scipy.ndimage.
distance_transform_edt#
- scipy.ndimage.distance_transform_edt(input, sampling=None, return_distances=True, return_indices=False, distances=None, indices=None)[源代码][源代码]#
精确的欧几里得距离变换。
此函数通过将每个前景(非零)元素替换为其到背景(任意零值元素)的最短距离,来计算 input 的距离变换。
除了距离变换外,还可以计算特征变换。在这种情况下,每个前景元素到最近背景元素的索引将在一个单独的数组中返回。
- 参数:
- 输入array_like
要转换的输入数据。可以是任何类型,但将被转换为二进制:输入为True的地方转换为1,其他地方转换为0。
- 采样float, 或 float 序列, 可选
每个维度上元素的间距。如果是一个序列,长度必须等于输入的秩;如果是一个单一的数字,这个数字将用于所有轴。如果没有指定,则默认间距为1。
- return_distancesbool, 可选
是否计算距离变换。默认值为 True。
- 返回索引bool, 可选
是否计算特征变换。默认是 False。
- 距离float64 ndarray,可选
一个用于存储计算出的距离变换的输出数组,而不是返回它。return_distances 必须为 True。它的形状必须与 input 相同。
- 索引int32 ndarray,可选
一个用于存储计算特征变换的输出数组,而不是返回它。return_indicies 必须为 True。其形状必须为 (input.ndim,) + input.shape。
- 返回:
- 距离float64 ndarray,可选
计算得到的距离变换。仅当 return_distances 为 True 且 distances 未提供时返回。其形状将与输入数组相同。
- 索引int32 ndarray,可选
计算的特征变换。它为输入的每个维度都有一个输入形状的数组。请参见下面的示例。仅当 return_indices 为 True 且 indices 未提供时返回。
注释
欧几里得距离变换给出欧几里得距离的值:
n y_i = sqrt(sum (x[i]-b[i])**2) i
其中 b[i] 是与输入点 x[i] 具有最小欧几里得距离的背景点(值为0),n 是维度的数量。
示例
>>> from scipy import ndimage >>> import numpy as np >>> a = np.array(([0,1,1,1,1], ... [0,0,1,1,1], ... [0,1,1,1,1], ... [0,1,1,1,0], ... [0,1,1,0,0])) >>> ndimage.distance_transform_edt(a) array([[ 0. , 1. , 1.4142, 2.2361, 3. ], [ 0. , 0. , 1. , 2. , 2. ], [ 0. , 1. , 1.4142, 1.4142, 1. ], [ 0. , 1. , 1.4142, 1. , 0. ], [ 0. , 1. , 1. , 0. , 0. ]])
在 x 方向采样 2 个单位,y 方向采样 1 个单位:
>>> ndimage.distance_transform_edt(a, sampling=[2,1]) array([[ 0. , 1. , 2. , 2.8284, 3.6056], [ 0. , 0. , 1. , 2. , 3. ], [ 0. , 1. , 2. , 2.2361, 2. ], [ 0. , 1. , 2. , 1. , 0. ], [ 0. , 1. , 1. , 0. , 0. ]])
同时请求索引:
>>> edt, inds = ndimage.distance_transform_edt(a, return_indices=True) >>> inds array([[[0, 0, 1, 1, 3], [1, 1, 1, 1, 3], [2, 2, 1, 3, 3], [3, 3, 4, 4, 3], [4, 4, 4, 4, 4]], [[0, 0, 1, 1, 4], [0, 1, 1, 1, 4], [0, 0, 1, 4, 4], [0, 0, 3, 3, 4], [0, 0, 3, 3, 4]]])
使用数组提供就地输出:
>>> indices = np.zeros(((np.ndim(a),) + a.shape), dtype=np.int32) >>> ndimage.distance_transform_edt(a, return_indices=True, indices=indices) array([[ 0. , 1. , 1.4142, 2.2361, 3. ], [ 0. , 0. , 1. , 2. , 2. ], [ 0. , 1. , 1.4142, 1.4142, 1. ], [ 0. , 1. , 1.4142, 1. , 0. ], [ 0. , 1. , 1. , 0. , 0. ]]) >>> indices array([[[0, 0, 1, 1, 3], [1, 1, 1, 1, 3], [2, 2, 1, 3, 3], [3, 3, 4, 4, 3], [4, 4, 4, 4, 4]], [[0, 0, 1, 1, 4], [0, 1, 1, 1, 4], [0, 0, 1, 4, 4], [0, 0, 3, 3, 4], [0, 0, 3, 3, 4]]])