与 Stata 的比较#

对于来自 Stata 的潜在用户,本页面旨在展示如何在 pandas 中执行不同的 Stata 操作。

如果你是pandas的新手,你可能想先阅读 10分钟入门pandas 以熟悉这个库。

按照惯例,我们导入 pandas 和 NumPy 如下:

In [1]: import pandas as pd

In [2]: import numpy as np

数据结构#

通用术语翻译#

pandas

Stata

DataFrame

数据集

column

变量

observation

groupby

bysort

NaN

`` ``

DataFrame#

在 pandas 中的 DataFrame 类似于 Stata 数据集 – 一个带有标签列的二维数据源,这些列可以是不同类型的。正如本文档所示,几乎任何可以应用于 Stata 数据集的操作也可以在 pandas 中完成。

Series#

Series 是表示 DataFrame 一列的数据结构。Stata 没有单独的数据结构用于单列,但一般来说,使用 Series 类似于在 Stata 中引用数据集的一列。

Index#

每个 DataFrameSeries 都有一个 Index – 数据 上的标签。Stata 没有完全类似的概念。在 Stata 中,数据集的行本质上是无标签的,除了可以用 _n 访问的隐式整数索引。

在 pandas 中,如果没有指定索引,默认也会使用整数索引(第一行 = 0,第二行 = 1,依此类推)。虽然使用带标签的 IndexMultiIndex 可以启用复杂的分析,并且最终是理解 pandas 的重要部分,但对于这个比较,我们将基本上忽略 Index,只是将 DataFrame 视为列的集合。请参阅 索引文档 以了解更多关于如何有效使用 Index 的信息。

复制 vs. 原地操作#

大多数 pandas 操作返回 Series/DataFrame 的副本。要使更改生效,你需要将其分配给一个新变量:

sorted_df = df.sort_values("col1")

或者覆盖原始的那个:

df = df.sort_values("col1")

备注

你将会看到一些方法提供了 inplace=Truecopy=False 关键字参数:

df.replace(5, inplace=True)

关于弃用和移除大多数方法(例如 dropna)的 inplacecopy 的讨论正在进行中,除了极少数方法(包括 replace)。在写时复制(Copy-on-Write)的上下文中,这两个关键字将不再需要。提案可以在这里找到 here

数据输入 / 输出#

从值构建一个DataFrame#

通过在 input 语句后放置数据并指定列名,可以从指定值构建一个 Stata 数据集。

input x y
1 2
3 4
5 6
end

一个 pandas DataFrame 可以通过许多不同的方式构建,但对于少量值,通常将其指定为 Python 字典很方便,其中键是列名,值是数据。

In [3]: df = pd.DataFrame({"x": [1, 3, 5], "y": [2, 4, 6]})

In [4]: df
Out[4]: 
   x  y
0  1  2
1  3  4
2  5  6

读取外部数据#

像 Stata 一样,pandas 提供了从许多格式读取数据的工具。tips 数据集,可以在 pandas 测试中找到(csv),将在以下许多示例中使用。

Stata 提供了 import delimited 来将 csv 数据读取到内存中的数据集中。如果 tips.csv 文件在当前工作目录中,我们可以如下导入它。

import delimited tips.csv

pandas 方法是 read_csv(),它的工作方式类似。此外,如果提供了一个url,它将自动下载数据集。

In [5]: url = (
   ...:     "https://raw.githubusercontent.com/pandas-dev"
   ...:     "/pandas/main/pandas/tests/io/data/csv/tips.csv"
   ...: )
   ...: 

In [6]: tips = pd.read_csv(url)

In [7]: tips
Out[7]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         16.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1         10.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         21.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         23.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         24.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       29.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       27.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       22.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       17.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       18.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

import delimited 一样,read_csv() 可以接受许多参数来指定数据应如何解析。例如,如果数据是制表符分隔的,没有列名,并且存在于当前工作目录中,pandas 命令将是:

tips = pd.read_csv("tips.csv", sep="\t", header=None)

# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimiter
tips = pd.read_table("tips.csv", header=None)

pandas 也可以使用 read_stata() 函数读取 .dta 格式的 Stata 数据集。

df = pd.read_stata("data.dta")

