ClaSPSegmentation#

class ClaSPSegmentation(period_length=10, n_cps=1, exclusion_radius=0.05)[源代码][源代码]#

ClaSP(分类分数概况)分割。

使用 ClaSP 解决 CPD 问题很简单:我们首先计算轮廓,然后选择其全局最大值作为变化点。以下 CPD 是通过使用定制的递归分割算法获得的。

参数:
period_lengthint, 默认 = 10

滑动窗口的大小,基于数据的周期长度

n_cpsint, 默认 = 1

要搜索的变更点数量

exclusion_radius整数

变化点的排除半径,以避免非显著匹配

属性:
is_fitted

是否已调用 fit

注释

如 @inproceedings{clasp2021} 中所述

title={ClaSP - 时间序列分割}, author={Sch”afer, Patrick 和 Ermshaus, Arik 和 Leser, Ulf}, booktitle={CIKM}, year={2021}

}

示例

>>> from sktime.annotation.clasp import ClaSPSegmentation
>>> from sktime.annotation.clasp import find_dominant_window_sizes
>>> from sktime.datasets import load_gun_point_segmentation
>>> X, true_period_size, cps = load_gun_point_segmentation() 
>>> dominant_period_size = find_dominant_window_sizes(X) 
>>> clasp = ClaSPSegmentation(dominant_period_size, n_cps=1) 
>>> found_cps = clasp.fit_predict(X) 
>>> profiles = clasp.profiles 
>>> scores = clasp.scores 

方法

change_points_to_segments(y_sparse[, start, end])

将一系列变化点索引转换为段落。

check_is_fitted()

检查估计器是否已被拟合。

clone()

获取一个具有相同超参数的对象副本。

clone_tags(estimator[, tag_names])

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

create_test_instance([parameter_set])

如果可能,构造 Estimator 实例。

create_test_instances_and_names([parameter_set])

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

dense_to_sparse(y_dense)

将注释器的密集输出转换为稀疏格式。

fit(X[, Y])

拟合训练数据。

fit_predict(X[, Y])

拟合数据,然后进行预测。

fit_transform(X[, Y])

拟合数据,然后进行转换。

get_class_tag(tag_name[, tag_value_default])

获取类标签的值。

get_class_tags()

从类及其所有父类中获取类标签。

get_config()

获取 self 的配置标志

get_fitted_params()

获取拟合参数。

get_param_defaults()

获取对象的参数默认值。

get_param_names([sort])

获取对象的参数名称。

get_params([deep])

获取此对象的参数值字典。

get_tag(tag_name[, tag_value_default, ...])

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

get_tags()

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

get_test_params([parameter_set])

返回估计器的测试参数设置。

is_composite()

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

load_from_path(serial)

从文件位置加载对象。

load_from_serial(serial)

从序列化的内存容器中加载对象。

predict(X)

在测试/部署数据上创建注释。

predict_points(X)

预测测试/部署数据中的变化点/异常。

predict_scores(X)

返回测试/部署数据上预测注释的分数。

predict_segments(X)

预测测试/部署数据上的片段。

reset()

将对象重置为初始化后的干净状态。

save([path, serialization_format])

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

segments_to_change_points(y_sparse)

将片段转换为变化点。

set_config(**config_dict)

将配置标志设置为给定值。

set_params(**params)

设置此对象的参数。

set_random_state([random_state, deep, ...])

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

set_tags(**tag_dict)

将动态标签设置为给定值。

sparse_to_dense(y_sparse, index)

将注释器的稀疏输出转换为密集格式。

transform(X)

在测试/部署数据上创建注释。

update(X[, Y])

使用新数据和可选的地面实况注释更新模型。

update_predict(X)

使用新数据更新模型并为其创建注释。

get_fitted_params()[源代码][源代码]#

获取拟合参数。

返回:
fitted_paramsdict
classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#

