AlignerDTWfromDist#

class AlignerDTWfromDist(dist_trafo, step_pattern='symmetric2', window_type='none', open_begin=False, open_end=False)[源代码][源代码]#

使用成对变换器的 dtw-python 对齐器接口。

使用变换器计算传递给对齐的距离矩阵。

参数:
dist_trafo: 遵循成对变换器模板的估计器

即,实现模板 BasePairwiseTransformer 的具体类实例

step_patternstr, 可选, 默认 = “symmetric2”,

或 dtw_python 步模式对象,可选的时间扭曲使用的步模式之一:’symmetric1’, ‘symmetric2’ (默认), ‘asymmetric’, 以及数十种其他更多非标准的步模式;可以通过调用 help(stepPattern) 显示列表

window_type: str 可选, 默认 = “none”

所选的窗口函数 “none”, “itakura”, “sakoechiba”, 或 “slantedband” “none” (默认) - 无窗口 “sakoechiba” - 主对角线周围的带状区域 “slantedband” - 倾斜对角线周围的带状区域 “itakura” - Itakura 平行四边形

开始开放布尔值,可选,默认=False
open_end: 布尔值, 可选, 默认=False

是否执行开放式对齐 open_begin = 对齐是否在开始时开放(低索引) open_end = 对齐是否在结束时开放(高索引)

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

方法

check_is_fitted()

检查估计器是否已被拟合。

clone()

获取具有相同超参数的对象副本。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

如果可能,构造 Estimator 实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

fit(X[, Z])

将给定的序列/序列进行拟合对齐。

get_aligned()

返回传递给 fit 的序列的对齐版本。

get_alignment()

返回传递给 fit 的序列/系列的排列(iloc 索引)。

get_alignment_loc()

返回传递给fit的序列/系列的排列(loc索引)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

获取类标签的值。

get_class_tags()

从类及其所有父类中获取类标签。

get_config()

获取 self 的配置标志

get_distance()

返回对齐的总体距离。

get_distance_matrix()

返回对齐的距离矩阵。

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

get_tags()

从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。

get_test_params([parameter_set])

AlignerDTWdist 的测试参数。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器中加载对象。

reset()

将对象重置为初始化后的干净状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

set_tags(**tag_dict)

将动态标签设置为给定值。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#

AlignerDTWdist 的测试参数。

check_is_fitted()[源代码]#

检查估计器是否已被拟合。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取具有相同超参数的对象副本。

克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 存在错误,将引发 RuntimeError。

注释

如果成功,值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

参数:
估计器继承自 BaseEstimator 的估计器
标签名称str 或 str 列表,默认 = None

要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,更改对象状态为 self 中的动态标签。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

如果可能,构造 Estimator 实例。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
实例使用默认参数的类实例

注释

get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并用该字典构建对象。

classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 的实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

名称list of str, 与 objs 长度相同

第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i},如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}

fit(X, Z=None)[源代码]#

将给定的序列/序列进行拟合对齐。

状态变化:

将状态更改为“已拟合”。

写给自己:

将 self._is_fitted 标志设置为 True。分别将 XZ 存储到 self._X 和 self._Z 中。设置以 “_” 结尾的拟合模型属性。

参数:
X长度为 n 的 pd.DataFrame (Series) 列表

系列对齐的集合

Z包含 n 行的 pd.DataFrame,可选

元数据,Z 的第 i 行对应于 X 的第 i 个元素

get_aligned()[源代码]#

返回传递给 fit 的序列的对齐版本。

行为:返回传递给 fit 的 X 中未对齐序列的对齐版本

模型应处于拟合状态,拟合的模型参数从自身读取

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

在自身中的访问:

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
X_aligned_list: 按顺序排列的 pd.DataFrame 列表

长度为 n,对应于传递给拟合的 X 的索引,第 i 个元素被重新索引,X[i] 的对齐版本

get_alignment()[源代码]#

返回传递给 fit 的序列/系列的排列(iloc 索引)。

行为:返回传递给 fit 的序列 X 的对齐方式

模型应处于拟合状态,拟合的模型参数从自身读取

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

在自身中的访问:

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) 其中 i 为整数

cols 包含 X[i] 的 iloc 索引映射到对齐坐标的对齐坐标

get_alignment_loc()[源代码]#

返回传递给fit的序列/系列的排列(loc索引)。

行为:返回传递给 fit 的序列 X 的对齐方式

模型应处于拟合状态,拟合的模型参数从自身读取

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

在自身中的访问:

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
对齐格式的 pd.DataFrame,列名为 ‘ind’+str(i) 其中 i 为整数

cols 包含 X[i] 的 loc 索引,映射到对齐的坐标以进行对齐

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

获取类标签的值。

不返回从实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

参数:
标签名称str

标签值的名称。

tag_value_default任何

如果未找到标签,则使用默认/回退值。

返回:
标签值

self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类及其所有父类中获取类标签。

从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回从实例中定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