除了 text/csv 和 Stata 文件外,pandas 还支持多种其他数据格式,如 Excel、SAS、HDF5、Parquet 和 SQL 数据库。这些都可以通过 pd.read_* 函数读取。更多详情请参见 IO 文档

限制输出#

默认情况下,pandas 会截断大型 DataFrame 的输出,以显示首尾行。这可以通过 更改 pandas 选项 来覆盖,或者使用 DataFrame.head()DataFrame.tail()

In [8]: tips.head(5)
Out[8]: 
   total_bill   tip     sex smoker  day    time  size
0       16.99  1.01  Female     No  Sun  Dinner     2
1       10.34  1.66    Male     No  Sun  Dinner     3
2       21.01  3.50    Male     No  Sun  Dinner     3
3       23.68  3.31    Male     No  Sun  Dinner     2
4       24.59  3.61  Female     No  Sun  Dinner     4

在 Stata 中相当于:

list in 1/5

导出数据#

在 Stata 中,import delimited 的逆操作是 export delimited

export delimited tips2.csv

同样在 pandas 中,read_csv 的反向操作是 DataFrame.to_csv()

tips.to_csv("tips2.csv")

pandas 也可以通过 DataFrame.to_stata() 方法导出到 Stata 文件格式。

tips.to_stata("tips2.dta")

数据操作#

列上的操作#

在 Stata 中,任意的数学表达式可以与 generatereplace 命令一起用于新列或现有列。drop 命令从数据集中删除列。

replace total_bill = total_bill - 2
generate new_bill = total_bill / 2
drop new_bill

pandas 通过在 DataFrame 中指定单个 Series 来提供矢量化操作。新列可以以相同的方式分配。DataFrame.drop() 方法从 DataFrame 中删除一列。

In [9]: tips["total_bill"] = tips["total_bill"] - 2

In [10]: tips["new_bill"] = tips["total_bill"] / 2

In [11]: tips
Out[11]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size  new_bill
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2     7.495
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3     4.170
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3     9.505
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2    10.840
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4    11.295
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...       ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3    13.515
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2    12.590
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2    10.335
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2     7.910
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2     8.390

[244 rows x 8 columns]

In [12]: tips = tips.drop("new_bill", axis=1)

过滤#

在 Stata 中,过滤是通过在一个或多个列上使用 if 子句来完成的。

list if total_bill > 10

DataFrame 可以通过多种方式进行过滤;其中最直观的方法是使用 布尔索引

In [13]: tips[tips["total_bill"] > 10]
Out[13]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
5         23.29  4.71    Male     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[204 rows x 7 columns]

上述语句只是将一个 True/False 对象的 Series 传递给 DataFrame,返回所有 True 的行。

In [14]: is_dinner = tips["time"] == "Dinner"

In [15]: is_dinner
Out[15]: 
0      True
1      True
2      True
3      True
4      True
       ... 
239    True
240    True
241    True
242    True
243    True
Name: time, Length: 244, dtype: bool

In [16]: is_dinner.value_counts()
Out[16]: 
time
True     176
False     68
Name: count, dtype: int64

In [17]: tips[is_dinner]
Out[17]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[176 rows x 7 columns]

如果/那么 逻辑#

在 Stata 中,if 子句也可以用来创建新列。

generate bucket = "low" if total_bill < 10
replace bucket = "high" if total_bill >= 10

在 pandas 中相同的操作可以使用 numpywhere 方法来完成。

In [18]: tips["bucket"] = np.where(tips["total_bill"] < 10, "low", "high")

In [19]: tips
Out[19]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size bucket
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2   high
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3    low
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3   high
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2   high
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4   high
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...    ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3   high
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2   high
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2   high
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2   high
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2   high

[244 rows x 8 columns]

日期功能#

Stata 提供了多种函数来对日期/时间列进行操作。

generate date1 = mdy(1, 15, 2013)
generate date2 = date("Feb152015", "MDY")

generate date1_year = year(date1)
generate date2_month = month(date2)

