与 SAS 的比较#
对于来自 SAS 的潜在用户,本页面旨在展示如何在 pandas 中执行不同的 SAS 操作。
如果你是pandas的新手,你可能想先阅读 10分钟入门pandas 以熟悉这个库。
按照惯例,我们导入 pandas 和 NumPy 如下:
In [1]: import pandas as pd
In [2]: import numpy as np
数据结构#
通用术语翻译#
pandas |
SAS |
---|---|
|
数据集 |
column |
变量 |
行 |
observation |
groupby |
BY-组 |
|
|
DataFrame
#
在 pandas 中的 DataFrame
类似于 SAS 数据集 - 一个带有标签列的二维数据源,这些列可以是不同类型的。正如本文档所示,几乎可以使用 SAS 的 DATA
步骤应用于数据集的任何操作,也可以在 pandas 中完成。
Series
#
Series
是表示 DataFrame
一列的数据结构。SAS 没有单独的数据结构用于单列,但一般来说,使用 Series
类似于在 DATA
步骤中引用一列。
Index
#
每个 DataFrame
和 Series
都有一个 Index
- 这是数据 行 上的标签。SAS 没有完全类似的概念。数据集的行本质上是无标签的,除了在 DATA
步骤中可以访问的隐式整数索引 (_N_
)。
在 pandas 中,如果没有指定索引,默认也会使用整数索引(第一行 = 0,第二行 = 1,依此类推)。虽然使用带标签的 Index
或 MultiIndex
可以启用复杂的分析,并且最终是理解 pandas 的重要部分,但对于这个比较,我们将基本上忽略 Index
,只是将 DataFrame
视为列的集合。请参阅 索引文档 以了解更多关于如何有效使用 Index
的信息。
复制 vs. 就地操作#
大多数 pandas 操作返回 Series
/DataFrame
的副本。要使更改生效,你需要将其分配给一个新变量:
sorted_df = df.sort_values("col1")
或者覆盖原始的那个:
df = df.sort_values("col1")
备注
你将会看到一些方法中可用的 inplace=True
或 copy=False
关键字参数:
df.replace(5, inplace=True)
关于弃用和移除大多数方法(例如 dropna
)中的 inplace
和 copy
的讨论正在进行中,除了极少数方法(包括 replace
)。在写入时复制(Copy-on-Write)的上下文中,这两个关键字将不再必要。提案可以在这里找到 here。
数据输入 / 输出#
从值构建一个DataFrame#
可以通过在 datalines
语句后放置数据并指定列名来构建一个 SAS 数据集。
data df;
input x y;
datalines;
1 2
3 4
5 6
;
run;
一个 pandas DataFrame
可以通过许多不同的方式构建,但对于少量值,通常将其指定为 Python 字典会很方便,其中键是列名,值是数据。
In [1]: df = pd.DataFrame({"x": [1, 3, 5], "y": [2, 4, 6]})
In [2]: df
Out[2]:
x y
0 1 2
1 3 4
2 5 6
读取外部数据#
像 SAS 一样,pandas 提供了从多种格式读取数据的工具。tips
数据集,在 pandas 测试中找到(csv),将在以下许多示例中使用。
SAS 提供了 PROC IMPORT
来将 csv 数据读入数据集。
proc import datafile='tips.csv' dbms=csv out=tips replace;
getnames=yes;
run;
pandas 方法是 read_csv()
,其工作方式类似。
In [3]: url = (
...: "https://raw.githubusercontent.com/pandas-dev/"
...: "pandas/main/pandas/tests/io/data/csv/tips.csv"
...: )
...:
In [4]: tips = pd.read_csv(url)
In [5]: tips
Out[5]:
total_bill tip sex smoker day time size
0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
1 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 3
2 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
.. ... ... ... ... ... ... ...
