scipy.spatial.

cKDTree#

class scipy.spatial.cKDTree(data, leafsize=16, compact_nodes=True, copy_data=False, balanced_tree=True, boxsize=None)#

kd-树用于快速最近邻查找

此类提供了一个对一组 k 维点的索引,可用于快速查找任何点的最近邻。

备注

cKDTree 在功能上与 KDTree 完全相同。在 SciPy v1.6.0 之前,cKDTree 的性能更好,功能略有不同,但现在这两个名称仅出于向后兼容的原因而存在。如果不考虑与 SciPy < 1.6 的兼容性,建议使用 KDTree

参数:
数据array_like, 形状 (n,m)

要索引的维度为 m 的 n 个数据点。除非必须生成连续的双精度数组,否则不会复制此数组,因此修改此数据将导致错误结果。如果使用 copy_data=True 构建 kd-树,则数据也会被复制。

leafsize正整数,可选

算法切换到暴力搜索的点数。默认值:16。

紧凑节点bool, 可选

如果为 True,kd-树将被构建以缩小超矩形到实际数据范围。这通常会生成一个更紧凑的树,对退化的输入数据具有鲁棒性,并在构建时间更长的情况下提供更快的查询。默认值:True。

copy_databool, 可选

如果为 True,数据将始终被复制以保护 kd-树 免受数据损坏。默认值:False。

平衡树bool, 可选

如果为 True,则使用中位数来分割超矩形,而不是使用中点。这通常会生成更紧凑的树并加快查询速度,但代价是构建时间更长。默认值:True。

boxsize类似数组或标量,可选

将 m-d 环形拓扑应用于 KDTree。该拓扑由 \(x_i + n_i L_i\) 生成,其中 \(n_i\) 是整数,\(L_i\) 是第 i 维的盒子大小。输入数据应包装到 \([0, L_i)\) 中。如果任何数据超出此范围,则会引发 ValueError。

属性:
数据ndarray, 形状 (n,m)

要索引的维度为 m 的 n 个数据点。除非有必要生成一个连续的双精度数组,否则不会复制此数组。如果使用 copy_data=True 构建 kd-tree,数据也会被复制。

leafsize正整数

算法切换到暴力搜索的点数。

m整数

单个数据点的维度。

n整数

数据点的数量。

最大值ndarray, 形状 (m,)

n 个数据点在每个维度上的最大值。

分钟ndarray, 形状 (m,)

n 个数据点在每个维度上的最小值。

对象, 类 cKDTreeNode

此属性暴露了 cKDTree 对象中根节点的 Python 视图。在首次访问时,会动态创建 kd-树的完整 Python 视图。此属性允许您在 Python 中创建自己的查询函数。

大小整数

树中的节点数量。

方法

count_neighbors(self, other, r[, p, ...])

计算可以形成多少对附近的配对。

query(self, x[, k, eps, p, ...])

查询 kd-树 以获取最近邻

query_ball_point(self, x, r[, p, eps, ...])

查找距离点 x 在距离 r 内的所有点。

query_ball_tree(self, other, r[, p, eps])

找到 selfother 之间所有距离最多为 r 的点对

query_pairs(self, r[, p, eps, output_type])

找到 self 中所有距离不超过 r 的点对。

sparse_distance_matrix(self, other, max_distance)

计算稀疏距离矩阵

注释

所使用的算法在 Maneewongvatana 和 Mount 1999 年有所描述。其基本思想是 kd-树是一个二叉树,每个节点代表一个轴对齐的超矩形。每个节点指定一个轴,并根据该轴上的坐标是否大于或小于特定值来分割点集。

在构建过程中,轴和分割点由“滑动中点”规则选择,这确保了单元格不会全部变得细长。

可以查询树以获取任何给定点最近的 r 个邻居(可选地仅返回那些在点某个最大距离内的邻居)。它还可以被查询,以显著提高效率,获取 r 个近似最近的邻居。

对于大维度(20 已经算大),不要期望它比暴力搜索运行得显著更快。高维最近邻查询是计算机科学中一个重大的开放问题。