min_weight_full_bipartite_matching#
- scipy.sparse.csgraph.min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency_matrix, maximize=False)#
返回二分图的最小权重完全匹配。
Added in version 1.6.0.
- 参数:
- biadjacency_matrix稀疏矩阵
二部图的邻接矩阵:一个以CSR、CSC或COO格式存储的稀疏矩阵,其行表示图的一个分区,列表示另一个分区。两个顶点之间的边由矩阵中相应的条目表示,边的权重由该条目的值给出。这不应与图的全邻接矩阵混淆,因为我们只需要定义二部图结构的子矩阵。
- 最大化bool (默认: False)
如果为真,则计算最大权重匹配。
- 返回:
- row_ind, col_ind数组
一个行索引数组和相应的列索引数组,给出最佳匹配。匹配的总权重可以计算为
graph[row_ind, col_ind].sum()
。行索引将被排序;在方阵的情况下,它们将等于numpy.arange(graph.shape[0])
。
注释
设 \(G = ((U, V), E)\) 为一个带权二分图,其权重为非零值 \(w : E \to \mathbb{R} \setminus \{0\}\)。该函数生成一个匹配 \(M \subseteq E\),其基数为
\[|M| = \min(|U|, |V|),\]该算法最小化匹配中包含的边的权重之和,\(\sum_{e \in M} w(e)\),或者在不存在此类匹配时引发错误。
当 \(\lvert U \rvert = \lvert V \rvert\) 时,这通常被称为完美匹配;在这里,由于我们允许 \(\lvert U \rvert\) 和 \(\lvert V \rvert\) 不同,我们遵循 Karp [1] 并将这种匹配称为 完全。
此函数实现了 LAPJVsp 算法 [2],即“线性分配问题,Jonker–Volgenant,稀疏”的缩写。
它解决的问题等同于矩形线性分配问题。[3] 因此,这个函数可以用来解决与
scipy.optimize.linear_sum_assignment
相同的问题。当输入是密集的,或者对于某些特定类型的输入(例如,其中 \((i, j)\) 项是欧几里得空间中两点之间的距离),该函数可能表现更好。如果没有完全匹配存在,此函数会引发一个
ValueError
。要确定图中最大匹配的大小,请参见maximum_bipartite_matching
。我们要求权重为非零值,只是为了避免在不同稀疏表示之间转换时处理显式零值的问题。零权重可以通过将一个常数加到所有权重上来处理,从而使结果矩阵不包含零值。
如果存在多个有效解决方案,输出可能会因 SciPy 和 Python 版本的不同而有所变化。
参考文献
[1]Richard Manning Karp: 一种在预期时间 O(mn log n) 内解决 m x n 分配问题的算法。《网络》, 10(2):143-152, 1980.
[2]Roy Jonker 和 Anton Volgenant: 一种用于密集和稀疏线性分配问题的最短增广路径算法。计算 38:325-340, 1987。
[3]示例
>>> from scipy.sparse import csr_matrix >>> from scipy.sparse.csgraph import min_weight_full_bipartite_matching
首先,让我们考虑一个所有权重都相等的例子:
>>> biadjacency_matrix = csr_matrix([[1, 1, 1], [1, 0, 0], [0, 1, 0]])
在这里,我们得到的是图的完美匹配:
>>> print(min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency_matrix)[1]) [2 0 1]
也就是说,第一、第二和第三行分别与第三、第一和第二列匹配。请注意,在这个例子中,输入矩阵中的0并不对应于权重为0的边,而是表示一对顶点之间没有通过边配对。
还要注意,在这种情况下,输出与应用
maximum_bipartite_matching
的结果相匹配:>>> from scipy.sparse.csgraph import maximum_bipartite_matching >>> biadjacency = csr_matrix([[1, 1, 1], [1, 0, 0], [0, 1, 0]]) >>> print(maximum_bipartite_matching(biadjacency, perm_type='column')) [2 0 1]
当有多条边可用时,优先选择权重最低的边:
>>> biadjacency = csr_matrix([[3, 3, 6], [4, 3, 5], [10, 1, 8]]) >>> row_ind, col_ind = min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency) >>> print(col_ind) [0 2 1]
在这种情况下,总重量是 \(3 + 5 + 1 = 9\):
>>> print(biadjacency[row_ind, col_ind].sum()) 9
当矩阵不是方阵时,即当两个分区具有不同的基数时,匹配的大小为两个分区中较小的一个:
>>> biadjacency = csr_matrix([[0, 1, 1], [0, 2, 3]]) >>> row_ind, col_ind = min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency) >>> print(row_ind, col_ind) [0 1] [2 1] >>> biadjacency = csr_matrix([[0, 1], [3, 1], [1, 4]]) >>> row_ind, col_ind = min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency) >>> print(row_ind, col_ind) [0 2] [1 0]
当一个或两个分区为空时,匹配也为空:
>>> biadjacency = csr_matrix((2, 0)) >>> row_ind, col_ind = min_weight_full_bipartite_matching(biadjacency) >>> print(row_ind, col_ind) [] []
一般来说,我们将总是得到与使用
scipy.optimize.linear_sum_assignment
相同的权重总和,但请注意,对于后者,缺失的边由矩阵条目float('inf')
表示。让我们生成一个随机稀疏矩阵,其整数条目在1到10之间:>>> import numpy as np >>> from scipy.sparse import random >>> from scipy.optimize import linear_sum_assignment >>> sparse = random(10, 10, random_state=42, density=.5, format='coo') * 10 >>> sparse.data = np.ceil(sparse.data) >>> dense = sparse.toarray() >>> dense = np.full(sparse.shape, np.inf) >>> dense[sparse.row, sparse.col] = sparse.data >>> sparse = sparse.tocsr() >>> row_ind, col_ind = linear_sum_assignment(dense) >>> print(dense[row_ind, col_ind].sum()) 28.0 >>> row_ind, col_ind = min_weight_full_bipartite_matching(sparse) >>> print(sparse[row_ind, col_ind].sum()) 28.0