TimeSeriesKMeansTslearn#
- class TimeSeriesKMeansTslearn(n_clusters=3, max_iter=50, tol=1e-06, n_init=1, metric='euclidean', max_iter_barycenter=100, metric_params=None, n_jobs=None, dtw_inertia=False, verbose=0, random_state=None, init='random')[源代码][源代码]#
时间序列数据的K-means聚类,来自tslearn。
直接接口到
tslearn.clustering.TimeSeriesKMeans
。- 参数:
- n_clustersint (默认值: 3)
要形成的聚类数量。
- max_iterint (默认值: 50)
k-means 算法单次运行的最大迭代次数。
- tolfloat (默认值: 1e-6)
惯性变化阈值。如果在某一点,惯性在两次连续迭代之间的变化小于此阈值,则认为模型已收敛,算法停止。
- n_initint (默认值: 1)
k-means 算法将以不同的质心种子运行多次。最终结果将是 n_init 次连续运行中惯性最小的最佳输出。
- 指标
euclidean
,dtw
,softdtw
(默认:euclidean
) 用于聚类分配和质心计算的度量标准。如果使用“dtw”,则质心计算使用DBA。
- max_iter_barycenterint (默认值: 100)
重心计算过程的迭代次数。仅在
metric="dtw"
或metric="softdtw"
时使用。- metric_params字典或无(默认:无)
所选指标的参数值。对于接受交叉距离矩阵计算并行化的指标,
metric_params
中传递的n_jobs
键会被n_jobs
参数覆盖。- n_jobsint 或 None, 可选 (默认=None)
用于交叉距离矩阵计算的并行运行的作业数量。如果交叉距离矩阵不能使用并行化计算,则忽略此参数。
None
表示 1,除非在joblib.parallel_backend
上下文中。-1
表示使用所有处理器。更多详情请参见 scikit-learn 的 术语表。- dtw_inertia: bool (默认: False)
即使DTW不是选定的度量标准,是否计算DTW惯性。
- 详细int (默认值: 0)
如果非零,则在学习模型时打印惯性信息,并打印 joblib 进度消息。
- random_state整数或 numpy.RandomState,可选
用于初始化中心的生成器。如果给定一个整数,它将固定种子。默认为全局 numpy 随机数生成器。
- 初始化{‘k-means++’, ‘random’ 或一个 ndarray} (默认: ‘random’)
初始化方法:’k-means++’ : 使用 k-means++ 启发式。更多信息请参见 scikit-learn 的 k_init_。’random’ : 从数据中随机选择 k 个观测值(行)作为初始质心。如果传递了一个 ndarray,它应该是形状为 (n_clusters, ts_size, d) 并给出初始中心。
- 属性:
- 标签numpy.ndarray
每个点的标签。
- cluster_centers_形状为 (n_clusters, sz, d) 的 numpy.ndarray
聚类中心。如果初始化方法为 ‘k-means++’ 或 ‘random’,则
sz
是拟合时使用的时间序列的大小;如果通过 init 参数以 numpy 数组形式提供初始质心,则sz
是这些初始质心中最长质心的大小。- inertia_float
样本到其最近聚类中心距离的总和。
- n_iter_整数
在拟合过程中执行的迭代次数。
注释
如果
metric
设置为"euclidean"
,该算法期望一个等长时间序列的数据集。方法
检查估计器是否已被拟合。
clone
()获取一个具有相同超参数的对象副本。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])如果可能,构造估计器实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表及其名称的列表。
fit
(X[, y])拟合时间序列聚类器到训练数据。
fit_predict
(X[, y])计算集群中心并为每个时间序列预测集群索引。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])获取类标签的值。
从类及其所有父类中获取类标签。
获取 self 的配置标志
get_fitted_params
([deep])获取拟合参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
get_tags
()从估计器类获取标签和动态标签覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化的内存容器中加载对象。
predict
(X[, y])预测X中的每个样本最接近的簇。
预测X中序列的标签概率。
reset
()将对象重置为初始化后的干净状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。
score
(X[, y])评估聚类器的质量。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将动态标签设置为给定值。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回
"default"
集。
- 返回:
- 参数字典或字典列表,默认 = {}
创建类的测试实例的参数 每个字典都是构造一个“有趣的”测试实例的参数,即
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典
- clone()[源代码]#
获取一个具有相同超参数的对象副本。
克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。
- 引发:
- 如果克隆不符合规范,由于
__init__
存在错误,将引发 RuntimeError。
- 如果克隆不符合规范,由于
注释
如果成功,值等于
type(self)(**self.get_params(deep=False))
。
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#
从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
- 参数:
- 估计器继承自
BaseEstimator
的估计器 - 标签名称str 或 str 列表, 默认 = None
要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names。
- 估计器继承自
- 返回:
- 自我
自我引用。
注释
通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#
如果可能,构造估计器实例。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- 实例使用默认参数的类实例
注释
get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并使用该字典构造对象。
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#
创建所有测试实例的列表及其名称的列表。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])
- 名称str 列表,长度与 objs 相同
第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i} 如果有多个实例,否则为 {cls.__name__}
- fit(X, y=None)[源代码]#
拟合时间序列聚类器到训练数据。
- 状态变化:
将状态更改为“已拟合”。
- 写给自己:
将 self.is_fitted 设置为 True。设置以 “_” 结尾的拟合模型属性。
- 参数:
- Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型
时间序列以拟合估计器。
可以是任何
Panel
类型 的 科学 ,例如:pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引
numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]
或其他任何支持的
Panel
mtype
有关mtypes的列表,请参见
datatypes.SCITYPE_REGISTER
有关规范,请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考。
- y忽略,存在是为了API一致性原因。
- 返回:
- self自我引用。
- fit_predict(X, y=None) ndarray [源代码]#
计算集群中心并为每个时间序列预测集群索引。
便捷方法;等同于调用 fit(X) 之后再调用 predict(X)
- 参数:
- Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型
时间序列聚类。
可以是任何
Panel
类型 的 科学 ,例如:pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引
numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]
或其他任何支持的
Panel
mtype
有关mtypes的列表,请参见
datatypes.SCITYPE_REGISTER
有关规范,请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考。
- y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
- 返回:
- np.ndarray (形状为 (n_instances,) 的一维数组)
X 中每个时间序列所属的簇索引。
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#
获取类标签的值。
不返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。
- 参数:
- 标签名称str
标签值的名称。
- tag_value_default任何
如果未找到标签,则使用默认/回退值。
- 返回:
- 标签值
self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default。
- classmethod get_class_tags()[源代码]#
从类及其所有父类中获取类标签。
从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回从实例中定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。
- 返回:
- collected_tagsdict
类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。
- get_config()[源代码]#
获取 self 的配置标志
- 返回:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- get_fitted_params(deep=True)[源代码]#
获取拟合参数。
- 状态要求:
需要状态为“已拟合”。
- 参数:
- 深度bool, 默认=True
是否返回组件的拟合参数。
如果为 True,将返回一个包含参数名称 : 值的字典,包括可拟合组件的拟合参数(= 值为 BaseEstimator 的参数)。
如果为 False,将返回一个包含参数名称 : 值的字典,但不包括组件的拟合参数。
- 返回:
- fitted_params带有字符串键的字典
拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
always: 此对象的所有拟合参数,如通过
get_param_names
获取的值是该键对应的拟合参数值,属于此对象如果
deep=True
,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为[componentname]__[paramname]
,所有componentname
的参数都以其值的形式显示为paramname
。如果
deep=True
,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname]
等。
- classmethod get_param_defaults()[源代码]#
获取对象的参数默认值。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数,值是 __init__ 中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- 排序bool, 默认=True
是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类
__init__
中出现的顺序返回(False)。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls 的参数名称列表。如果
sort=False
,则按它们在类__init__
中出现的顺序排列。如果sort=True
,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[源代码]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- 深度bool, 默认=True
是否返回组件的参数。
如果为真,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。
如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。
- 返回:
- 参数带有字符串键的字典
参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值始终与构造时传递的值相同。
如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],componentname 的所有参数以其值出现为 paramname。
如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#
从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
- 参数:
- 标签名称str
要检索的标签名称
- tag_value_default任何类型,可选;默认=无
如果未找到标签,则使用默认/回退值
- raise_error布尔值
当找不到标签时是否引发 ValueError
- 返回:
- 标签值任何
在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,如果 raise_error 为 True,则返回错误,否则返回 tag_value_default。
- 引发:
- 如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
- self.get_tags().keys()
- get_tags()[源代码]#
从估计器类获取标签和动态标签覆盖。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。
- is_composite()[源代码]#
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
一个对象是否有任何参数的值是 BaseObjects。
- classmethod load_from_path(serial)[源代码]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- 串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出到
path
,通过cls.save(path)
- 反序列化自身,结果输出到
- classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#
从序列化的内存容器中加载对象。
- 参数:
- serial :
cls.save(None)
输出的第一个元素输出结果的第一个元素
- serial :
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出为
serial
,来自cls.save(None)
- 反序列化自身,结果输出为
- predict(X, y=None) ndarray [源代码]#
预测X中的每个样本最接近的簇。
- 参数:
- Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型
时间序列聚类。
可以是任何
Panel
类型 的 科学 ,例如:pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引
numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]
或其他任何支持的
Panel
mtype
有关mtypes的列表,请参见
datatypes.SCITYPE_REGISTER
有关规范,请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考。
- y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
- 返回:
- np.ndarray (形状为 (n_instances,) 的一维数组)
X 中每个时间序列所属的簇索引。
- predict_proba(X)[源代码]#
预测X中序列的标签概率。
默认行为是调用 _predict 并将预测的类别概率设置为 1,其他类别的概率设置为 0。如果可以获得更好的估计,请重写此方法。
- 参数:
- Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型
时间序列聚类。
