
25
>>> add(10, -10)
0
"""
return num1 + num2
关于文档字符串存在一些标准,这使得它们更容易阅读,并允许它们轻松导出到其他格式,如html或pdf。
每个 Python 文档字符串应遵循的第一条约定在 PEP-257 中定义。
由于 PEP-257 相当广泛,还存在其他更具体的标准。在 pandas 的情况下,遵循 NumPy 文档字符串约定。这些约定在本文件中有解释:
numpydoc 是一个支持 NumPy 文档字符串约定的 Sphinx 扩展。
该标准使用 reStructuredText (reST)。reStructuredText 是一种标记语言,允许在纯文本文件中编码样式。关于 reStructuredText 的文档可以在以下位置找到:
pandas 有一些帮助工具用于在相关类之间共享文档字符串,参见 共享文档字符串。
本文档的其余部分将总结上述所有指南,并提供特定于pandas项目的附加约定。
编写一个文档字符串#
一般规则#
文档字符串必须用三个双引号定义。文档字符串前后不应留有空白行。文本从开引号的下一行开始。闭引号有自己的一行(这意味着它们不在最后一句话的末尾)。
在极少数情况下,reST 样式如粗体文本或斜体会用于文档字符串中,但常见的是使用内联代码,这些代码用反引号括起来。以下被视为内联代码:
参数的名称
Python 代码、模块、函数、内置函数、类型、字面量…(例如
os
、list
、numpy.abs
、datetime.date
、True
)一个 pandas 类(形式为
:class:`pandas.Series`
)一个 pandas 方法(形式为
:meth:`pandas.Series.sum`
)一个 pandas 函数(形式为
:func:`pandas.to_datetime`
)
备注
要仅显示链接的类、方法或函数的最后一个组件,请在其前面加上 ~
。例如,:class:`~pandas.Series`
将链接到 pandas.Series
但仅显示最后一部分 Series
作为链接文本。详情请参见 Sphinx 交叉引用语法。
好:
def add_values(arr):
"""
Add the values in ``arr``.
This is equivalent to Python ``sum`` of :meth:`pandas.Series.sum`.
Some sections are omitted here for simplicity.
"""
return sum(arr)
错误:
def func():
"""Some function.
With several mistakes in the docstring.
It has a blank line after the signature ``def func():``.
The text 'Some function' should go in the line after the
opening quotes of the docstring, not in the same line.
There is a blank line between the docstring and the first line
of code ``foo = 1``.
The closing quotes should be in the next line, not in this one."""
foo = 1
bar = 2
return foo + bar
第1节:简要总结#
简短的总结是用一句话简洁地表达函数的功能。
简短的摘要必须以大写字母开头,以句号结尾,并且适合单行。它需要表达对象的功能,而不提供详细信息。对于函数和方法,简短的摘要必须以不定式动词开头。
好:
def astype(dtype):
"""
Cast Series type.
This section will provide further details.
"""
pass
错误:
def astype(dtype):
"""
Casts Series type.
Verb in third-person of the present simple, should be infinitive.
"""
pass
def astype(dtype):
"""
Method to cast Series type.
Does not start with verb.
"""
pass
def astype(dtype):
"""
Cast Series type
Missing dot at the end.
"""
pass
def astype(dtype):
"""
Cast Series type from its current type to the new type defined in
the parameter dtype.
Summary is too verbose and doesn't fit in a single line.
"""
pass
第2节:扩展摘要#
扩展摘要提供了关于函数功能的详细信息。它不应涉及参数的细节,或讨论实现注记,这些内容应在其他部分讨论。
在简短摘要和扩展摘要之间留有一个空行。扩展摘要中的每个段落都以句号结尾。
扩展摘要应提供有关该函数为何有用及其使用场景的详细信息,如果不过于通用的话。
def unstack():
"""
Pivot a row index to columns.
When using a MultiIndex, a level can be pivoted so each value in
the index becomes a column. This is especially useful when a subindex
is repeated for the main index, and data is easier to visualize as a
pivot table.
The index level will be automatically removed from the index when added
as columns.
