TimeSeriesKMeansTslearn#

class TimeSeriesKMeansTslearn(n_clusters=3, max_iter=50, tol=1e-06, n_init=1, metric='euclidean', max_iter_barycenter=100, metric_params=None, n_jobs=None, dtw_inertia=False, verbose=0, random_state=None, init='random')[源代码][源代码]#

时间序列数据的K-means聚类,来自tslearn。

直接接口到 tslearn.clustering.TimeSeriesKMeans

参数:
n_clustersint (默认值: 3)

要形成的聚类数量。

max_iterint (默认值: 50)

k-means 算法单次运行的最大迭代次数。

tolfloat (默认值: 1e-6)

惯性变化阈值。如果在某一点,惯性在两次连续迭代之间的变化小于此阈值,则认为模型已收敛,算法停止。

n_initint (默认值: 1)

k-means 算法将以不同的质心种子运行多次。最终结果将是 n_init 次连续运行中惯性最小的最佳输出。

指标euclidean, dtw, softdtw (默认: euclidean)

用于聚类分配和质心计算的度量标准。如果使用“dtw”,则质心计算使用DBA。

max_iter_barycenterint (默认值: 100)

重心计算过程的迭代次数。仅在 metric="dtw"metric="softdtw" 时使用。

metric_params字典或无(默认:无)

所选指标的参数值。对于接受交叉距离矩阵计算并行化的指标,metric_params 中传递的 n_jobs 键会被 n_jobs 参数覆盖。

n_jobsint 或 None, 可选 (默认=None)

用于交叉距离矩阵计算的并行运行的作业数量。如果交叉距离矩阵不能使用并行化计算,则忽略此参数。None 表示 1,除非在 joblib.parallel_backend 上下文中。-1 表示使用所有处理器。更多详情请参见 scikit-learn 的 术语表

dtw_inertia: bool (默认: False)

即使DTW不是选定的度量标准,是否计算DTW惯性。

详细int (默认值: 0)

如果非零,则在学习模型时打印惯性信息,并打印 joblib 进度消息。

random_state整数或 numpy.RandomState,可选

用于初始化中心的生成器。如果给定一个整数,它将固定种子。默认为全局 numpy 随机数生成器。

初始化{‘k-means++’, ‘random’ 或一个 ndarray} (默认: ‘random’)

初始化方法:’k-means++’ : 使用 k-means++ 启发式。更多信息请参见 scikit-learn 的 k_init_。’random’ : 从数据中随机选择 k 个观测值(行)作为初始质心。如果传递了一个 ndarray,它应该是形状为 (n_clusters, ts_size, d) 并给出初始中心。

属性:
标签numpy.ndarray

每个点的标签。

cluster_centers_形状为 (n_clusters, sz, d) 的 numpy.ndarray

聚类中心。如果初始化方法为 ‘k-means++’ 或 ‘random’,则 sz 是拟合时使用的时间序列的大小;如果通过 init 参数以 numpy 数组形式提供初始质心,则 sz 是这些初始质心中最长质心的大小。

inertia_float

样本到其最近聚类中心距离的总和。

n_iter_整数

在拟合过程中执行的迭代次数。

注释

如果 metric 设置为 "euclidean",该算法期望一个等长时间序列的数据集。

方法

check_is_fitted()

检查估计器是否已被拟合。

clone()

获取一个具有相同超参数的对象副本。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

如果可能,构造估计器实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

fit(X[, y])

拟合时间序列聚类器到训练数据。

fit_predict(X[, y])

计算集群中心并为每个时间序列预测集群索引。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

获取类标签的值。

get_class_tags()

从类及其所有父类中获取类标签。

get_config()

获取 self 的配置标志

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

get_tags()

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器中加载对象。

predict(X[, y])

预测X中的每个样本最接近的簇。

predict_proba(X)

预测X中序列的标签概率。

reset()

将对象重置为初始化后的干净状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

score(X[, y])

评估聚类器的质量。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将动态标签设置为给定值。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 "default" 集。

返回:
参数字典或字典列表,默认 = {}

创建类的测试实例的参数 每个字典都是构造一个“有趣的”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典

check_is_fitted()[源代码]#

检查估计器是否已被拟合。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取一个具有相同超参数的对象副本。