239 29.03 5.92 Male No Sat Dinner 3
240 27.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2
241 22.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2
242 17.82 1.75 Male No Sat Dinner 2
243 18.78 3.00 Female No Thur Dinner 2
[244 rows x 7 columns]
像 PROC IMPORT
一样,read_csv
可以接受许多参数来指定数据应如何解析。例如,如果数据是制表符分隔的,并且没有列名,pandas 命令将是:
tips = pd.read_csv("tips.csv", sep="\t", header=None)
# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimiter
tips = pd.read_table("tips.csv", header=None)
除了 text/csv 之外,pandas 还支持多种其他数据格式,如 Excel、HDF5 和 SQL 数据库。这些都通过 pd.read_*
函数读取。更多详情请参见 IO 文档。
限制输出#
默认情况下,pandas 会截断大型 DataFrame
的输出,以显示首尾行。这可以通过 更改 pandas 选项 来覆盖,或者使用 DataFrame.head()
或 DataFrame.tail()
。
In [1]: tips.head(5)
Out[1]:
total_bill tip sex smoker day time size
0 16.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
1 10.34 1.66 Male No Sun Dinner 3
2 21.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 23.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 24.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
在 SAS 中相当于:
proc print data=df(obs=5);
run;
导出数据#
在 SAS 中,PROC IMPORT
的逆操作是 PROC EXPORT
proc export data=tips outfile='tips2.csv' dbms=csv;
run;
同样在 pandas 中,read_csv
的反向操作是 to_csv()
,其他数据格式遵循类似的 api。
tips.to_csv("tips2.csv")
数据操作#
列上的操作#
在 DATA
步骤中,可以在新列或现有列上使用任意数学表达式。
data tips;
set tips;
total_bill = total_bill - 2;
new_bill = total_bill / 2;
run;
pandas 通过在 DataFrame
中指定单个 Series
来提供矢量化操作。新列可以以相同的方式分配。DataFrame.drop()
方法从 DataFrame
中删除一列。
In [1]: tips["total_bill"] = tips["total_bill"] - 2
In [2]: tips["new_bill"] = tips["total_bill"] / 2
In [3]: tips
Out[3]:
total_bill tip sex smoker day time size new_bill
0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 7.495
1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 4.170
2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 9.505
3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 10.840
4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 11.295
.. ... ... ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 Male No Sat Dinner 3 13.515
240 25.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2 12.590
241 20.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2 10.335
242 15.82 1.75 Male No Sat Dinner 2 7.910
243 16.78 3.00 Female No Thur Dinner 2 8.390
[244 rows x 8 columns]
In [4]: tips = tips.drop("new_bill", axis=1)
过滤#
在 SAS 中,过滤是通过 if
或 where
语句在一列或多列上完成的。
data tips;
set tips;
if total_bill > 10;
run;
data tips;
set tips;
where total_bill > 10;
/* equivalent in this case - where happens before the
DATA step begins and can also be used in PROC statements */
run;
DataFrame 可以通过多种方式进行过滤;其中最直观的方法是使用 布尔索引。
In [1]: tips[tips["total_bill"] > 10]
Out[1]:
total_bill tip sex smoker day time size
0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
5 23.29 4.71 Male No Sun Dinner 4
.. ... ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 Male No Sat Dinner 3
240 25.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2
241 20.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2
242 15.82 1.75 Male No Sat Dinner 2
243 16.78 3.00 Female No Thur Dinner 2
[204 rows x 7 columns]
上述语句只是将一个 True
/False
对象的 Series
传递给 DataFrame,返回所有 True
的行。
In [2]: is_dinner = tips["time"] == "Dinner"
In [3]: is_dinner
Out[3]:
0 True
1 True
2 True
3 True
4 True
...
239 True
240 True
241 True
242 True
243 True
Name: time, Length: 244, dtype: bool
In [4]: is_dinner.value_counts()
Out[4]:
time
True 176
False 68
Name: count, dtype: int64
In [5]: tips[is_dinner]
Out[5]:
total_bill tip sex smoker day time size
0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3
2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
.. ... ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 Male No Sat Dinner 3
240 25.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2
241 20.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2
242 15.82 1.75 Male No Sat Dinner 2
243 16.78 3.00 Female No Thur Dinner 2
[176 rows x 7 columns]
如果/那么 逻辑#
在 SAS 中,可以使用 if/then 逻辑来创建新列。
data tips;
set tips;
format bucket $4.;
if total_bill < 10 then bucket = 'low';
else bucket = 'high';
run;
在 pandas 中相同的操作可以使用 numpy
的 where
方法来完成。
In [1]: tips["bucket"] = np.where(tips["total_bill"] < 10, "low", "high")
In [2]: tips
Out[2]:
total_bill tip sex smoker day time size bucket
0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2 high