返回:
collected_tags字典

类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。

get_config()[源代码]#

获取 self 的配置标志

返回:
config_dict字典

配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _onfig_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_distance()[源代码]#

返回对齐的总体距离。

行为:返回对应于对齐的总距离

并非所有对齐器都会返回或实现这个(可选的)

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

在自身中的访问:

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
distance: float - 传递给fit的X的所有元素之间的总距离
get_distance_matrix()[源代码]#

返回对齐的距离矩阵。

行为:返回对齐距离的成对距离矩阵

并非所有对齐器都会返回或实现这个(可选的)

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

在自身中的访问:

以“_”结尾的拟合模型属性。self._is_fitted

返回:
distmat: 一个 (n x n) 的 np.array 浮点数组,其中 n 是传递给 fit 的 X 的长度

[i,j] 项是 X[i] 和 X[j] 之间的对齐距离,传递给 fit

get_fitted_params(deep=True)[源代码]#

获取拟合参数。

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回一个包含参数名称和值的字典,包括可拟合组件的拟合参数(= BaseEstimator 值的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的拟合参数。

返回:
fitted_params带有字符串键的字典

拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • always: 该对象的所有拟合参数,通过 get_param_names 获取的值是该对象对应键的拟合参数值。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以 paramname 及其值的形式出现。

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中所有在 __init__ 中定义了默认值的参数,值是这些参数在 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
排序bool, 默认=True

是否按字母顺序返回参数名称(True),或按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回(False)。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按其在类 __init__ 中出现的顺序排列。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为真,将返回一个参数名称 : 值的字典,包括此对象的参数和组件的参数(= 值为 BaseObject 的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。

返回:
参数带有字符串键的字典

参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • 总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值始终与构造时传递的值相同。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数以 paramname 及其值的形式出现。

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

参数:
标签名称str

要检索的标签名称

tag_value_default任意类型,可选;默认=None

如果未找到标签,则使用默认/回退值

raise_error布尔

当未找到标签时,是否会引发 ValueError

返回:
标签值任何

self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,如果 raise_error 为 True,则返回错误,否则返回 tag_value_default

引发:
如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
self.get_tags().keys()
get_tags()[源代码]#

从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。

返回:
collected_tags字典

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

一个对象是否具有任何值为 BaseObjects 的参数。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化自身,结果输出到 path ,通过 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化的内存容器中加载对象。

参数:
serial : cls.save(None) 输出的第一个元素输出中的第一个元素
返回:
反序列化自身,结果输出为 serial,来自 cls.save(None)
reset()[源代码]#

将对象重置为初始化后的干净状态。

使用 reset,使用超参数的当前值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:

  • 超参数 = __init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串”__”

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

返回:
自身

类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

注释

等同于 sklearn.clone,但会覆盖 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

行为:如果 path 是 None,则返回内存中的序列化自身;如果 path 是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。

保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。

参数:
路径无或文件位置(字符串或路径)

如果为 None,则将 self 保存到内存中的对象;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:

path=”estimator” 则会在当前工作目录下生成一个名为 estimator.zip 的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 则会在 /home/stored/ 目录下存储一个名为 estimator.zip 的压缩文件。

serialization_format: str, default = “pickle”

用于序列化的模块。可用的选项是 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软件依赖项。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的自身
如果 path 是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dict字典

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:

显示str, “diagram” (默认), 或 “text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 盒子图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool, 默认=True

是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或者打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,而不影响组件估计器。

警告str, “on” (默认), 或 “off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会从 sktime 引发警告

后端:并行str, 可选, 默认=”None”

在广播/矢量化时用于并行化的后端,可选之一

  • “None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”: 使用 dask,需要在环境中安装 dask

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (不传递参数)

传递给并行化后端的额外参数作为配置。有效键取决于 backend:parallel 的值:

  • “None”: 没有额外参数, backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认的 joblib 后端 任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,除了 backend 直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何 joblib.Parallel 的有效键都可以在这里传递,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”: 任何 dask.compute 的有效键都可以传递,例如 scheduler

返回:
self对自身的引用。

注释

改变对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单估计器以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串 <component>__<parameter> 来访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果这使得引用明确,例如没有两个组件的参数名称相同,也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**参数字典

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。如果 get_params 键中唯一,__ 后缀可以别名为完整字符串。

返回:
self引用自身(在参数设置之后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

通过 estimator.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将其设置为由 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 的链式哈希采样得到,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 estimator 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时应用于剩余的组件估计器。

注意:即使 self 没有 random_state,或者没有任何组件有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 估计器,即使那些没有 random_state 参数的估计器。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。

深度bool, 默认=True

是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置 random_state 参数。

self_policystr, 可选值为 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为 “copy”
  • “复制” : estimator.random_state 被设置为输入 random_state

  • “保持” : estimator.random_state 保持不变

  • “new” : estimator.random_state 被设置为一个新的随机状态,

源自输入 random_state,并且通常与它不同

返回:
self自我引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将动态标签设置为给定值。

参数:
**标签字典字典

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。