attr_sparse_matrix#
- attr_sparse_matrix(G, edge_attr=None, node_attr=None, normalized=False, rc_order=None, dtype=None)[source]#
返回一个使用G的属性构建的SciPy稀疏数组。
如果仅传入
G
,则构建邻接矩阵。设A为节点属性
node_attr
的离散值集合。那么A的元素表示构建矩阵的行和列。现在,遍历G
中的每条边e=(u,v)并考虑边属性edge_attr
的值。如果ua和va分别是节点u和v的节点属性node_attr
的值,那么边属性的值将添加到矩阵元素(ua, va)中。- Parameters:
- G图
用于构建NumPy矩阵的NetworkX图。
- edge_attrstr, 可选
矩阵的每个元素表示指定边属性的累计值,这些边属性的节点属性对应于矩阵的行/列。该属性必须存在于图中的所有边上。如果没有指定属性,则我们只计算节点属性对应于矩阵元素的边的数量。
- node_attrstr, 可选
矩阵的每一行和每一列表示节点属性的特定值。该属性必须存在于图中的所有节点上。注意,此属性的值应该是可靠的可哈希的。因此,不建议使用浮点值。如果没有指定属性,则行和列将是图的节点。
- normalizedbool, 可选
如果为True,则每一行按其值的总和进行归一化。
- rc_orderlist, 可选
节点属性值的列表。此列表指定数组的行和列的顺序。如果没有提供顺序,则顺序将是随机的(并且也是一个返回值)。
- Returns:
- MSciPy稀疏数组
属性矩阵。
- orderinglist
如果指定了
rc_order
,则仅返回矩阵。然而,如果rc_order
为None,则还会返回用于构建矩阵的顺序。
- Other Parameters:
- dtypeNumPy数据类型, 可选
用于初始化数组的有效NumPy数据类型。请记住,某些数据类型如果在归一化数组时可能会产生意外结果。该参数传递给numpy.zeros()。如果未指定,则使用NumPy默认值。
Examples
构建一个邻接矩阵:
>>> G = nx.Graph() >>> G.add_edge(0, 1, thickness=1, weight=3) >>> G.add_edge(0, 2, thickness=2) >>> G.add_edge(1, 2, thickness=3) >>> M = nx.attr_sparse_matrix(G, rc_order=[0, 1, 2]) >>> M.toarray() array([[0., 1., 1.], [1., 0., 1.], [1., 1., 0.]])
或者,我们可以获取描述边厚度的矩阵。
>>> M = nx.attr_sparse_matrix(G, edge_attr="thickness", rc_order=[0, 1, 2]) >>> M.toarray() array([[0., 1., 2.], [1., 0., 3.], [2., 3., 0.]])
我们还可以给节点上色并获取所有边(u,v)的概率分布,描述:
Pr(v有颜色Y | u有颜色X)
>>> G.nodes[0]["color"] = "red" >>> G.nodes[1]["color"] = "red" >>> G.nodes[2]["color"] = "blue" >>> rc = ["red", "blue"] >>> M = nx.attr_sparse_matrix(G, node_attr="color", normalized=True, rc_order=rc) >>> M.toarray() array([[0.33333333, 0.66666667], [1. , 0. ]])
例如,上述结果告诉我们对于所有边(u,v):
Pr( v是红色 | u是红色) = 1/3 Pr( v是蓝色 | u是红色) = 2/3
Pr( v是红色 | u是蓝色) = 1 Pr( v是蓝色 | u是蓝色) = 0
最后,我们可以获取按节点颜色列出的总权重。
>>> M = nx.attr_sparse_matrix(G, edge_attr="weight", node_attr="color", rc_order=rc) >>> M.toarray() array([[3., 2.], [2., 0.]])
因此,所有边(u,v)的总权重,其中u和v具有颜色:
(红色, 红色) 是 3 # 唯一的贡献来自边(0,1) (红色, 蓝色) 是 2 # 来自边(0,2)和(1,2)的贡献 (蓝色, 红色) 是 2 # 与(红色, 蓝色)相同,因为图是无向的 (蓝色, 蓝色) 是 0 # 没有蓝色端点的边