coo_matrix#
- class scipy.sparse.coo_matrix(arg1, shape=None, dtype=None, copy=False)[源代码][源代码]#
COOrdinate 格式的稀疏矩阵。
也称为 ‘ijv’ 或 ‘三元组’ 格式。
- 这可以通过几种方式实例化:
- coo_matrix(D)
其中 D 是一个 2-D ndarray
- coo_matrix(S)
与另一个稀疏数组或矩阵 S 一起使用(相当于 S.tocoo())
- coo_matrix((M, N), [dtype])
构造一个形状为 (M, N) 的空矩阵,dtype 是可选的,默认为 dtype=’d’。
- coo_matrix((data, (i, j)), [shape=(M, N)])
- 从三个数组构建:
data[:] 矩阵的条目,顺序不限
i[:] 矩阵条目的行索引
j[:] 矩阵条目的列索引
其中
A[i[k], j[k]] = data[k]
。 当未指定形状时,它从索引数组中推断出来。
- 属性:
方法
__len__
()__mul__
(other)arcsin
()逐元素反正弦。
arcsinh
()逐元素的反双曲正弦函数。
arctan
()逐元素计算反正切。
arctanh
()逐元素计算反双曲正切。
argmax
([axis, out])返回沿某个轴的最大元素的索引。
argmin
([axis, out])返回沿某个轴的最小元素的索引。
asformat
(format[, copy])以传递的格式返回此数组/矩阵。
asfptype
()将矩阵向上转换为浮点格式(如果需要)
astype
(dtype[, casting, copy])将数组/矩阵元素转换为指定类型。
ceil
()逐元素向上取整。
conj
([copy])逐元素复共轭。
conjugate
([copy])逐元素复共轭。
copy
()返回此数组/矩阵的副本。
非零条目的数量,相当于
deg2rad
()逐元素的度到弧度转换。
diagonal
([k])返回数组/矩阵的第 k 个对角线。
dot
(other)普通点积
从数组/矩阵中移除零项
expm1
()逐元素计算 expm1。
floor
()逐元素取整。
getH
()返回此矩阵的厄米转置。
获取矩阵的形状
getcol
(j)返回矩阵的第 j 列的副本,作为一个 (m x 1) 的稀疏矩阵(列向量)。
矩阵存储格式
打印时显示的最大元素数量。
getnnz
([axis])存储值的数量,包括显式零。
getrow
(i)返回矩阵第 i 行的副本,作为一个 (1 x n) 的稀疏矩阵(行向量)。
log1p
()逐元素计算 log1p。
max
([axis, out])返回数组/矩阵的最大值或沿某个轴的最大值。
maximum
(other)此数组/矩阵与另一个数组/矩阵之间的逐元素最大值。
mean
([axis, dtype, out])计算指定轴上的算术平均值。
min
([axis, out])返回数组/矩阵的最小值或沿轴的最大值。
minimum
(other)此数组/矩阵与另一个数组/矩阵之间的逐元素最小值。
multiply
(other)逐点乘以另一个数组/矩阵。
nanmax
([axis, out])返回数组/矩阵的最大值或沿轴的最大值,忽略任何 NaN。
nanmin
([axis, out])返回数组/矩阵的最小值或沿轴的最小值,忽略任何 NaN。
nonzero
()数组/矩阵的非零索引。
power
(n[, dtype])此函数执行逐元素幂运算。
rad2deg
()逐元素的 rad2deg 转换。
reshape
(self, shape[, order, copy])在不改变其数据的情况下,给稀疏数组/矩阵赋予一个新的形状。
resize
(*shape)将数组/矩阵就地调整为
shape
给定的尺寸rint
()逐元素取整。
set_shape
(shape)就地设置矩阵的形状
setdiag
(values[, k])设置数组/矩阵的对角线或非对角线元素。
sign
()逐元素符号。
sin
()逐元素正弦。
sinh
()逐元素的双曲正弦函数。
sqrt
()逐元素平方根。
sum
([axis, dtype, out])对数组/矩阵元素沿指定轴求和。
通过将它们相加来消除重复条目
tan
()逐元素的 tan 函数。
tanh
()逐元素 tanh。
toarray
([order, out])返回此稀疏数组/矩阵的密集 ndarray 表示形式。
tobsr
([blocksize, copy])将此数组/矩阵转换为块稀疏行格式。
tocoo
([copy])将此数组/矩阵转换为 COOrdinate 格式。
tocsc
([copy])将此数组/矩阵转换为压缩稀疏列格式
tocsr
([copy])将此数组/矩阵转换为压缩稀疏行格式
todense
([order, out])返回此稀疏数组/矩阵的密集表示。
todia
([copy])将此数组/矩阵转换为稀疏对角格式。
todok
([copy])将此数组/矩阵转换为字典键格式。
tolil
([copy])将此数组/矩阵转换为列表的列表格式。
trace
([offset])返回稀疏数组/矩阵对角线上的和。
transpose
([axes, copy])反转稀疏数组/矩阵的维度。
trunc
()逐元素截断。
注释
稀疏矩阵可以用于算术运算:它们支持加法、减法、乘法、除法和矩阵幂运算。
- COO 格式的优势
促进稀疏格式之间的快速转换
允许重复条目(见示例)
非常快速的 CSR/CSC 格式转换
- COO 格式的缺点
- 不直接支持:
算术运算
切片
- 预期用途
COO 是一种用于构建稀疏矩阵的快速格式
一旦构建了COO矩阵,将其转换为CSR或CSC格式以进行快速算术和矩阵向量运算。
默认情况下,在转换为CSR或CSC格式时,重复的(i,j)条目将被累加在一起。这有助于高效构建有限元矩阵等。(见示例)
- 标准格式
按行排序的条目和坐标,然后按列排序。
没有重复的条目(即重复的 (i,j) 位置)
数据数组可以有显式零值。
示例
>>> # Constructing an empty matrix >>> import numpy as np >>> from scipy.sparse import coo_matrix >>> coo_matrix((3, 4), dtype=np.int8).toarray() array([[0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 0]], dtype=int8)
>>> # Constructing a matrix using ijv format >>> row = np.array([0, 3, 1, 0]) >>> col = np.array([0, 3, 1, 2]) >>> data = np.array([4, 5, 7, 9]) >>> coo_matrix((data, (row, col)), shape=(4, 4)).toarray() array([[4, 0, 9, 0], [0, 7, 0, 0], [0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 5]])
>>> # Constructing a matrix with duplicate coordinates >>> row = np.array([0, 0, 1, 3, 1, 0, 0]) >>> col = np.array([0, 2, 1, 3, 1, 0, 0]) >>> data = np.array([1, 1, 1, 1, 1, 1, 1]) >>> coo = coo_matrix((data, (row, col)), shape=(4, 4)) >>> # Duplicate coordinates are maintained until implicitly or explicitly summed >>> np.max(coo.data) 1 >>> coo.toarray() array([[3, 0, 1, 0], [0, 2, 0, 0], [0, 0, 0, 0], [0, 0, 0, 1]])