median_test#
- scipy.stats.median_test(*samples, ties='below', correction=True, lambda_=1, nan_policy='propagate')[源代码][源代码]#
执行 Mood 中位数检验。
测试两个或多个样本是否来自具有相同中位数的总体。
设
n = len(samples)
为样本数量。计算所有数据的总中位数,并通过将每个样本中的值分类为高于或低于总中位数来形成列联表。列联表与 correction 和 lambda_ 一起传递给scipy.stats.chi2_contingency
以计算检验统计量和 p 值。- 参数:
- 示例1, 示例2, …array_like
样本集。必须至少有两个样本。每个样本必须是一个包含至少一个值的一维序列。样本的长度不需要相同。
- 关系str, 可选
确定在列联表中如何分类等于总中位数的值。字符串必须是以下之一:
"below": Values equal to the grand median are counted as "below". "above": Values equal to the grand median are counted as "above". "ignore": Values equal to the grand median are not counted.
默认是“below”。
- 修正bool, 可选
如果为 True,并且 只有两个样本,则在计算与列联表相关的检验统计量时应用 Yates 的连续性校正。默认值为 True。
- lambda_浮点数或字符串,可选
默认情况下,此测试中计算的统计量是皮尔逊卡方统计量。lambda_ 允许使用 Cressie-Read 幂散度家族中的统计量。详情请参见
power_divergence
。默认值为 1(皮尔逊卡方统计量)。- nan_policy{‘propagate’, ‘raise’, ‘omit’}, 可选
定义当输入包含 nan 时的处理方式。’propagate’ 返回 nan,’raise’ 抛出错误,’omit’ 忽略 nan 值进行计算。默认是 ‘propagate’。
- 返回:
- res中位数测试结果
一个包含属性的对象:
- 统计浮动
测试统计量。返回的统计量由 lambda_ 决定。默认是皮尔逊卡方统计量。
- p值浮动
测试的 p 值。
- 中位数浮动
伟大的中位数。
- 表格ndarray
列联表。表格的形状为 (2, n),其中 n 是样本的数量。第一行保存大于总中位数的值的计数,第二行保存小于总中位数的值的计数。该表格允许进一步分析,例如使用
scipy.stats.chi2_contingency
,或者在有两个样本的情况下使用scipy.stats.fisher_exact
,而无需重新计算表格。如果nan_policy
是 “propagate” 并且输入中有 nans,则table
的返回值为None
。
参见
kruskal
计算独立样本的Kruskal-Wallis H检验。
mannwhitneyu
计算样本 x 和 y 的 Mann-Whitney 秩检验。
注释
Added in version 0.15.0.
参考文献
[1]Mood, A. M., 《统计理论导论》。McGraw-Hill (1950), 第394-399页。
[2]Zar, J. H., 《生物统计分析》, 第5版. Prentice Hall (2010). 参见第8.12节和第10.15节。
示例
一位生物学家进行了一项实验,其中有三个植物组。第一组有16株植物,第二组有15株植物,第三组有17株植物。每株植物产生一定数量的种子。各组的种子数量如下:
Group 1: 10 14 14 18 20 22 24 25 31 31 32 39 43 43 48 49 Group 2: 28 30 31 33 34 35 36 40 44 55 57 61 91 92 99 Group 3: 0 3 9 22 23 25 25 33 34 34 40 45 46 48 62 67 84
以下代码对这些样本应用 Mood’s 中位数检验。
>>> g1 = [10, 14, 14, 18, 20, 22, 24, 25, 31, 31, 32, 39, 43, 43, 48, 49] >>> g2 = [28, 30, 31, 33, 34, 35, 36, 40, 44, 55, 57, 61, 91, 92, 99] >>> g3 = [0, 3, 9, 22, 23, 25, 25, 33, 34, 34, 40, 45, 46, 48, 62, 67, 84] >>> from scipy.stats import median_test >>> res = median_test(g1, g2, g3)
中位数是
>>> res.median 34.0
而列联表是
>>> res.table array([[ 5, 10, 7], [11, 5, 10]])
p 值过大,无法得出中位数不同的结论:
>>> res.pvalue 0.12609082774093244
可以通过将
lambda_="log-likelihood"
传递给median_test
来执行“G-test”。>>> res = median_test(g1, g2, g3, lambda_="log-likelihood") >>> res.pvalue 0.12224779737117837
中位数在数据中出现了多次,因此如果我们使用例如
ties="above"
,将会得到不同的结果:>>> res = median_test(g1, g2, g3, ties="above") >>> res.pvalue 0.063873276069553273
>>> res.table array([[ 5, 11, 9], [11, 4, 8]])
这个例子展示了如果数据集不大且存在等于中位数的值,p 值可能会对 ties 的选择敏感。