scipy.stats.
yeojohnson_llf#
- scipy.stats.yeojohnson_llf(lmb, data)[源代码][源代码]#
yeojohnson 对数似然函数。
- 参数:
- lmb标量
Yeo-Johnson 变换的参数。详情请参见
yeojohnson
。- 数据array_like
用于计算 Yeo-Johnson 对数似然的数据。如果 data 是多维的,则对数似然沿第一个轴计算。
- 返回:
- llf浮动
给定 lmb 的 data 的 Yeo-Johnson 对数似然。
注释
Yeo-Johnson 对数似然函数在此定义为
\[llf = -N/2 \log(\hat{\sigma}^2) + (\lambda - 1) \sum_i \text{ sign }(x_i)\log(|x_i| + 1)\]其中 \(\hat{\sigma}^2\) 是 Yeo-Johnson 变换后的输入数据
x
的估计方差。Added in version 1.2.0.
示例
>>> import numpy as np >>> from scipy import stats >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> from mpl_toolkits.axes_grid1.inset_locator import inset_axes
生成一些随机变量,并为一系列
lmbda
值计算它们的 Yeo-Johnson 对数似然值:>>> x = stats.loggamma.rvs(5, loc=10, size=1000) >>> lmbdas = np.linspace(-2, 10) >>> llf = np.zeros(lmbdas.shape, dtype=float) >>> for ii, lmbda in enumerate(lmbdas): ... llf[ii] = stats.yeojohnson_llf(lmbda, x)
同时使用
yeojohnson
找到最佳的 lmbda 值:>>> x_most_normal, lmbda_optimal = stats.yeojohnson(x)
绘制对数似然函数随 lmbda 变化的曲线。添加最佳 lmbda 作为水平线,以检查那确实是最佳值:
>>> fig = plt.figure() >>> ax = fig.add_subplot(111) >>> ax.plot(lmbdas, llf, 'b.-') >>> ax.axhline(stats.yeojohnson_llf(lmbda_optimal, x), color='r') >>> ax.set_xlabel('lmbda parameter') >>> ax.set_ylabel('Yeo-Johnson log-likelihood')
现在添加一些概率图来显示,在最大化对数似然的地方,使用
yeojohnson
变换的数据看起来最接近正态分布:>>> locs = [3, 10, 4] # 'lower left', 'center', 'lower right' >>> for lmbda, loc in zip([-1, lmbda_optimal, 9], locs): ... xt = stats.yeojohnson(x, lmbda=lmbda) ... (osm, osr), (slope, intercept, r_sq) = stats.probplot(xt) ... ax_inset = inset_axes(ax, width="20%", height="20%", loc=loc) ... ax_inset.plot(osm, osr, 'c.', osm, slope*osm + intercept, 'k-') ... ax_inset.set_xticklabels([]) ... ax_inset.set_yticklabels([]) ... ax_inset.set_title(r'$\lambda=%1.2f$' % lmbda)
>>> plt.show()