* shift date to beginning of next month
generate date1_next = mdy(month(date1) + 1, 1, year(date1)) if month(date1) != 12
replace date1_next = mdy(1, 1, year(date1) + 1) if month(date1) == 12
generate months_between = mofd(date2) - mofd(date1)

list date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between

等效的 pandas 操作如下所示。除了这些函数外,pandas 还支持 Stata 中不可用的其他时间序列功能(例如时区处理和自定义偏移)– 有关更多详细信息,请参阅 时间序列文档

In [20]: tips["date1"] = pd.Timestamp("2013-01-15")

In [21]: tips["date2"] = pd.Timestamp("2015-02-15")

In [22]: tips["date1_year"] = tips["date1"].dt.year

In [23]: tips["date2_month"] = tips["date2"].dt.month

In [24]: tips["date1_next"] = tips["date1"] + pd.offsets.MonthBegin()

In [25]: tips["months_between"] = tips["date2"].dt.to_period("M") - tips[
   ....:     "date1"
   ....: ].dt.to_period("M")
   ....: 

In [26]: tips[
   ....:     ["date1", "date2", "date1_year", "date2_month", "date1_next", "months_between"]
   ....: ]
   ....: 
Out[26]: 
         date1      date2  date1_year  date2_month date1_next    months_between
0   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
1   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
2   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
3   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
4   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
..         ...        ...         ...          ...        ...               ...
239 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
240 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
241 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
242 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
243 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>

[244 rows x 6 columns]

选择列#

Stata 提供了选择、删除和重命名列的关键字。

keep sex total_bill tip

drop sex

rename total_bill total_bill_2

以下是使用 pandas 表达的相同操作。

保留某些列#

In [27]: tips[["sex", "total_bill", "tip"]]
Out[27]: 
        sex  total_bill   tip
0    Female       14.99  1.01
1      Male        8.34  1.66
2      Male       19.01  3.50
3      Male       21.68  3.31
4    Female       22.59  3.61
..      ...         ...   ...
239    Male       27.03  5.92
240  Female       25.18  2.00
241    Male       20.67  2.00
242    Male       15.82  1.75
243  Female       16.78  3.00

[244 rows x 3 columns]

删除一列#

In [28]: tips.drop("sex", axis=1)
Out[28]: 
     total_bill   tip smoker   day    time  size
0         14.99  1.01     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 6 columns]

重命名一列#

In [29]: tips.rename(columns={"total_bill": "total_bill_2"})
Out[29]: 
     total_bill_2   tip     sex smoker   day    time  size
0           14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1            8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2           19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3           21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4           22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..            ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239         27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240         25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241         20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242         15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243         16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

按值排序#

在 Stata 中,排序是通过 sort 完成的。

sort sex total_bill

pandas 有一个 DataFrame.sort_values() 方法,该方法接受一个要排序的列列表。

In [30]: tips = tips.sort_values(["sex", "total_bill"])

In [31]: tips
Out[31]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3

[244 rows x 7 columns]

字符串处理#

查找字符串的长度#

Stata 使用 strlen()ustrlen() 函数分别确定 ASCII 和 Unicode 字符串的长度。

generate strlen_time = strlen(time)
generate ustrlen_time = ustrlen(time)

你可以使用 Series.str.len() 找到一个字符串的长度。在 Python 3 中,所有字符串都是 Unicode 字符串。len 包括尾随空格。使用 lenrstrip 来排除尾随空格。

In [32]: tips["time"].str.len()
Out[32]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

In [33]: tips["time"].str.rstrip().str.len()
Out[33]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

查找子字符串的位置#

Stata 使用 strpos() 函数确定字符串中字符的位置。该函数接受由第一个参数定义的字符串,并搜索您作为第二个参数提供的子字符串的第一个位置。

generate str_position = strpos(sex, "ale")

你可以使用 Series.str.find() 方法在一个字符串列中找到字符的位置。find 搜索子字符串的第一个位置。如果找到子字符串,该方法返回其位置。如果未找到,则返回 -1。请记住,Python 索引是从零开始的。

In [34]: tips["sex"].str.find("ale")
Out[34]: 
67     3
92     3
111    3
145    3
135    3
      ..
182    1
156    1
59     1
212    1
170    1
Name: sex, Length: 244, dtype: int64

按位置提取子字符串#

Stata 使用 substr() 函数根据字符串的位置提取子字符串。

generate short_sex = substr(sex, 1, 1)

