SignatureKernel#

class SignatureKernel(kernel=None, level=2, degree=1, theta=1, normalize=False, lowrank=False, rankbound=inf)[源代码][源代码]#

时间序列签名核,包括高阶和低秩变体。

实现了Kiraly等人的签名核,参见[R514c10b34fe5-1]_和[R514c10b34fe5-2]_,包括其中描述的高阶和低秩近似变体。

参数:
内核sktime 成对(表格)转换器,可调用对象,或 None

inner (tabular) 核函数用于签名序列核函数中,如果可调用:函数 (2D np.ndarray x 2D np.ndarray) -> 2D np.ndarray 成对核函数,矩阵大小 (n, d) x (m, d) -> (n x m) 可选,默认 = None = 带有比例参数 1 的欧几里得 (线性) 核函数

级别int, 可选, 默认 = 2

一个大于等于1的整数,表示顺序核的截断级别

int, 可选, 默认 = 1

一个大于等于1的整数,表示顺序核近似的顺序,只有在 lowrank = False 时才能设置,否则将被忽略(总是 = 1)

thetafloat, 可选, 默认=1.0

一个正的级别缩放因子,第 i 级按 theta^i 缩放

标准化bool, 可选, 默认 = False

如果为 True,输出的核矩阵是否归一化,总和和累积和将除以 prod(K.shape)

低秩bool, 可选, 默认 = False

是否在计算核函数时使用低秩近似

rankboundint, 可选, 默认 = 无穷大

仅当 lowrank = True 时,使用的级别矩阵的秩的硬阈值

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

参考文献

[1]

F. Kiraly, H. Oberhauser. 2016. “Kernels for sequentially ordered data.”, arXiv: 1601.08169.

[2]

F. Kiraly, H. Oberhauser. 2019. “Kernels for sequentially ordered data.”, Journal of Machine Learning Research.

方法

__call__(X[, X2])

计算距离/核矩阵,调用简写。

check_is_fitted()

检查估计器是否已被拟合。

clone()

获取一个具有相同超参数的对象副本。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

如果可能,构造估计器实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

fit([X, X2])

接口兼容的Fit方法(内部无逻辑)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

获取类标签的值。

get_class_tags()

从类及其所有父类中获取类标签。

get_config()

获取 self 的配置标志

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

get_tags()

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器加载对象。

reset()

将对象重置为初始化后的干净状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

set_tags(**tag_dict)

将动态标签设置为给定值。

transform(X[, X2])

计算距离/核矩阵。

transform_diag(X)

计算距离/核矩阵的对角线。

check_is_fitted()[源代码]#

检查估计器是否已被拟合。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取一个具有相同超参数的对象副本。

克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 存在错误,将引发 RuntimeError。

注释

如果成功,值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

参数:
估计器继承自 BaseEstimator 的估计器
标签名称str 或 str 列表, 默认 = None

要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,改变对象状态为动态标签于 self 中。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

如果可能,构造估计器实例。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
实例使用默认参数的类实例

注释

get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并使用该字典构建对象。

classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

名称list of str, 与 objs 长度相同

第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i} 如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}

fit(X=None, X2=None)[源代码]#

接口兼容的Fit方法(内部无逻辑)。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

获取类标签的值。

不返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

参数:
标签名称str

标签值的名称。

tag_value_default任何

如果未找到标签,则使用默认/回退值。

返回:
标签值

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类及其所有父类中获取类标签。

从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回在实例上通过 set_tags 或 clone_tags 设置的动态标签信息。

返回:
collected_tagsdict

类标签名称:标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。

get_config()[源代码]#

获取 self 的配置标志

返回:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[源代码]#

获取拟合参数。

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括可拟合组件的拟合参数(= 值为 BaseEstimator 的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的拟合参数。

返回:
fitted_params带有字符串键的字典

拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • always: 该对象的所有拟合参数,通过 get_param_names 获取的值是该对象对应键的拟合参数值。

  • 如果 deep=True,还将包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以其值作为 paramname 出现。

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如 [componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中所有在 __init__ 中定义了默认值的参数,值是 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
排序bool, 默认=True

是否按字母顺序返回参数名称(True),或按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回(False)。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按它们在类 __init__ 中出现的顺序排列。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。

返回:
参数带有字符串键的字典

参数字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • 总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值始终与构造时传递的值相同。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [组件名称]__[参数名称],所有 组件名称 的参数都以其值作为 参数名称 出现。

