scipy.cluster.hierarchy.

maxinconsts#

scipy.cluster.hierarchy.maxinconsts(Z, R)[源代码][源代码]#

返回每个非单例簇及其子簇的最大不一致系数。

参数:
Zndarray

编码为矩阵的层次聚类。更多信息请参见 linkage

Rndarray

不一致矩阵。

返回:
MIndarray

一个单调的 (n-1) 大小的双精度 numpy 数组。

参见

linkage

关于什么是连接矩阵的描述。

inconsistent

用于创建不一致矩阵。

示例

>>> from scipy.cluster.hierarchy import median, inconsistent, maxinconsts
>>> from scipy.spatial.distance import pdist

给定一个数据集 X,我们可以应用聚类方法来获得一个链接矩阵 Zscipy.cluster.hierarchy.inconsistent 也可以用来获得与此聚类过程相关的不一致矩阵 R

>>> X = [[0, 0], [0, 1], [1, 0],
...      [0, 4], [0, 3], [1, 4],
...      [4, 0], [3, 0], [4, 1],
...      [4, 4], [3, 4], [4, 3]]
>>> Z = median(pdist(X))
>>> R = inconsistent(Z)
>>> Z
array([[ 0.        ,  1.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 3.        ,  4.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 9.        , 10.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 6.        ,  7.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 2.        , 12.        ,  1.11803399,  3.        ],
       [ 5.        , 13.        ,  1.11803399,  3.        ],
       [ 8.        , 15.        ,  1.11803399,  3.        ],
       [11.        , 14.        ,  1.11803399,  3.        ],
       [18.        , 19.        ,  3.        ,  6.        ],
       [16.        , 17.        ,  3.5       ,  6.        ],
       [20.        , 21.        ,  3.25      , 12.        ]])
>>> R
array([[1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.74535599, 1.08655358, 3.        , 1.15470054],
       [1.91202266, 1.37522872, 3.        , 1.15470054],
       [3.25      , 0.25      , 3.        , 0.        ]])

在这里,scipy.cluster.hierarchy.maxinconsts 可以用来计算每个非单一簇及其子簇的不一致统计量(R 的最后一列)的最大值:

>>> maxinconsts(Z, R)
array([0.        , 0.        , 0.        , 0.        , 0.70710678,
       0.70710678, 0.70710678, 0.70710678, 1.15470054, 1.15470054,
       1.15470054])