数组接口协议#
备注
本页描述了从其他C扩展访问NumPy数组内容的NumPy特定API.:pep:3118 – 修订后的缓冲协议
为Python 2.6和3.0引入了类似的、标准化的API,供任何扩展模块使用.Cython__的缓冲数组支持使用:pep:3118 API;请参阅`Cython NumPy教程`__.Cython提供了一种编写支持缓冲协议代码的方法,适用于早于2.6的Python版本,因为它利用了此处描述的数组接口实现了向后兼容的实现.
- 版本:
3
数组接口(有时称为数组协议)创建于2005年,作为一种使类似数组的Python对象在可能的情况下智能地重用彼此的数据缓冲区的手段.同构N维数组接口是对象共享N维数组内存和信息的默认机制.该接口由使用两个属性的Python端和C端组成.希望被视为应用程序代码中的N维数组的对象应至少支持这些属性之一.希望在应用程序代码中支持N维数组的对象应至少查找这些属性之一,并适当地使用所提供的信息.
这个接口描述了同质数组,即数组中的每个元素具有相同的”类型”.这种类型可以非常简单,也可以是相当任意且复杂的类C结构.
使用接口有两种方式:Python 端和 C 端.两者是独立的属性.
Python 端#
这种接口方法包括对象具有一个 __array_interface__
属性.
- object.__array_interface__#
一个包含项目(3个必需和5个可选)的字典.字典中的可选键如果没有提供,则有隐含的默认值.
键是:
- shape (required)
其元素是每个维度中数组大小的元组.每个条目是一个整数(Python
int
).请注意,这些整数可能大于平台int
或long
所能容纳的大小(Pythonint
是 Clong
).使用此属性的代码需要适当处理这个问题;要么在可能溢出时引发错误,要么使用long long
作为形状的 C 类型.- typestr (required)
一个提供同构数组基本类型的字符串 基本字符串格式由3部分组成:一个描述数据字节顺序的字符(
<
:小端序,``>``:大端序,``|``:不相关),一个给出数组基本类型的字符代码,以及一个提供该类型使用字节数的整数.基本类型字符代码是:
- descr (optional)
一个元组列表,为同质数组中的每个项目提供更详细的内存布局描述.列表中的每个元组有两个或三个元素.通常,当 typestr 是
V[0-9]+
时会使用此属性,但这不是必需的.唯一的要求是 typestr 键中表示的字节数与此处表示的总字节数相同.这个想法是为了支持描述构成数组元素的类似C结构.列表中每个元组的元素是一个提供与数据类型这一部分相关联名称的字符串.这也可以是一个
('全名', '基本_名称')
的元组,其中基本名称将是一个表示字段全名的有效 Python 变量名.要么是一个基本类型的描述字符串,如 typestr,要么是另一个列表(用于嵌套结构类型)
一个可选的形状元组,提供该结构部分应重复的次数.如果没有给出,则假定没有重复.使用这个通用接口可以描述非常复杂的结构.但是请注意,数组的每个元素仍然是相同的数据类型.下面给出了使用此接口的一些示例.
Default:
[('', typestr)]
- data (optional)
一个2元组,其第一个参数是一个指向存储数组内容的内存区域的 Python 整数.
备注
当通过
PyLong_From*
或如 Cython 或 pybind11 这样的高级绑定从 C/C++ 转换时,确保使用足够大位数的整数.这个指针必须指向数据的第一个元素(换句话说,在这种情况下任何偏移量总是被忽略).元组中的第二个条目是一个只读标志(true 表示数据区域是只读的).
这个属性也可以是一个暴露 缓冲接口 的对象,该对象将被用来共享数据.如果这个键不存在(或返回 None),那么将通过对象本身的缓冲接口进行内存共享.在这种情况下,可以使用偏移键来指示缓冲区的起始位置.如果需要确保内存区域的安全,必须存储暴露数组接口的对象的引用.
Default:
None
- strides (optional)
要么
None
表示一个 C 风格的连续数组,要么是一个步长元组,该元组提供了在相应维度中跳到下一个数组元素所需的字节数.每个条目必须是一个整数(一个 Pythonint
).与形状一样,这些值可能大于可以用 Cint
或long
表示的值;调用代码应适当处理,要么引发错误,要么在 C 中使用long long
.默认值是None
,这意味着一个 C 风格的连续内存缓冲区.在这个模型中,数组的最后一个维度变化最快.例如,对于一个数组条目为 8 字节长且形状为(10, 20, 30)
的对象,默认的步长元组将是(4800, 240, 8)
.默认:
None
(C-style 连续)- mask (optional)
None
或一个暴露数组接口的对象.掩码数组的所有元素应仅解释为真或非真,指示此数组的哪些元素是有效的.此对象的形状应为 “可广播” 到原始数组的形状.默认:
None
(所有数组值都是有效的)- offset (optional)
数组数据区域中的一个整数偏移量.这只能在数据为
None
或返回一个memoryview
对象时使用.Default:
0
.- version (required)
一个显示接口版本的整数(例如,此版本为3).请注意不要使用此项来使暴露未来版本接口的对象失效.
C-结构体访问#
这种数组接口的方法允许通过仅一次属性查找和一个定义良好的C结构来更快地访问数组.