可以是任何
Panel
类型 的 科学 ,例如:pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引
numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]
或其他任何支持的
Panel
mtype
有关mtypes的列表,请参见
datatypes.SCITYPE_REGISTER
有关规范,请参阅
examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb
并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考。
- 返回:
- y形状为 [n_instances, n_classes] 的二维数组 - 预测的类别概率
1st 维度索引对应于 X 中的实例索引 2nd 维度索引对应于可能的标签(整数) (i, j)-th 条目是预测概率,即第 i 个实例属于第 j 类的概率
- reset()[源代码]#
将对象重置为初始化后的干净状态。
使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:
超参数 = __init__ 的参数
包含双下划线的对象属性,即字符串”__”
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
- 返回:
- 自身
将类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
注释
等同于 sklearn.clone 但覆盖了 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))
- save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#
将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。
行为:如果
path
为 None,则返回内存中的序列化自身;如果path
是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。
- 参数:
- 路径无或文件位置(str 或 Path)
如果为 None,则将 self 保存到内存对象中;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:
path=”estimator” 则会在当前工作目录下生成一个名为
estimator.zip
的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 则会在/home/stored/
目录下存储一个名为estimator.zip
的压缩文件。- serialization_format: str, default = “pickle”
用于序列化的模块。可用的选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中序列化的自身 - 如果
path
是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
- 如果
- score(X, y=None) float [源代码]#
评估聚类器的质量。
- 参数:
- Xnp.ndarray (二维或三维数组,形状为 (n_instances, series_length) 或形状
(n_instances, n_dimensions, series_length)) 或 pd.DataFrame(其中每一列是一个维度,每个单元格是一个 pd.Series(任意数量的维度,等长或不等长序列))。用于训练聚类器的时间序列实例,然后返回每个实例所属的索引。
- y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
- 返回:
- 分数float
聚类器的得分。
- set_config(**config_dict)[源代码]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:
- 显示str, “diagram” (默认), 或 “text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = html 盒子图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_onlybool, 默认=True
是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,不影响组件估计器。
- 警告str, “on” (默认), 或 “off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 不会从 sktime 引发警告
- 后端:并行str, 可选, 默认=”None”
在广播/矢量化时用于并行化的后端,是以下之一
“None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如,spark
“dask”: 使用
dask
,需要在环境中安装dask
包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递参数)
传递给并行化后端的附加参数作为配置。有效键取决于
backend:parallel
的值:“None”: 没有额外参数,
backend_params
被忽略“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认
joblib
后端 任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
,除了backend
直接由backend
控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。任何joblib.Parallel
的有效键都可以在这里传递,例如n_jobs
,在这种情况下,backend
必须作为backend_params
的键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。dask
: 任何dask.compute
的有效键都可以传递,例如,scheduler
- 返回:
- self对自身的引用。
注释
更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[源代码]#
设置此对象的参数。
该方法适用于简单估计器以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串
<component>__<parameter>
来访问组件<component>
中的<parameter>
。如果没有歧义,例如没有两个组件的参数名称都是<parameter>
,也可以使用不带<component>__
的字符串<parameter>
。- 参数:
- **参数dict
BaseObject 参数,键必须是
<组件>__<参数>
字符串。如果 get_params 键中唯一,__ 后缀可以别名完整字符串。
- 返回:
- self引用自身(在参数设置之后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#
为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
estimator.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将其设置为由random_state
派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
的链哈希采样获得,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。根据
self_policy
应用于estimator
中的random_state
参数,并且仅当deep=True
时应用于剩余的组件估计器。注意:即使
self
没有random_state
,或者没有任何组件有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
估计器,即使那些没有random_state
参数的估计器。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。
- 深度bool, 默认=True
是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置random_state
参数。- self_policystr, 可选值为 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为 “copy”
“复制” :
estimator.random_state
被设置为输入random_state
“保持” :
estimator.random_state
保持不变“new” :
estimator.random_state
被设置为一个新随机状态,
派生自输入
random_state
,并且通常与它不同
- 返回:
- self自我引用