1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3 low
2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3 high
3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2 high
4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4 high
.. ... ... ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 Male No Sat Dinner 3 high
240 25.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2 high
241 20.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2 high
242 15.82 1.75 Male No Sat Dinner 2 high
243 16.78 3.00 Female No Thur Dinner 2 high
[244 rows x 8 columns]
日期功能#
SAS 提供了多种函数来对日期/时间列进行操作。
data tips;
set tips;
format date1 date2 date1_plusmonth mmddyy10.;
date1 = mdy(1, 15, 2013);
date2 = mdy(2, 15, 2015);
date1_year = year(date1);
date2_month = month(date2);
* shift date to beginning of next interval;
date1_next = intnx('MONTH', date1, 1);
* count intervals between dates;
months_between = intck('MONTH', date1, date2);
run;
等效的 pandas 操作如下所示。除了这些函数外,pandas 还支持 Base SAS 中不可用的其他时间序列功能(如重采样和自定义偏移) - 有关更多详细信息,请参阅 时间序列文档。
In [1]: tips["date1"] = pd.Timestamp("2013-01-15")
In [2]: tips["date2"] = pd.Timestamp("2015-02-15")
In [3]: tips["date1_year"] = tips["date1"].dt.year
In [4]: tips["date2_month"] = tips["date2"].dt.month
In [5]: tips["date1_next"] = tips["date1"] + pd.offsets.MonthBegin()
In [6]: tips["months_between"] = tips["date2"].dt.to_period("M") - tips[
...: "date1"
...: ].dt.to_period("M")
...:
In [7]: tips[
...: ["date1", "date2", "date1_year", "date2_month", "date1_next", "months_between"]
...: ]
...:
Out[7]:
date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between
0 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
1 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
2 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
3 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
4 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
.. ... ... ... ... ... ...
239 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
240 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
241 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
242 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
243 2013-01-15 2015-02-15 2013 2 2013-02-01 <25 * MonthEnds>
[244 rows x 6 columns]
选择列#
SAS 在 DATA
步骤中提供了选择、删除和重命名列的关键字。
data tips;
set tips;
keep sex total_bill tip;
run;
data tips;
set tips;
drop sex;
run;
data tips;
set tips;
rename total_bill=total_bill_2;
run;
以下是使用 pandas 表达的相同操作。
保留某些列#
In [1]: tips[["sex", "total_bill", "tip"]]
Out[1]:
sex total_bill tip
0 Female 14.99 1.01
1 Male 8.34 1.66
2 Male 19.01 3.50
3 Male 21.68 3.31
4 Female 22.59 3.61
.. ... ... ...
239 Male 27.03 5.92
240 Female 25.18 2.00
241 Male 20.67 2.00
242 Male 15.82 1.75
243 Female 16.78 3.00
[244 rows x 3 columns]
删除一列#
In [2]: tips.drop("sex", axis=1)
Out[2]:
total_bill tip smoker day time size
0 14.99 1.01 No Sun Dinner 2
1 8.34 1.66 No Sun Dinner 3
2 19.01 3.50 No Sun Dinner 3
3 21.68 3.31 No Sun Dinner 2
4 22.59 3.61 No Sun Dinner 4
.. ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 No Sat Dinner 3
240 25.18 2.00 Yes Sat Dinner 2
241 20.67 2.00 Yes Sat Dinner 2
242 15.82 1.75 No Sat Dinner 2
243 16.78 3.00 No Thur Dinner 2
[244 rows x 6 columns]
重命名一列#
In [3]: tips.rename(columns={"total_bill": "total_bill_2"})
Out[3]:
total_bill_2 tip sex smoker day time size
0 14.99 1.01 Female No Sun Dinner 2
1 8.34 1.66 Male No Sun Dinner 3
2 19.01 3.50 Male No Sun Dinner 3
3 21.68 3.31 Male No Sun Dinner 2
4 22.59 3.61 Female No Sun Dinner 4
.. ... ... ... ... ... ... ...
239 27.03 5.92 Male No Sat Dinner 3
240 25.18 2.00 Female Yes Sat Dinner 2
241 20.67 2.00 Male Yes Sat Dinner 2
242 15.82 1.75 Male No Sat Dinner 2
243 16.78 3.00 Female No Thur Dinner 2
[244 rows x 7 columns]
按值排序#
在 SAS 中,排序是通过 PROC SORT
完成的
proc sort data=tips;
by sex total_bill;
run;
pandas 有一个 DataFrame.sort_values()
方法,该方法接受一个要排序的列列表。
In [1]: tips = tips.sort_values(["sex", "total_bill"])
In [2]: tips
Out[2]:
total_bill tip sex smoker day time size
67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 1
92 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2
111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1
145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2
135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2
.. ... ... ... ... ... ... ...