使用 pandas,你可以通过位置索引来从一个字符串中提取子字符串,使用 [] 符号。请记住,Python 索引是从零开始的。

In [35]: tips["sex"].str[0:1]
Out[35]: 
67     F
92     F
111    F
145    F
135    F
      ..
182    M
156    M
59     M
212    M
170    M
Name: sex, Length: 244, dtype: object

提取第n个词#

Stata 的 word() 函数返回字符串中的第 n 个单词。第一个参数是要解析的字符串,第二个参数指定要提取的单词。

clear
input str20 string
"John Smith"
"Jane Cook"
end

generate first_name = word(name, 1)
generate last_name = word(name, -1)

在 pandas 中提取单词的最简单方法是按空格分割字符串,然后通过索引引用单词。请注意,如果您需要更强大的方法,还有更多选择。

In [36]: firstlast = pd.DataFrame({"String": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [37]: firstlast["First_Name"] = firstlast["String"].str.split(" ", expand=True)[0]

In [38]: firstlast["Last_Name"] = firstlast["String"].str.rsplit(" ", expand=True)[1]

In [39]: firstlast
Out[39]: 
       String First_Name Last_Name
0  John Smith       John     Smith
1   Jane Cook       Jane      Cook

改变大小写#

Stata 的 strupper(), strlower(), strproper(), ustrupper(), ustrlower(), 和 ustrtitle() 函数分别改变 ASCII 和 Unicode 字符串的大小写。

clear
input str20 string
"John Smith"
"Jane Cook"
end

generate upper = strupper(string)
generate lower = strlower(string)
generate title = strproper(string)
list

等效的 pandas 方法是 Series.str.upper(), Series.str.lower(), 和 Series.str.title()

In [40]: firstlast = pd.DataFrame({"string": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [41]: firstlast["upper"] = firstlast["string"].str.upper()

In [42]: firstlast["lower"] = firstlast["string"].str.lower()

In [43]: firstlast["title"] = firstlast["string"].str.title()

In [44]: firstlast
Out[44]: 
       string       upper       lower       title
0  John Smith  JOHN SMITH  john smith  John Smith
1   Jane Cook   JANE COOK   jane cook   Jane Cook

合并#

以下表格将用于合并示例:

In [45]: df1 = pd.DataFrame({"key": ["A", "B", "C", "D"], "value": np.random.randn(4)})

In [46]: df1
Out[46]: 
  key     value
0   A  0.469112
1   B -0.282863
2   C -1.509059
3   D -1.135632

In [47]: df2 = pd.DataFrame({"key": ["B", "D", "D", "E"], "value": np.random.randn(4)})

In [48]: df2
Out[48]: 
  key     value
0   B  1.212112
1   D -0.173215
2   D  0.119209
3   E -1.044236

在 Stata 中,要执行合并操作,一个数据集必须在内存中,另一个必须作为磁盘上的文件名引用。相比之下,Python 必须已经将两个 DataFrames 都加载到内存中。

默认情况下,Stata 执行外连接,在合并后将两个数据集中的所有观察值保留在内存中。可以通过使用 _merge 变量中创建的值,仅保留初始数据集、合并后的数据集或两者的交集中的观察值。

* First create df2 and save to disk
clear
input str1 key
B
D
D
E
end
generate value = rnormal()
save df2.dta

* Now create df1 in memory
clear
input str1 key
A
B
C
D
end
generate value = rnormal()

preserve

* Left join
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 1

* Right join
restore, preserve
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 2

* Inner join
restore, preserve
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 3

* Outer join
restore
merge 1:n key using df2.dta

pandas 的 DataFrames 有一个 merge() 方法,提供了类似的功能。数据不需要提前排序,不同的连接类型通过 how 关键字实现。

In [49]: inner_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="inner")

In [50]: inner_join
Out[50]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209

In [51]: left_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="left")

In [52]: left_join
Out[52]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

In [53]: right_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="right")

In [54]: right_join
Out[54]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209
3   E       NaN -1.044236

In [55]: outer_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="outer")

