bethe_hessian_matrix#
- bethe_hessian_matrix(G, r=None, nodelist=None)[source]#
返回图 G 的 Bethe Hessian 矩阵。
Bethe Hessian 是一族由参数 r 定义的矩阵,定义为 H(r) = (r^2 - 1) I - r A + D,其中 A 是邻接矩阵,D 是节点度的对角矩阵,I 是单位矩阵。当正则化参数 r = 1 时,它等于图拉普拉斯矩阵。
默认的正则化参数选择应该是比值 [2]
\[r_m = \left(\sum k_i \right)^{-1}\left(\sum k_i^2 \right) - 1\]- Parameters:
- G图
一个 NetworkX 图
- r浮点数
正则化参数
- nodelist列表, 可选
行和列按照 nodelist 中的节点顺序排列。 如果 nodelist 为 None,则顺序由
G.nodes()
生成。
- Returns:
- Hscipy.sparse.csr_array
图
G
的 Bethe Hessian 矩阵,参数为r
。
See also
bethe_hessian_spectrum
adjacency_matrix
laplacian_matrix
References
[1]A. Saade, F. Krzakala 和 L. Zdeborová “Spectral Clustering of Graphs with the Bethe Hessian”, Advances in Neural Information Processing Systems, 2014.
[2]C. M. Le, E. Levina “Estimating the number of communities in networks by spectral methods” arXiv:1507.00827, 2015.
Examples
>>> k = [3, 2, 2, 1, 0] >>> G = nx.havel_hakimi_graph(k) >>> H = nx.bethe_hessian_matrix(G) >>> H.toarray() array([[ 3.5625, -1.25 , -1.25 , -1.25 , 0. ], [-1.25 , 2.5625, -1.25 , 0. , 0. ], [-1.25 , -1.25 , 2.5625, 0. , 0. ], [-1.25 , 0. , 0. , 1.5625, 0. ], [ 0. , 0. , 0. , 0. , 0.5625]])
Additional backends implement this function
graphblas : OpenMP-enabled sparse linear algebra backend.