182 43.35 3.50 Male Yes Sun Dinner 3
156 46.17 5.00 Male No Sun Dinner 6
59 46.27 6.73 Male No Sat Dinner 4
212 46.33 9.00 Male No Sat Dinner 4
170 48.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3
[244 rows x 7 columns]
字符串处理#
查找字符串的长度#
SAS 使用 LENGTHN 和 LENGTHC 函数来确定字符串的长度。LENGTHN
不包括尾随空格,而 LENGTHC
包括尾随空格。
data _null_;
set tips;
put(LENGTHN(time));
put(LENGTHC(time));
run;
你可以使用 Series.str.len()
找到一个字符串的长度。在 Python 3 中,所有字符串都是 Unicode 字符串。len
包括尾随空格。使用 len
和 rstrip
来排除尾随空格。
In [1]: tips["time"].str.len()
Out[1]:
67 6
92 6
111 6
145 5
135 5
..
182 6
156 6
59 6
212 6
170 6
Name: time, Length: 244, dtype: int64
In [2]: tips["time"].str.rstrip().str.len()
Out[2]:
67 6
92 6
111 6
145 5
135 5
..
182 6
156 6
59 6
212 6
170 6
Name: time, Length: 244, dtype: int64
查找子字符串的位置#
SAS 使用 FINDW 函数确定字符串中字符的位置。FINDW
接受由第一个参数定义的字符串,并搜索您作为第二个参数提供的子字符串的第一个位置。
data _null_;
set tips;
put(FINDW(sex,'ale'));
run;
你可以使用 Series.str.find()
方法在一个字符串列中找到字符的位置。find
搜索子字符串的第一个位置。如果找到子字符串,该方法返回其位置。如果未找到,则返回 -1
。请记住,Python 索引是从零开始的。
In [1]: tips["sex"].str.find("ale")
Out[1]:
67 3
92 3
111 3
145 3
135 3
..
182 1
156 1
59 1
212 1
170 1
Name: sex, Length: 244, dtype: int64
按位置提取子字符串#
SAS 使用 SUBSTR 函数从一个字符串中根据其位置提取子字符串。
data _null_;
set tips;
put(substr(sex,1,1));
run;
使用 pandas,你可以通过位置索引来从一个字符串中提取子字符串,使用 []
符号。请记住,Python 索引是从零开始的。
In [1]: tips["sex"].str[0:1]
Out[1]:
67 F
92 F
111 F
145 F
135 F
..
182 M
156 M
59 M
212 M
170 M
Name: sex, Length: 244, dtype: object
提取第n个词#
SAS SCAN 函数返回字符串中的第 n 个单词。第一个参数是你想要解析的字符串,第二个参数指定你想要提取的单词。
data firstlast;
input String $60.;
First_Name = scan(string, 1);
Last_Name = scan(string, -1);
datalines2;
John Smith;
Jane Cook;
;;;
run;
在 pandas 中提取单词的最简单方法是按空格分割字符串,然后通过索引引用单词。请注意,如果您需要更强大的方法,还有更多选择。
In [1]: firstlast = pd.DataFrame({"String": ["John Smith", "Jane Cook"]})
In [2]: firstlast["First_Name"] = firstlast["String"].str.split(" ", expand=True)[0]
In [3]: firstlast["Last_Name"] = firstlast["String"].str.rsplit(" ", expand=True)[1]
In [4]: firstlast
Out[4]:
String First_Name Last_Name
0 John Smith John Smith
1 Jane Cook Jane Cook
更改大小写#
SAS 的 UPCASE、LOWCASE 和 PROPCASE 函数改变参数的大小写。
data firstlast;
input String $60.;
string_up = UPCASE(string);
string_low = LOWCASE(string);
string_prop = PROPCASE(string);
datalines2;
John Smith;
Jane Cook;
;;;
run;
等效的 pandas 方法是 Series.str.upper()
, Series.str.lower()
, 和 Series.str.title()
。
In [1]: firstlast = pd.DataFrame({"string": ["John Smith", "Jane Cook"]})
In [2]: firstlast["upper"] = firstlast["string"].str.upper()
In [3]: firstlast["lower"] = firstlast["string"].str.lower()
In [4]: firstlast["title"] = firstlast["string"].str.title()
In [5]: firstlast
Out[5]:
string upper lower title
0 John Smith JOHN SMITH john smith John Smith
1 Jane Cook JANE COOK jane cook Jane Cook
合并#
以下表格将用于合并示例:
In [1]: df1 = pd.DataFrame({"key": ["A", "B", "C", "D"], "value": np.random.randn(4)})
In [2]: df1
Out[2]:
key value
0 A 0.469112
1 B -0.282863
2 C -1.509059
3 D -1.135632