In [56]: outer_join
Out[56]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

缺失数据#

pandas 和 Stata 都有表示缺失数据的方式。

pandas 用特殊的浮点值 ``NaN``(不是一个数字)表示缺失数据。许多语义是相同的;例如,缺失数据通过数值操作传播,并且在默认情况下被聚合忽略。

In [57]: outer_join
Out[57]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

In [58]: outer_join["value_x"] + outer_join["value_y"]
Out[58]: 
0         NaN
1    0.929249
2         NaN
3   -1.308847
4   -1.016424
5         NaN
dtype: float64

In [59]: outer_join["value_x"].sum()
Out[59]: -3.5940742896293765

一个区别是缺失数据不能与其哨兵值进行比较。例如,在 Stata 中,你可以这样做来过滤缺失值。

* Keep missing values
list if value_x == .
* Keep non-missing values
list if value_x != .

在 pandas 中,Series.isna()Series.notna() 可以用来过滤行。

In [60]: outer_join[outer_join["value_x"].isna()]
Out[60]: 
  key  value_x   value_y
5   E      NaN -1.044236

In [61]: outer_join[outer_join["value_x"].notna()]
Out[61]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

pandas 提供了 多种处理缺失数据的方法 。以下是一些示例:

删除包含缺失值的行#

In [62]: outer_join.dropna()
Out[62]: 
  key   value_x   value_y
1   B -0.282863  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

从前几行向前填充#

In [63]: outer_join.ffill()
Out[63]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E -1.135632 -1.044236

用指定值替换缺失值#

使用均值:

In [64]: outer_join["value_x"].fillna(outer_join["value_x"].mean())
Out[64]: 
0    0.469112
1   -0.282863
2   -1.509059
3   -1.135632
4   -1.135632
5   -0.718815
Name: value_x, dtype: float64

GroupBy#

聚合#

Stata 的 collapse 可以用于按一个或多个键变量分组,并对数值列进行聚合计算。

collapse (sum) total_bill tip, by(sex smoker)

pandas 提供了一个灵活的 groupby 机制,允许类似的聚合。更多细节和示例请参见 groupby 文档

In [65]: tips_summed = tips.groupby(["sex", "smoker"])[["total_bill", "tip"]].sum()

In [66]: tips_summed
Out[66]: 
               total_bill     tip
sex    smoker                    
Female No          869.68  149.77
       Yes         527.27   96.74
Male   No         1725.75  302.00
       Yes        1217.07  183.07

Transformation#

在 Stata 中,如果需要在原始数据集中使用组聚合,通常会使用 bysortegen()。例如,按吸烟者组减去每个观察值的平均值。

bysort sex smoker: egen group_bill = mean(total_bill)
generate adj_total_bill = total_bill - group_bill

pandas 提供了一个 转换 机制,允许这种类型的操作在一个操作中简洁地表达。

In [67]: gb = tips.groupby("smoker")["total_bill"]

In [68]: tips["adj_total_bill"] = tips["total_bill"] - gb.transform("mean")

In [69]: tips
Out[69]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size  adj_total_bill
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1      -17.686344
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2      -15.006344
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1      -11.938278
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.838278
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.678278
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...             ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3       24.593656
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6       28.981722
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4       29.081722
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4       29.141722
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3       30.053656

[244 rows x 8 columns]

按组处理#

除了聚合之外,pandas groupby 可以用来复制 Stata 中的大多数其他 bysort 处理。例如,以下示例按性别/吸烟者组列出当前排序顺序中的第一个观察值。

bysort sex smoker: list if _n == 1

在 pandas 中,这可以写成:

In [70]: tips.groupby(["sex", "smoker"]).first()
Out[70]: 
               total_bill   tip   day    time  size  adj_total_bill
sex    smoker                                                      
Female No            5.25  1.00   Sat  Dinner     1      -11.938278
       Yes           1.07  1.00   Sat  Dinner     1      -17.686344
Male   No            5.51  2.00  Thur   Lunch     2      -11.678278
       Yes           5.25  5.15   Sun  Dinner     2      -13.506344

其他考虑事项#

磁盘 vs 内存#

pandas 和 Stata 都只能在内存中操作。这意味着能够加载到 pandas 中的数据大小受限于您的机器内存。如果需要核心外处理,一种可能性是 dask.dataframe 库,它为磁盘上的 DataFrame 提供了 pandas 功能的一个子集。