"""
pass
第3节:参数#
本节将添加参数的详细信息。本节标题为“参数”,后面跟着一行在单词“参数”每个字母下加连字符的行。在节标题前留一个空白行,但不在其后,也不在“参数”这个词和带连字符的行之间。
在标题之后,签名中的每个参数都必须记录,包括 *args
和 **kwargs
,但不包括 self
。
参数通过它们的名称定义,后面跟一个空格、一个冒号、另一个空格和类型(或多种类型)。注意名称和冒号之间的空格是重要的。类型没有为 *args
和 **kwargs
定义,但必须为所有其他参数定义。在参数定义之后,需要有一行带有参数描述的行,该行是缩进的,并且可以有多行。描述必须以大写字母开头,并以句号结束。
对于带有默认值的关键字参数,默认值将在类型的末尾用逗号列出。在这种情况下,类型的确切形式将是“int, default 0”。在某些情况下,解释默认参数的含义可能是有用的,这可以在逗号后添加“int, default -1, meaning all cpus”。
在默认值为 None
的情况下,这意味着该值将不会被使用。与其写 "str, default None"
,更倾向于写 "str, optional"
。当 None
是一个被使用的值时,我们会保留形式 “str, default None”。例如,在 df.to_csv(compression=None)
中,None
不是一个被使用的值,而是意味着压缩是可选的,如果不提供则不使用压缩。在这种情况下我们会使用 "str, optional"
。只有在像 func(value=None)
这样的情况,并且 None
以与 0
或 foo
相同的方式被使用时,我们才会指定 “str, int or None, default None”。
好:
class Series:
def plot(self, kind, color='blue', **kwargs):
"""
Generate a plot.
Render the data in the Series as a matplotlib plot of the
specified kind.
Parameters
----------
kind : str
Kind of matplotlib plot.
color : str, default 'blue'
Color name or rgb code.
**kwargs
These parameters will be passed to the matplotlib plotting
function.
"""
pass
错误:
class Series:
def plot(self, kind, **kwargs):
"""
Generate a plot.
Render the data in the Series as a matplotlib plot of the
specified kind.
Note the blank line between the parameters title and the first
parameter. Also, note that after the name of the parameter ``kind``
and before the colon, a space is missing.
Also, note that the parameter descriptions do not start with a
capital letter, and do not finish with a dot.
Finally, the ``**kwargs`` parameter is missing.
Parameters
----------
kind: str
kind of matplotlib plot
"""
pass
参数类型#
在指定参数类型时,可以直接使用 Python 内置数据类型(首选 Python 类型而不是更详细的字符串、整数、布尔等):
int
float
str
bool
对于复杂类型,定义子类型。对于 dict
和 tuple
,由于存在多种类型,我们使用括号来帮助阅读类型(dict
用花括号,tuple
用普通括号):
list of int
dict of {str : int}
tuple of (str, int, int)
元组 (str,)
set of str
如果只有一组允许的值,请将它们列在大括号中并用逗号(后跟一个空格)分隔。如果这些值是有序的并且有顺序,请按此顺序列出它们。否则,如果有默认值,请先列出默认值:
{0, 10, 25}
{‘simple’, ‘advanced’}
{‘低’, ‘中’, ‘高’}
{‘猫’, ‘狗’, ‘鸟’}
如果类型在 Python 模块中定义,则必须指定模块:
datetime.date
datetime.datetime
decimal.Decimal
如果类型在一个包中,模块也必须被指定:
numpy.ndarray
scipy.sparse.coo_matrix
如果类型是 pandas 类型,也需要指定 pandas,除了 Series 和 DataFrame 之外:
系列
DataFrame
pandas.Index
pandas.Categorical
pandas.arrays.SparseArray
如果确切的类型不相关,但必须与 NumPy 数组兼容,可以指定 array-like。如果接受任何可迭代类型,可以使用 iterable:
array-like
iterable
如果接受多种类型,请用逗号分隔它们,除了最后两种类型,它们需要用单词 ‘或’ 分隔:
int 或 float
float, decimal.Decimal 或 None
str 或 str 列表
如果 None
是接受的值之一,它总是需要列在最后。
对于轴,惯例是使用类似的东西:
axis : {0 或 ‘index’, 1 或 ‘columns’, None}, 默认 None
第4节:返回或产生#
如果该方法返回一个值,它将在此部分中记录。同样,如果该方法产生其输出。
章节的标题将以与“参数”相同的方式定义。名称可以是“返回”或“生成”,后面跟一行与前一个单词字母数相同的连字符。
返回值的文档也类似于参数。但在这种情况下,除非方法返回或生成多个值(值的元组),否则不会提供名称。
“Returns” 和 “Yields” 的类型与 “Parameters” 的类型相同。此外,描述必须以句号结尾。
例如,使用单个值:
def sample():
"""
Generate and return a random number.