In [3]: df2 = pd.DataFrame({"key": ["B", "D", "D", "E"], "value": np.random.randn(4)})
In [4]: df2
Out[4]:
key value
0 B 1.212112
1 D -0.173215
2 D 0.119209
3 E -1.044236
在 SAS 中,数据必须在合并之前显式排序。不同类型的连接通过使用 in=
虚拟变量来跟踪是否在一个或两个输入数据框中找到匹配项来实现。
proc sort data=df1;
by key;
run;
proc sort data=df2;
by key;
run;
data left_join inner_join right_join outer_join;
merge df1(in=a) df2(in=b);
if a and b then output inner_join;
if a then output left_join;
if b then output right_join;
if a or b then output outer_join;
run;
pandas 的 DataFrames 有一个 merge()
方法,提供了类似的功能。数据不需要提前排序,不同的连接类型通过 how
关键字实现。
In [1]: inner_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="inner")
In [2]: inner_join
Out[2]:
key value_x value_y
0 B -0.282863 1.212112
1 D -1.135632 -0.173215
2 D -1.135632 0.119209
In [3]: left_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="left")
In [4]: left_join
Out[4]:
key value_x value_y
0 A 0.469112 NaN
1 B -0.282863 1.212112
2 C -1.509059 NaN
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
In [5]: right_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="right")
In [6]: right_join
Out[6]:
key value_x value_y
0 B -0.282863 1.212112
1 D -1.135632 -0.173215
2 D -1.135632 0.119209
3 E NaN -1.044236
In [7]: outer_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="outer")
In [8]: outer_join
Out[8]:
key value_x value_y
0 A 0.469112 NaN
1 B -0.282863 1.212112
2 C -1.509059 NaN
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
5 E NaN -1.044236
缺失数据#
pandas 和 SAS 都有表示缺失数据的方式。
pandas 使用特殊的浮点值 ``NaN``(非数字)来表示缺失数据。许多语义是相同的;例如,缺失数据通过数值操作传播,并且在默认情况下被聚合忽略。
In [1]: outer_join
Out[1]:
key value_x value_y
0 A 0.469112 NaN
1 B -0.282863 1.212112
2 C -1.509059 NaN
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
5 E NaN -1.044236
In [2]: outer_join["value_x"] + outer_join["value_y"]
Out[2]:
0 NaN
1 0.929249
2 NaN
3 -1.308847
4 -1.016424
5 NaN
dtype: float64
In [3]: outer_join["value_x"].sum()
Out[3]: -3.5940742896293765
一个区别是缺失数据不能与其哨兵值进行比较。例如,在 SAS 中,你可以这样做来过滤缺失值。
data outer_join_nulls;
set outer_join;
if value_x = .;
run;
data outer_join_no_nulls;
set outer_join;
if value_x ^= .;
run;
在 pandas 中,Series.isna()
和 Series.notna()
可以用来过滤行。
In [1]: outer_join[outer_join["value_x"].isna()]
Out[1]:
key value_x value_y
5 E NaN -1.044236
In [2]: outer_join[outer_join["value_x"].notna()]
Out[2]:
key value_x value_y
0 A 0.469112 NaN
1 B -0.282863 1.212112
2 C -1.509059 NaN
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
pandas 提供了 多种处理缺失数据的方法 。以下是一些示例:
删除包含缺失值的行#
In [3]: outer_join.dropna()
Out[3]:
key value_x value_y
1 B -0.282863 1.212112
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
从前几行向前填充#
In [4]: outer_join.ffill()
Out[4]:
key value_x value_y
0 A 0.469112 NaN
1 B -0.282863 1.212112
2 C -1.509059 1.212112
3 D -1.135632 -0.173215
4 D -1.135632 0.119209
5 E -1.135632 -1.044236
用指定值替换缺失值#
使用均值:
In [5]: outer_join["value_x"].fillna(outer_join["value_x"].mean())
Out[5]:
0 0.469112
1 -0.282863
2 -1.509059
3 -1.135632
4 -1.135632
