scipy.stats.nchypergeom_fisher#
- scipy.stats.nchypergeom_fisher = <scipy.stats._discrete_distns.nchypergeom_fisher_gen object>[源代码]#
Fisher 的非中心超几何离散随机变量。
Fisher 的非中心超几何分布模型从箱子中抽取两种类型的对象。M 是对象的总数,n 是类型 I 对象的数量,odds 是赔率比:当每种类型只有一个对象时,选择类型 I 对象而不是类型 II 对象的赔率。随机变量表示如果我们一次从箱子中抓取一些对象,并在事后发现我们抓取了 N 个对象,那么抓取的类型 I 对象的数量。
作为
rv_discrete
类的一个实例,nchypergeom_fisher
对象继承了它的一系列通用方法(完整列表见下文),并根据此特定分布的细节对其进行了补充。方法
rvs(M, n, N, odds, loc=0, size=1, random_state=None)
随机变量。
pmf(k, M, n, N, odds, loc=0)
概率质量函数。
logpmf(k, M, n, N, odds, loc=0)
概率质量函数的对数。
cdf(k, M, n, N, odds, loc=0)
累积分布函数。
logcdf(k, M, n, N, odds, loc=0)
累积分布函数的对数。
sf(k, M, n, N, odds, loc=0)
生存函数 (也定义为
1 - cdf
,但 sf 有时更精确)。logsf(k, M, n, N, odds, loc=0)
生存函数的对数。
ppf(q, M, n, N, odds, loc=0)
百分点函数(
cdf
的逆函数 — 百分位数)。isf(q, M, n, N, odds, loc=0)
逆生存函数(
sf
的逆函数)。stats(M, n, N, odds, loc=0, moments=’mv’)
均值(‘m’)、方差(‘v’)、偏度(‘s’) 和/或 峰度(‘k’)。
entropy(M, n, N, odds, loc=0)
(微分)随机变量的熵。
expect(func, args=(M, n, N, odds), loc=0, lb=None, ub=None, conditional=False)
函数(单参数)相对于分布的期望值。
median(M, n, N, odds, loc=0)
分布的中位数。
mean(M, n, N, odds, loc=0)
分布的均值。
var(M, n, N, odds, loc=0)
分布的方差。
std(M, n, N, odds, loc=0)
分布的标准差。
interval(confidence, M, n, N, odds, loc=0)
在中位数周围等面积的置信区间。
注释
设数学符号 \(N\)、\(n\) 和 \(M\) 分别对应于上述定义的参数 N、n 和 M。
概率质量函数定义为
\[p(x; M, n, N, \omega) = \frac{\binom{n}{x}\binom{M - n}{N-x}\omega^x}{P_0},\]对于 \(x \in [x_l, x_u]\),\(M \in {\mathbb N}\),\(n \in [0, M]\),\(N \in [0, M]\),\(\omega > 0\),其中 \(x_l = \max(0, N - (M - n))\),\(x_u = \min(N, n)\)
\[P_0 = \sum_{y=x_l}^{x_u} \binom{n}{y}\binom{M - n}{N-y}\omega^y,\]而二项式系数定义为
\[\binom{n}{k} \equiv \frac{n!}{k! (n - k)!}.\]nchypergeom_fisher
使用了 Agner Fog 的 BiasedUrn 包,并获得了在其许可下根据 SciPy 的许可证进行分发的权限。用于表示形状参数的符号(N、n 和 M)并没有被普遍接受;它们的选择是为了与
hypergeom
保持一致。需要注意的是,Fisher 的非中心超几何分布与 Wallenius 的非中心超几何分布不同,后者模拟从箱子中逐一抽取预定数量的 N 个对象。然而,当优势比为 1 时,这两种分布都简化为普通超几何分布。
上述概率质量函数是以“标准化”形式定义的。要移动分布,请使用
loc
参数。具体来说,nchypergeom_fisher.pmf(k, M, n, N, odds, loc)
完全等价于nchypergeom_fisher.pmf(k - loc, M, n, N, odds)
。参考文献
[1]Agner Fog, “偏倚瓮理论”。https://cran.r-project.org/web/packages/BiasedUrn/vignettes/UrnTheory.pdf
[2]“费希尔非中心超几何分布”,维基百科,https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher’s_noncentral_hypergeometric_distribution
示例
>>> import numpy as np >>> from scipy.stats import nchypergeom_fisher >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> fig, ax = plt.subplots(1, 1)
计算前四个矩:
>>> M, n, N, odds = 140, 80, 60, 0.5 >>> mean, var, skew, kurt = nchypergeom_fisher.stats(M, n, N, odds, moments='mvsk')
显示概率质量函数 (
pmf
):>>> x = np.arange(nchypergeom_fisher.ppf(0.01, M, n, N, odds), ... nchypergeom_fisher.ppf(0.99, M, n, N, odds)) >>> ax.plot(x, nchypergeom_fisher.pmf(x, M, n, N, odds), 'bo', ms=8, label='nchypergeom_fisher pmf') >>> ax.vlines(x, 0, nchypergeom_fisher.pmf(x, M, n, N, odds), colors='b', lw=5, alpha=0.5)
或者,分布对象可以被调用(作为函数)来固定形状和位置。这将返回一个持有给定参数固定的“冻结”RV对象。
冻结分布并显示冻结的
pmf
:>>> rv = nchypergeom_fisher(M, n, N, odds) >>> ax.vlines(x, 0, rv.pmf(x), colors='k', linestyles='-', lw=1, ... label='frozen pmf') >>> ax.legend(loc='best', frameon=False) >>> plt.show()
检查
cdf
和ppf
的准确性:>>> prob = nchypergeom_fisher.cdf(x, M, n, N, odds) >>> np.allclose(x, nchypergeom_fisher.ppf(prob, M, n, N, odds)) True
生成随机数:
>>> r = nchypergeom_fisher.rvs(M, n, N, odds, size=1000)