The value is sampled from a continuous uniform distribution between
0 and 1.
Returns
-------
float
Random number generated.
"""
return np.random.random()
有多个值时:
import string
def random_letters():
"""
Generate and return a sequence of random letters.
The length of the returned string is also random, and is also
returned.
Returns
-------
length : int
Length of the returned string.
letters : str
String of random letters.
"""
length = np.random.randint(1, 10)
letters = ''.join(np.random.choice(string.ascii_lowercase)
for i in range(length))
return length, letters
如果该方法产生其值:
def sample_values():
"""
Generate an infinite sequence of random numbers.
The values are sampled from a continuous uniform distribution between
0 and 1.
Yields
------
float
Random number generated.
"""
while True:
yield np.random.random()
第5节:另请参见#
本节用于让用户了解与正在记录的功能相关的 pandas 功能。在极少数情况下,如果根本找不到相关的方法或函数,则可以跳过本节。
一个明显的例子是 head()
和 tail()
方法。由于 tail()
的作用与 head()
相同,但位于 Series
或 DataFrame
的末尾而不是开头,因此让用户了解这一点是很好的。
为了直观地了解可以被认为是相关的,这里有一些例子:
loc
和iloc
,它们做同样的事情,但在一种情况下提供索引,在另一种情况下提供位置max
和min
,因为它们做相反的事情iterrows
、itertuples
和items
,因为用户很容易在寻找遍历列的方法时,最终找到遍历行的方法,反之亦然。fillna
和dropna
,这两种方法都用于处理缺失值read_csv
和to_csv
,因为它们是互补的merge
和join
,因为一个是另一个的泛化astype
和pandas.to_datetime
,因为用户可能会阅读astype
的文档以了解如何转换为日期,而实现这一点的方法是使用pandas.to_datetime
where
与numpy.where
相关,因为它的功能基于它
在决定什么是相关的时候,你应该主要使用你的常识,并思考什么对阅读文档的用户有用,特别是那些经验较少的用户。
当涉及到其他库(主要是 numpy
)时,首先使用模块的名称(不是像 np
这样的别名)。如果函数在一个不是主模块的模块中,比如 scipy.sparse
,列出完整的模块(例如 scipy.sparse.coo_matrix
)。
本节有一个标题,”参见”(注意大写的S和A),后面是带有连字符的行,前面有一空行。
在标题之后,我们将为每个相关的方法或函数添加一行,后面跟一个空格、一个冒号、另一个空格和一个简短的描述,说明这个方法或函数的作用、为什么在这个上下文中相关,以及文档化函数与被引用函数之间的关键区别。描述也必须以句号结尾。
请注意,在“Returns”和“Yields”中,描述位于类型之后的行上。然而,在这一节中,它位于同一行,中间用冒号分隔。如果描述不适合同一行,它可以继续到其他行,这些行必须进一步缩进。
例如:
class Series:
def head(self):
"""
Return the first 5 elements of the Series.
This function is mainly useful to preview the values of the
Series without displaying the whole of it.
Returns
-------
Series
Subset of the original series with the 5 first values.
See Also
--------
Series.tail : Return the last 5 elements of the Series.
Series.iloc : Return a slice of the elements in the Series,
which can also be used to return the first or last n.