5 -0.718815
Name: value_x, dtype: float64
GroupBy#
聚合#
SAS 的 PROC SUMMARY
可以用于按一个或多个键变量分组,并在数值列上计算聚合。
proc summary data=tips nway;
class sex smoker;
var total_bill tip;
output out=tips_summed sum=;
run;
pandas 提供了一个灵活的 groupby
机制,允许类似的聚合。更多详情和示例请参见 groupby 文档。
In [1]: tips_summed = tips.groupby(["sex", "smoker"])[["total_bill", "tip"]].sum()
In [2]: tips_summed
Out[2]:
total_bill tip
sex smoker
Female No 869.68 149.77
Yes 527.27 96.74
Male No 1725.75 302.00
Yes 1217.07 183.07
变换#
在 SAS 中,如果需要将组聚合与原始数据框一起使用,则必须将其合并回去。例如,按吸烟者组减去每个观察值的平均值。
proc summary data=tips missing nway;
class smoker;
var total_bill;
output out=smoker_means mean(total_bill)=group_bill;
run;
proc sort data=tips;
by smoker;
run;
data tips;
merge tips(in=a) smoker_means(in=b);
by smoker;
adj_total_bill = total_bill - group_bill;
if a and b;
run;
pandas 提供了一个 转换 机制,允许这种类型的操作在一个操作中简洁地表达。
In [1]: gb = tips.groupby("smoker")["total_bill"]
In [2]: tips["adj_total_bill"] = tips["total_bill"] - gb.transform("mean")
In [3]: tips
Out[3]:
total_bill tip sex smoker day time size adj_total_bill
67 1.07 1.00 Female Yes Sat Dinner 1 -17.686344
92 3.75 1.00 Female Yes Fri Dinner 2 -15.006344
111 5.25 1.00 Female No Sat Dinner 1 -11.938278
145 6.35 1.50 Female No Thur Lunch 2 -10.838278
135 6.51 1.25 Female No Thur Lunch 2 -10.678278
.. ... ... ... ... ... ... ... ...
182 43.35 3.50 Male Yes Sun Dinner 3 24.593656
156 46.17 5.00 Male No Sun Dinner 6 28.981722
59 46.27 6.73 Male No Sat Dinner 4 29.081722
212 46.33 9.00 Male No Sat Dinner 4 29.141722
170 48.81 10.00 Male Yes Sat Dinner 3 30.053656
[244 rows x 8 columns]
按组处理#
除了聚合之外,pandas groupby
可以用来复制大多数来自 SAS 的分组处理。例如,这个 DATA
步骤按性别/吸烟者组读取数据,并过滤到每个组的第一条记录。
proc sort data=tips;
by sex smoker;
run;
data tips_first;
set tips;
by sex smoker;
if FIRST.sex or FIRST.smoker then output;
run;
在 pandas 中,这可以写成:
In [4]: tips.groupby(["sex", "smoker"]).first()
Out[4]:
total_bill tip day time size adj_total_bill
sex smoker
Female No 5.25 1.00 Sat Dinner 1 -11.938278
Yes 1.07 1.00 Sat Dinner 1 -17.686344
Male No 5.51 2.00 Thur Lunch 2 -11.678278
Yes 5.25 5.15 Sun Dinner 2 -13.506344
其他注意事项#
磁盘 vs 内存#
pandas 完全在内存中运行,而 SAS 数据集存在于磁盘上。这意味着能够加载到 pandas 中的数据大小受限于您的机器内存,但同时也意味着对这些数据的操作可能会更快。
如果需要核心外处理,一种可能性是 dask.dataframe 库(目前正在开发中),它为磁盘上的 DataFrame
提供了一部分 pandas 功能。
数据互操作性#
pandas 提供了一个 read_sas()
方法,可以读取以 XPORT 或 SAS7BDAT 二进制格式保存的 SAS 数据。
libname xportout xport 'transport-file.xpt';
data xportout.tips;
set tips(rename=(total_bill=tbill));
* xport variable names limited to 6 characters;
run;
df = pd.read_sas("transport-file.xpt")
df = pd.read_sas("binary-file.sas7bdat")
你也可以直接指定文件格式。默认情况下,pandas 会尝试根据文件扩展名推断文件格式。
df = pd.read_sas("transport-file.xpt", format="xport")
df = pd.read_sas("binary-file.sas7bdat", format="sas7bdat")
XPORT 是一个相对有限制的格式,其解析不像其他一些 pandas 读取器那样优化。在 SAS 和 pandas 之间互操作数据的另一种方法是序列化为 csv。
# version 0.17, 10M rows
In [8]: %time df = pd.read_sas('big.xpt')
Wall time: 14.6 s
In [9]: %time df = pd.read_csv('big.csv')
Wall time: 4.86 s