克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 存在错误,将引发 RuntimeError。

注释

如果成功,值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

参数:
估计器继承自 BaseEstimator 的估计器
标签名称str 或 str 列表, 默认 = None

要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

如果可能,构造估计器实例。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
实例使用默认参数的类实例

注释

get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并使用该字典构造对象。

classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

名称str 列表,长度与 objs 相同

第 i 个元素是测试中 obj 的第 i 个实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i} 如果有多个实例,否则为 {cls.__name__}

fit(X, y=None)[源代码]#

拟合时间序列聚类器到训练数据。

状态变化:

将状态更改为“已拟合”。

写给自己:

将 self.is_fitted 设置为 True。设置以 “_” 结尾的拟合模型属性。

参数:
Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型

时间序列以拟合估计器。

可以是任何 Panel 类型科学 ,例如:

  • pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引

  • numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]

  • 或其他任何支持的 Panel mtype

有关mtypes的列表,请参见 datatypes.SCITYPE_REGISTER

有关规范,请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考

y忽略,存在是为了API一致性原因。
返回:
self自我引用。
fit_predict(X, y=None) ndarray[源代码]#

计算集群中心并为每个时间序列预测集群索引。

便捷方法;等同于调用 fit(X) 之后再调用 predict(X)

参数:
Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型

时间序列聚类。

可以是任何 Panel 类型科学 ,例如:

  • pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引

  • numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]

  • 或其他任何支持的 Panel mtype

有关mtypes的列表,请参见 datatypes.SCITYPE_REGISTER

有关规范,请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考

y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
返回:
np.ndarray (形状为 (n_instances,) 的一维数组)

X 中每个时间序列所属的簇索引。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

获取类标签的值。

不返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

参数:
标签名称str

标签值的名称。

tag_value_default任何

如果未找到标签,则使用默认/回退值。

返回:
标签值

self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类及其所有父类中获取类标签。

从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回从实例中定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

返回:
collected_tagsdict

类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。

get_config()[源代码]#

获取 self 的配置标志

返回:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[源代码]#

获取拟合参数。

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回一个包含参数名称 : 值的字典,包括可拟合组件的拟合参数(= 值为 BaseEstimator 的参数)。

  • 如果为 False,将返回一个包含参数名称 : 值的字典,但不包括组件的拟合参数。

返回:
fitted_params带有字符串键的字典

拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • always: 此对象的所有拟合参数,如通过 get_param_names 获取的值是该键对应的拟合参数值,属于此对象

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以其值的形式显示为 paramname

  • 如果 deep=True,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数,值是 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
排序bool, 默认=True

是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回(False)。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按它们在类 __init__ 中出现的顺序排列。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为真,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。

返回:
参数带有字符串键的字典

参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • 总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值始终与构造时传递的值相同。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname]componentname 的所有参数以其值出现为 paramname

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

参数:
标签名称str

要检索的标签名称

tag_value_default任何类型,可选;默认=无

如果未找到标签,则使用默认/回退值

raise_error布尔值

当找不到标签时是否引发 ValueError

返回:
标签值任何

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,如果 raise_error 为 True,则返回错误,否则返回 tag_value_default

引发:
如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
self.get_tags().keys()
get_tags()[源代码]#

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

返回:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

一个对象是否有任何参数的值是 BaseObjects。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化自身,结果输出到 path,通过 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化的内存容器中加载对象。

参数:
serial : cls.save(None) 输出的第一个元素输出结果的第一个元素
返回:
反序列化自身,结果输出为 serial,来自 cls.save(None)
predict(X, y=None) ndarray[源代码]#

预测X中的每个样本最接近的簇。

参数:
Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型

时间序列聚类。

可以是任何 Panel 类型科学 ,例如:

  • pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引

  • numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]

  • 或其他任何支持的 Panel mtype

有关mtypes的列表,请参见 datatypes.SCITYPE_REGISTER

有关规范,请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考

y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
返回:
np.ndarray (形状为 (n_instances,) 的一维数组)

