DtwDistTslearn#

class DtwDistTslearn(global_constraint=None, sakoe_chiba_radius=None, itakura_max_slope=None, n_jobs=None, verbose=0)[源代码][源代码]#

动态时间规整距离,来自 tslearn。

直接接口到 tslearn.metrics.cdist_dtw

参数:
全局约束{“itakura”, “sakoe_chiba”} 或 None(默认:None)

全局约束以限制DTW的允许路径。

sakoe_chiba_radiusint 或 None (默认: None)

用于Sakoe-Chiba带全局约束的半径。如果为None且``global_constraint``设置为``”sakoe_chiba”,则使用半径1。如果同时设置了``sakoe_chiba_radius``和``itakura_max_slope,则使用``global_constraint``来推断在这两者之间使用哪个约束。在这种情况下,如果``global_constraint``对应于无全局约束,则会引发``RuntimeWarning``,并且不使用全局约束。

itakura_max_slope浮点数或 None(默认:None)

Itakura 平行四边形约束的最大斜率。如果为 None 且 global_constraint 设置为 "itakura",则使用最大斜率 2。如果同时设置了 sakoe_chiba_radiusitakura_max_slope,则使用 global_constraint 来推断在这两者之间使用哪个约束。在这种情况下,如果 global_constraint 对应于无全局约束,则会引发 RuntimeWarning,并且不使用全局约束。

n_jobsint 或 None, 可选 (默认=None)

要并行运行的作业数量。None 表示 1,除非在 joblib.parallel_backend 上下文中。-1 表示使用所有处理器。

详细int, 可选 (默认=0)

冗长级别:如果不为零,则打印进度消息。高于50时,输出会发送到stdout。消息的频率随着冗长级别的增加而增加。如果超过10,则报告所有迭代。

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

参考文献

[1]

H. Sakoe, S. Chiba, “Dynamic programming algorithm optimization for spoken word recognition,” IEEE Transactions on Acoustics, Speech and Signal Processing, vol. 26(1), pp. 43–49, 1978.

方法

__call__(X[, X2])

计算距离/核矩阵,调用简写。

check_is_fitted()

检查估计器是否已被拟合。

clone()

获取一个具有相同超参数的对象副本。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

如果可能,构造 Estimator 实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称列表。

fit([X, X2])

接口兼容的拟合方法(内部无逻辑)。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

获取类标签的值。

get_class_tags()

从类及其所有父类中获取类标签。

get_config()

获取 self 的配置标志

get_fitted_params([deep])

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

get_tags()

从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器中加载对象。

reset()

将对象重置为初始化后的干净状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

set_tags(**tag_dict)

将动态标签设置为给定值。

transform(X[, X2])

计算距离/核矩阵。

transform_diag(X)

计算距离/核矩阵的对角线。

classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
参数集str, default=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试中。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 "default" 集。目前没有为距离/核变换器保留的值。

返回:
参数字典或字典列表,默认 = {}

创建类的测试实例的参数 每个字典都是构造一个“有趣”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。 create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典

check_is_fitted()[源代码]#

检查估计器是否已被拟合。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取一个具有相同超参数的对象副本。

克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 存在错误,将引发 RuntimeError。

注释

如果成功,值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

参数:
估计器继承自 BaseEstimator 的估计器
标签名称str 或 str 列表, 默认 = None

要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,改变对象状态,将其作为动态标签存储在 self 中。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

如果可能,构造 Estimator 实例。

参数:
参数集str, default=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
实例使用默认参数的类实例

注释

get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数获取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并使用该字典构建对象。

classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称列表。

参数:
参数集str, default=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

名称list of str, 与 objs 长度相同

第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i},如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}。

fit(X=None, X2=None)[源代码]#

接口兼容的拟合方法(内部无逻辑)。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

获取类标签的值。

不返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

参数:
标签名称str

标签值的名称。

tag_value_default任何

如果未找到标签,则使用默认/回退值。

返回:
标签值

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类及其所有父类中获取类标签。

从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回在实例上通过 set_tags 或 clone_tags 设置的动态标签信息。

返回:
collected_tagsdict

类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。

get_config()[源代码]#

获取 self 的配置标志

返回:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

get_fitted_params(deep=True)[源代码]#

获取拟合参数。

状态要求:

需要状态为“已拟合”。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的拟合参数。

  • 如果为 True,将返回一个字典,键为参数名称,值为该对象的参数值,包括可拟合组件的拟合参数(= BaseEstimator 值的参数)。

  • 如果为 False,将返回一个参数名称 : 值的字典,但不会包含组件的拟合参数。

返回:
fitted_params带有字符串键的字典

拟合参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • always: 此对象的所有拟合参数,通过 get_param_names 获取的值是该键对应的拟合参数值,属于此对象。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以 paramname 的形式出现,并带有其值。

  • 如果 deep=True,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname],等等。

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中所有在 __init__ 中定义了默认值的参数,值是这些参数在 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
排序bool, 默认=True

是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回(False)。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按它们在类 __init__ 中出现的顺序排列。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= 值为 BaseObject 的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。

返回:
参数带有字符串键的字典

参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • 总是:此对象的所有参数,通过 get_param_names 获取的值是该键的参数值,此对象的值总是与构造时传递的值相同。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname]componentname 的所有参数以 paramname 的形式出现,并带有其值。