- object.__array_struct__#
一个
PyCapsule
,其pointer
成员包含指向一个已填充的PyArrayInterface
结构的指针.该结构的内存是动态创建的,并且PyCapsule
也使用适当的析构函数创建,因此此属性的检索者只需在完成后对该属性返回的对象应用Py_DECREF
即可.此外,数据需要被复制出来,或者必须持有暴露此属性的对象的引用,以确保数据不会被释放.暴露__array_struct__
接口的对象在其他对象引用它们时也必须不重新分配它们的内存.
PyArrayInterface
结构体在 numpy/ndarrayobject.h
中定义为:
typedef struct {
int two; /* contains the integer 2 -- simple sanity check */
int nd; /* number of dimensions */
char typekind; /* kind in array --- character code of typestr */
int itemsize; /* size of each element */
int flags; /* flags indicating how the data should be interpreted */
/* must set ARR_HAS_DESCR bit to validate descr */
Py_ssize_t *shape; /* A length-nd array of shape information */
Py_ssize_t *strides; /* A length-nd array of stride information */
void *data; /* A pointer to the first element of the array */
PyObject *descr; /* NULL or data-description (same as descr key
of __array_interface__) -- must set ARR_HAS_DESCR
flag or this will be ignored. */
} PyArrayInterface;
flags 成员可能由 5 位组成,显示数据应如何解释,以及 1 位显示接口应如何解释.数据位是 NPY_ARRAY_C_CONTIGUOUS
(0x1), NPY_ARRAY_F_CONTIGUOUS
(0x2), NPY_ARRAY_ALIGNED
(0x100), NPY_ARRAY_NOTSWAPPED
(0x200), 和 NPY_ARRAY_WRITEABLE
(0x400).一个最终标志 NPY_ARR_HAS_DESCR
(0x800) 指示此结构是否有 arrdescr 字段.除非存在此标志,否则不应访问该字段.
-
NPY_ARR_HAS_DESCR#
自2006年6月16日新增:
在过去,大多数实现使用 PyCObject``(现在是 :c:type:`PyCapsule`)本身的 ``desc
成员(不要将这与上面 PyArrayInterface
结构的”descr”成员混淆——它们是两件不同的事情)来保存指向暴露接口的对象的指针.这现在是接口的一个显式部分.确保在返回 PyCapsule
之前获取对象的引用并调用 PyCapsule_SetContext
,并配置一个析构函数来减少此引用的引用计数.
备注
__array_struct__
被认为是遗留的,不应该在新代码中使用.请使用 缓冲协议 或 DLPack 协议 numpy.from_dlpack
代替.
类型描述示例#
为了清晰起见,提供一些类型描述和相应的 __array_interface__
‘descr’ 条目的示例是有用的.感谢 Scott Gilbert 提供的这些示例:
在每种情况下,’descr’ 键是可选的,但它当然提供了更多信息,这些信息对于各种应用程序可能很重要:
* Float data
typestr == '>f4'
descr == [('','>f4')]
* Complex double
typestr == '>c8'
descr == [('real','>f4'), ('imag','>f4')]
* RGB Pixel data
typestr == '|V3'
descr == [('r','|u1'), ('g','|u1'), ('b','|u1')]
* Mixed endian (weird but could happen).
typestr == '|V8' (or '>u8')
descr == [('big','>i4'), ('little','<i4')]
* Nested structure
struct {
int ival;
struct {
unsigned short sval;
unsigned char bval;
unsigned char cval;
} sub;
}
typestr == '|V8' (or '<u8' if you want)
descr == [('ival','<i4'), ('sub', [('sval','<u2'), ('bval','|u1'), ('cval','|u1') ]) ]
* Nested array
struct {
int ival;
double data[16*4];
}
typestr == '|V516'
descr == [('ival','>i4'), ('data','>f8',(16,4))]
* Padded structure
struct {
int ival;
double dval;
}
typestr == '|V16'
descr == [('ival','>i4'),('','|V4'),('dval','>f8')]
应该清楚的是,任何结构化类型都可以使用此接口进行描述.
与数组接口的差异(版本2)#
版本2接口非常相似.主要区别在于美学方面.特别是:
PyArrayInterface 结构在最后没有 descr 成员(因此没有标志 ARR_HAS_DESCR)
从
__array_struct__
返回的PyCapsule
的context
成员(正式来说是PyCObject
的desc
成员)未指定.通常,它是暴露数组的对象(以便可以保留对其的引用并在销毁 C 对象时销毁).现在明确要求以某种方式使用此字段来保留对所属对象的引用.备注
直到2020年8月,这说的是:
现在它必须是一个元组,其第一个元素是一个包含”PyArrayInterface 版本 #”的字符串,第二个元素是暴露数组的对象.
这个设计在提出后几乎立即被撤回,详见 <https://mail.python.org/pipermail/numpy-discussion/2006-June/020995.html>.尽管有14年的文档与此相反,但在任何时候都不应该假设
__array_interface__
胶囊持有这个元组内容.从
__array_interface__['data']
返回的元组过去是一个十六进制字符串(现在它是一个整数或长整数).没有
__array_interface__
属性,而是__array_interface__
字典中的所有键(除了版本)都是它们自己的属性:因此,要获取 Python 端的信息,你必须分别访问这些属性:__array_data__
__array_shape__
__array_strides__
__array_typestr__
__array_descr__
__array_offset__
__array_mask__