X 中每个时间序列所属的簇索引。

predict_proba(X)[源代码]#

预测X中序列的标签概率。

默认行为是调用 _predict 并将预测的类别概率设置为 1,其他类别的概率设置为 0。如果可以获得更好的估计,请重写此方法。

参数:
Xsktime 兼容的时间序列面板数据容器,属于 Panel 科学类型

时间序列聚类。

可以是任何 Panel 类型科学 ,例如:

  • pd-multiindex: 具有列 = 变量,索引 = pd.MultiIndex 的 pd.DataFrame,其中第一级 = 实例索引,第二级 = 时间索引

  • numpy3D: 3D np.array(任意数量的维度,等长序列),形状为 [n_instances, n_dimensions, series_length]

  • 或其他任何支持的 Panel mtype

有关mtypes的列表,请参见 datatypes.SCITYPE_REGISTER

有关规范,请参阅 examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

并非所有估计器都支持具有多变量或不等长序列的面板,详情请参阅 标签参考

返回:
y形状为 [n_instances, n_classes] 的二维数组 - 预测的类别概率

1st 维度索引对应于 X 中的实例索引 2nd 维度索引对应于可能的标签(整数) (i, j)-th 条目是预测概率,即第 i 个实例属于第 j 类的概率

reset()[源代码]#

将对象重置为初始化后的干净状态。

使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:

  • 超参数 = __init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串”__”

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

返回:
自身

将类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

注释

等同于 sklearn.clone 但覆盖了 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

行为:如果 path 为 None,则返回内存中的序列化自身;如果 path 是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。

保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。

参数:
路径无或文件位置(str 或 Path)

如果为 None,则将 self 保存到内存对象中;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:

path=”estimator” 则会在当前工作目录下生成一个名为 estimator.zip 的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 则会在 /home/stored/ 目录下存储一个名为 estimator.zip 的压缩文件。

serialization_format: str, default = “pickle”

用于序列化的模块。可用的选项有“pickle”和“cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖项。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的自身
如果 path 是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
score(X, y=None) float[源代码]#

评估聚类器的质量。

参数:
Xnp.ndarray (二维或三维数组,形状为 (n_instances, series_length) 或形状

(n_instances, n_dimensions, series_length)) 或 pd.DataFrame(其中每一列是一个维度,每个单元格是一个 pd.Series(任意数量的维度,等长或不等长序列))。用于训练聚类器的时间序列实例,然后返回每个实例所属的索引。

y: 忽略,存在是为了保持API的一致性。
返回:
分数float

聚类器的得分。

set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:

显示str, “diagram” (默认), 或 “text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 盒子图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool, 默认=True

是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,不影响组件估计器。

警告str, “on” (默认), 或 “off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会从 sktime 引发警告

后端:并行str, 可选, 默认=”None”

在广播/矢量化时用于并行化的后端,是以下之一

  • “None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如,spark

  • “dask”: 使用 dask,需要在环境中安装 dask

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (未传递参数)

传递给并行化后端的附加参数作为配置。有效键取决于 backend:parallel 的值:

  • “None”: 没有额外参数,backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认 joblib 后端 任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,除了 backend 直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何 joblib.Parallel 的有效键都可以在这里传递,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • dask: 任何 dask.compute 的有效键都可以传递,例如,scheduler

返回:
self对自身的引用。

注释

更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单估计器以及复合对象。对于复合对象,即包含其他对象的对象,可以使用参数键字符串 <component>__<parameter> 来访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果没有歧义,例如没有两个组件的参数名称都是 <parameter>,也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**参数dict

BaseObject 参数,键必须是 <组件>__<参数> 字符串。如果 get_params 键中唯一,__ 后缀可以别名完整字符串。

返回:
self引用自身(在参数设置之后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 estimator.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将其设置为由 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 的链哈希采样获得,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 estimator 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时应用于剩余的组件估计器。

注意:即使 self 没有 random_state,或者没有任何组件有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 估计器,即使那些没有 random_state 参数的估计器。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。

深度bool, 默认=True

是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置 random_state 参数。

self_policystr, 可选值为 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为 “copy”
  • “复制” : estimator.random_state 被设置为输入 random_state

  • “保持” : estimator.random_state 保持不变

  • “new” : estimator.random_state 被设置为一个新随机状态,

派生自输入 random_state,并且通常与它不同

返回:
self自我引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将动态标签设置为给定值。

参数:
**标签字典dict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。