  • 如果 deep=True,还包含任意层级的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

参数:
标签名称str

要检索的标签名称

tag_value_default任何类型,可选;默认=None

如果未找到标签,则使用默认/回退值

raise_error布尔值

当未找到标签时是否引发 ValueError

返回:
标签值任何

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时返回错误,否则返回 tag_value_default

引发:
如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError。
self.get_tags().keys()
get_tags()[源代码]#

从估计器类和动态标签覆盖中获取标签。

返回:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。从 _tags 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _tags_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

一个对象是否有任何参数的值是 BaseObjects。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化自身,结果输出到 path,通过 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化的内存容器中加载对象。

参数:
serial : cls.save(None) 输出的第一个元素输出中的第一个元素
返回:
反序列化自身,结果输出为 serial,来自 cls.save(None)
reset()[源代码]#

将对象重置为初始化后的干净状态。

使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:

  • 超参数 = __init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串”__”

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

返回:
自身

将类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

注释

等同于 sklearn.clone 但覆盖 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

行为:如果 path 为 None,则返回内存中的序列化自身;如果 path 是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。

保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。

参数:
路径无或文件位置(字符串或路径)

如果为 None,则将 self 保存到内存对象中;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:

path=”estimator” 则会在当前工作目录下生成一个名为 estimator.zip 的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 则会在 /home/stored/ 目录下存储一个名为 estimator.zip 的压缩文件。

serialization_format: str, default = “pickle”

用于序列化的模块。可用的选项是 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的自身
如果 path 是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:

显示str, “diagram” (默认), 或 “text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 盒子图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool, 默认=True

是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,不影响组件估计器。

警告str, “on” (默认), 或 “off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会从 sktime 引发警告

后端:并行str, 可选, 默认=”None”

在广播/矢量化时用于并行化的后端,是以下之一

  • “None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”: 使用 dask,需要在环境中安装 dask

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (不传递参数)

传递给并行化后端的额外参数作为配置。有效键取决于 backend:parallel 的值:

  • “None”: 没有额外参数, backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认的 joblib 后端 任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,除了 backend 直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何 joblib.Parallel 的有效键都可以在这里传递,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”: 任何 dask.compute 的有效键都可以传递,例如,scheduler

返回:
self对自身的引用。

注释

更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单的估计器以及复合对象。参数键字符串 <component>__<parameter> 可以用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果这使得引用明确,例如没有两个组件的参数名称相同,则也可以使用不带 <component>__ 的字符串 <parameter>

参数:
**参数dict

BaseObject 参数,键必须是 <组件>__<参数> 字符串。如果唯一存在于 get_params 键中,__ 后缀可以别名为完整字符串。

返回:
self引用自身(在参数设置之后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

设置 random_state 伪随机种子参数为 self。

通过 estimator.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将它们设置为由 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 的链式哈希采样得到,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 estimator 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时应用于剩余的组件估计器。

注意:即使 self 没有 random_state,或者没有任何组件有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 估计器,即使那些没有 random_state 参数的估计器。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。传递整数以在多次函数调用中获得可重复的输出。

深度bool, 默认=True

是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置 random_state 参数。

self_policystr, 可选值为 {“copy”, “keep”, “new”}, 默认值为 “copy”
  • “复制” : estimator.random_state 被设置为输入 random_state

  • “保持” : estimator.random_state 保持不变

  • “new” : estimator.random_state 被设置为一个新的随机状态,

派生自输入 random_state,并且通常与它不同。

返回:
self自我引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将动态标签设置为给定值。

参数:
**标签字典dict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。

transform(X, X2=None)[源代码]#

计算距离/核矩阵。

行为:返回成对距离/核矩阵

在 X 和 X2 样本之间(如果未传递,则等于 X)

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,其Python类型如下:

序列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有2级MultiIndex的pd.DataFrame, pd.DataFrame列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

受 sktime mtype 格式规范的约束,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X2序列或面板,任何支持的m类型,m个实例

可选,默认值:X = X2

要转换的数据,其Python类型如下:

序列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有2级MultiIndex的pd.DataFrame, pd.DataFrame列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

受 sktime mtype 格式规范的约束,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

X 和 X2 不需要有相同的 mtype

返回:
distmat: 形状为 [n, m] 的 np.array

(i,j)-th 条目包含 X[i] 和 X2[j] 之间的距离/核

transform_diag(X)[源代码]#

计算距离/核矩阵的对角线。

行为:返回样本 X 的距离/核矩阵的对角线

参数:
XSeries 或 Panel,任何支持的 mtype,n 个实例
要转换的数据,其Python类型如下:

序列: pd.Series, pd.DataFrame, 或 np.ndarray (1D 或 2D) 面板: 具有2级MultiIndex的pd.DataFrame, pd.DataFrame列表,

嵌套的 pd.DataFrame,或长/宽格式的 pd.DataFrame

受 sktime mtype 格式规范的约束,更多详情请参见

examples/AA_datatypes_and_datasets.ipynb

返回:
diag: 形状为 [n] 的 np.array

第 i 个条目包含 X[i] 和 X[i] 之间的距离/核