"""
return self.iloc[:5]
第6节:注释#
这是一个可选部分,用于记录关于算法实现或函数行为技术方面的注释。
除非你熟悉该算法的实现,或者在为该函数编写示例时发现了某些反直觉的行为,否则可以随意跳过。
本节遵循与扩展摘要部分相同的格式。
第7节:示例#
这是文档字符串中最重要的一部分,尽管它位于最后,因为通常人们通过例子比通过准确的解释更好地理解概念。
文档字符串中的示例,除了说明函数或方法的用法外,必须是有效的Python代码,能够以确定性的方式返回给定的输出,并且可以被用户复制和运行。
示例以 Python 终端会话的形式呈现。>>>
用于表示代码。...
用于表示从前一行继续的代码。输出紧跟在生成输出的代码的最后一行之后(中间没有空行)。描述示例的注释可以在它们之前和之后添加空行。
展示示例的方式如下:
导入所需的库(除了
numpy
和pandas
)创建示例所需的数据
展示一个非常基础的例子,这个例子展示了最常见的使用情况
添加带有解释的示例,说明如何使用参数来扩展功能
一个简单的例子可能是:
class Series:
def head(self, n=5):
"""
Return the first elements of the Series.
This function is mainly useful to preview the values of the
Series without displaying all of it.
Parameters
----------
n : int
Number of values to return.
Return
------
pandas.Series
Subset of the original series with the n first values.
See Also
--------
tail : Return the last n elements of the Series.
Examples
--------
>>> ser = pd.Series(['Ant', 'Bear', 'Cow', 'Dog', 'Falcon',
... 'Lion', 'Monkey', 'Rabbit', 'Zebra'])
>>> ser.head()
0 Ant
1 Bear
2 Cow
3 Dog
4 Falcon
dtype: object
With the ``n`` parameter, we can change the number of returned rows:
>>> ser.head(n=3)
0 Ant
1 Bear
2 Cow
dtype: object
"""
return self.iloc[:n]
示例应尽可能简洁。在函数复杂性需要长示例的情况下,建议使用带有粗体标题的块。使用双星号 **
使文本加粗,如 **这个示例**
。
示例的约定#
示例中的代码总是假设从以下两行开始,这两行未显示:
import numpy as np
import pandas as pd
在示例中使用的任何其他模块必须显式导入,每行一个(如 PEP 8#imports 中所推荐)并避免使用别名。避免过多的导入,但如果需要,标准库的导入放在首位,其次是第三方库(如 matplotlib)。
当用单个 Series
举例时,使用名称 ser
,如果是用单个 DataFrame
举例,使用名称 df
。对于索引,首选名称是 idx
。如果使用一组同质的 Series
或 DataFrame
,将它们命名为 ser1
, ser2
, ser3
… 或 df1
, df2
, df3
… 如果数据不是同质的,并且需要多个结构,将它们命名为有意义的名称,例如 df_main
和 df_to_join
。
示例中使用的数据应尽可能紧凑。建议的行数约为4行,但要使其成为对特定示例有意义的数字。例如,在 head
方法中,它需要大于5,以显示使用默认值的示例。如果计算 mean
,我们可以使用类似 [1, 2, 3]
的数据,这样很容易看出返回的值是平均值。
对于更复杂的示例(例如分组),避免使用未经解释的数据,如带有列A、B、C、D的随机数矩阵… 而应使用有意义的示例,这使得更容易理解概念。除非示例要求,否则使用动物名称,以保持示例的一致性。以及它们的数值属性。
调用方法时,关键字参数 head(n=3)
优于位置参数 head(3)
。
好:
class Series:
def mean(self):
"""
Compute the mean of the input.
Examples
--------
>>> ser = pd.Series([1, 2, 3])
>>> ser.mean()
2
"""
pass
def fillna(self, value):
"""
Replace missing values by ``value``.
Examples
--------
>>> ser = pd.Series([1, np.nan, 3])
>>> ser.fillna(0)
[1, 0, 3]
"""
pass
def groupby_mean(self):
"""
Group by index and return mean.