  • 如果 deep=True,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

参数:
标签名称str

要检索的标签名称

tag_value_default任何类型,可选;默认=None

如果未找到标签,则使用默认/回退值

raise_error布尔

当未找到标签时是否引发 ValueError

返回:
标签值任何

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时返回错误,否则返回 tag_value_default

引发:
如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
self.get_tags().keys()
get_tags()[源代码]#

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

返回:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承收集自 _tags 类属性,然后是 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试中。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 "default" 集。目前没有为距离/核变换器保留的值。

返回:
参数字典或字典列表,默认 = {}

创建类的测试实例的参数 每个字典都是构造一个“有趣的”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

一个对象是否具有任何值为 BaseObjects 的参数。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化自身,结果输出到 path,通过 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化的内存容器加载对象。

参数:
serial : cls.save(None) 输出的第一个元素输出中的第一个元素
返回:
反序列化自身,产生输出 serial,来自 cls.save(None)
reset()[源代码]#

将对象重置为初始化后的干净状态。

使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:

  • 超参数 = __init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串”__”

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

返回:
自身

类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

注释

等同于 sklearn.clone 但覆盖了 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

行为:如果 path 为 None,则返回内存中的序列化自身;如果 path 是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。

保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。

参数:
路径无或文件位置(字符串或路径)

如果为 None,则将 self 保存到内存对象中;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:

path=”estimator” 那么会在当前工作目录下生成一个名为 estimator.zip 的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 那么会在 /home/stored/ 目录下存储一个名为 estimator.zip 的压缩文件。

serialization_format: str, default = “pickle”

用于序列化的模块。可用的选项是 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的自身
如果 path 是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:

显示str, “diagram” (默认), 或 “text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 盒子图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool, 默认=True

是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或者打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,不影响组件估计器。

警告str, “on” (默认), 或 “off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会从 sktime 引发警告

backend:parallelstr, 可选, 默认=”None”

在广播/矢量化时用于并行化的后端,为以下之一

  • “None”: 顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”: 使用 dask,需要在环境中安装 dask

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递参数)

传递给并行化后端的额外参数作为配置。有效键取决于 backend:parallel 的值:

  • “None”: 没有额外参数,backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认 joblib 后端 任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,除了 backend 直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何 joblib.Parallel 的有效键都可以在这里传递,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”:任何 dask.compute 的有效键都可以传递,例如,scheduler

返回:
self对自身的引用。

注释

更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单估计器以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串 <component>__<parameter> 来访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果这使得引用明确,例如没有两个组件的参数名称相同,也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**参数dict

BaseObject 参数,键必须是 <组件>__<参数> 字符串。如果 get_params 键中唯一,__ 后缀可以别名为完整字符串。

返回:
self引用自身(在参数设置之后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

通过 estimator.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将其设置为由 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 的链式哈希采样得到,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 estimator 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时应用于剩余的组件估计器。

注意:即使 self 没有 random_state,或者没有任何组件具有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 估计器,即使它们没有 random_state 参数。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。

深度bool, 默认=True

是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置 random_state 参数。

self_policystr, 可选值为 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为 “copy”
  • “复制” : estimator.random_state 被设置为输入的 random_state

  • “保持”:estimator.random_state 保持不变

  • “new” : estimator.random_state 被设置为一个新随机状态,

源自输入 random_state,并且通常与其不同

返回:
self自我引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将动态标签设置为给定值。

参数:
**标签字典dict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。

transform(X, X2=None)[源代码]#

计算距离/核矩阵。

行为:返回成对距离/核矩阵

在 X 和 X2 样本之间(如果未传递,则等于 X)

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,类型为以下Python类型:

系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

subject to sktime mtype 格式规范,详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X2系列或面板,任何支持的 mtype,m 个实例

可选,默认值:X = X2

要转换的数据,类型为以下Python类型:

系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

subject to sktime mtype 格式规范,详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X 和 X2 不需要具有相同的 mtype

返回:
distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array

(i,j)-th 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核

transform_diag(X)[源代码]#

计算距离/核矩阵的对角线。

行为:返回 X 中样本的距离/核矩阵的对角线

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,类型为以下Python类型:

系列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有 2 级 MultiIndex 的 pd.DataFrame, pd.DataFrame 列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

subject to sktime mtype 格式规范,详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

返回:
diag: 形状为 [n] 的 np.array

第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核