Examples
--------
>>> ser = pd.Series([380., 370., 24., 26],
... name='max_speed',
... index=['falcon', 'falcon', 'parrot', 'parrot'])
>>> ser.groupby_mean()
index
falcon 375.0
parrot 25.0
Name: max_speed, dtype: float64
"""
pass
def contains(self, pattern, case_sensitive=True, na=numpy.nan):
"""
Return whether each value contains ``pattern``.
In this case, we are illustrating how to use sections, even
if the example is simple enough and does not require them.
Examples
--------
>>> ser = pd.Series('Antelope', 'Lion', 'Zebra', np.nan)
>>> ser.contains(pattern='a')
0 False
1 False
2 True
3 NaN
dtype: bool
**Case sensitivity**
With ``case_sensitive`` set to ``False`` we can match ``a`` with both
``a`` and ``A``:
>>> s.contains(pattern='a', case_sensitive=False)
0 True
1 False
2 True
3 NaN
dtype: bool
**Missing values**
We can fill missing values in the output using the ``na`` parameter:
>>> ser.contains(pattern='a', na=False)
0 False
1 False
2 True
3 False
dtype: bool
"""
pass
错误:
def method(foo=None, bar=None):
"""
A sample DataFrame method.
Do not import NumPy and pandas.
Try to use meaningful data, when it makes the example easier
to understand.
Try to avoid positional arguments like in ``df.method(1)``. They
can be all right if previously defined with a meaningful name,
like in ``present_value(interest_rate)``, but avoid them otherwise.
When presenting the behavior with different parameters, do not place
all the calls one next to the other. Instead, add a short sentence
explaining what the example shows.
Examples
--------
>>> import numpy as np
>>> import pandas as pd
>>> df = pd.DataFrame(np.random.randn(3, 3),
... columns=('a', 'b', 'c'))
>>> df.method(1)
21
>>> df.method(bar=14)
123
"""
pass
关于使您的示例通过 doctests 的提示#
在验证脚本中通过doctests的示例有时可能会很棘手。以下是一些需要注意的点:
导入所有需要的库(除了 pandas 和 NumPy,这些已经作为
import pandas as pd
和import numpy as np
导入)并定义你在示例中使用的所有变量。尽量避免使用随机数据。然而,在某些情况下,随机数据可能是可以接受的,例如,如果您正在记录的函数涉及概率分布,或者使函数结果有意义所需的数据量太大,以至于手动创建非常麻烦。在这些情况下,始终使用固定的随机种子,以使生成的示例可预测。例如:
>>> np.random.seed(42) >>> df = pd.DataFrame({'normal': np.random.normal(100, 5, 20)})
如果你有一个多行代码片段,你需要在续行上使用 ‘…’::
>>> df = pd.DataFrame([[1, 2, 3], [4, 5, 6]], index=['a', 'b', 'c'], ... columns=['A', 'B'])
如果你想展示一个引发异常的案例,你可以这样做:
>>> pd.to_datetime(["712-01-01"]) Traceback (most recent call last): OutOfBoundsDatetime: Out of bounds nanosecond timestamp: 712-01-01 00:00:00
包含“Traceback (most recent call last):”是必要的,但对于实际错误,只需错误名称就足够了。
如果结果的一小部分可以变化(例如对象表示中的哈希),你可以使用
...
来表示这部分。如果你想展示
s.plot()
返回一个 matplotlib AxesSubplot 对象,这将导致 doctest 失败>>> s.plot() <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x7efd0c0b0690>
然而,你可以这样做(注意需要添加的注释)
>>> s.plot() <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at ...>
示例中的图表#
在 pandas 中有一些方法返回图表。为了在文档中呈现由示例生成的图表,存在 .. plot::
指令。
要使用它,请将以下代码放在“示例”标题之后,如下所示。构建文档时,图表将自动生成。
class Series:
def plot(self):
"""
Generate a plot with the ``Series`` data.
Examples
--------
.. plot::
:context: close-figs
>>> ser = pd.Series([1, 2, 3])
>>> ser.plot()
"""
pass