返回估计器的测试参数设置。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 "default" 集。

返回:
参数字典或字典列表,默认 = {}

创建类的测试实例的参数 每个字典都是用于构造一个“有趣的”测试实例的参数,即 MyClass(**params)MyClass(**params[i]) 创建一个有效的测试实例。create_test_instance 使用 params 中的第一个(或唯一一个)字典

static change_points_to_segments(y_sparse, start=None, end=None)[源代码]#

将一系列变化点索引转换为段落。

参数:
y_sparsepd.Series

包含变化点索引的序列。

开始可选

第一段落的起点。

结束可选

最后一段的终点

返回:
pd.Series

一个带有间隔索引的系列,指示各段的起始和结束点。该系列的值是各段的标签。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator
>>> change_points = pd.Series([1, 2, 5])
>>> BaseSeriesAnnotator.change_points_to_segments(change_points, 0, 7)
[0, 1)   -1
[1, 2)    1
[2, 5)    2
[5, 7)    3
dtype: int64
check_is_fitted()[源代码]#

检查估计器是否已被拟合。

引发:
NotFittedError

如果估计器尚未拟合。

clone()[源代码]#

获取一个具有相同超参数的对象副本。

克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。

引发:
如果克隆不符合规范,由于 __init__ 存在错误,将引发 RuntimeError。

注释

如果成功,值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#

从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。

参数:
估计器继承自 BaseEstimator 的估计器
标签名称str 或 str 列表,默认 = None

要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。

classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#

如果可能,构造 Estimator 实例。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
实例使用默认参数的类实例

注释

get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并用该字典构建对象。

classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#

创建所有测试实例的列表及其名称的列表。

参数:
参数集str, 默认值=”default”

要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。

返回:
objscls 实例列表

第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])

名称list of str, 与 objs 长度相同

第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i},如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}。

static dense_to_sparse(y_dense)[源代码]#

将注释器的密集输出转换为稀疏格式。

参数:
y_densepd.Series
  • 如果 y_sparse 只包含 1 和 0,那么 1 代表变化点或异常。

  • 如果 y_sparse 仅包含大于 0 的整数,它是一个段数组。

返回:
pd.Series
  • 如果 y_sparse 是一系列变化点/异常点,将返回一个包含变化点/异常点索引的 pandas 系列。

  • 如果 y_sparse 是一系列片段,将返回一个带有区间数据类型索引的序列。序列的值将是片段的标签。

fit(X, Y=None)[源代码]#

拟合训练数据。

参数:
Xpd.DataFrame

用于拟合模型的训练数据(时间序列)。

Ypd.Series, 可选

如果标注者是受监督的,则为训练提供的基础真值标注。

返回:
自身

自我引用。

注释

创建一个已拟合的模型,更新以“_”结尾的属性。将 _is_fitted 标志设置为 True。

fit_predict(X, Y=None)[源代码]#

拟合数据,然后进行预测。

使用给定的注释参数将模型拟合到 X 和 Y,并返回模型所做的注释。

参数:
Xpd.DataFrame, pd.Series 或 np.ndarray

要转换的数据

Ypd.Series 或 np.ndarray,可选(默认=None)

要预测的数据的目标值。

返回:
selfpd.Series

序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。

fit_transform(X, Y=None)[源代码]#

拟合数据,然后进行转换。

使用给定的注释参数将模型拟合到 X 和 Y,并返回模型所做的注释。

参数:
Xpd.DataFrame, pd.Series 或 np.ndarray

要转换的数据

Ypd.Series 或 np.ndarray,可选(默认=None)

要预测的数据的目标值。

返回:
selfpd.Series

序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。

classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#

获取类标签的值。

不会返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。

参数:
标签名称str

标签值的名称。

tag_value_default任何

如果未找到标签,则使用默认/回退值。

返回:
tag_value

在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default

classmethod get_class_tags()[源代码]#

从类及其所有父类中获取类标签。

从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息,这些动态标签是在实例上定义的。

返回:
collected_tagsdict

类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。

get_config()[源代码]#

获取 self 的配置标志

返回:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。

classmethod get_param_defaults()[源代码]#

获取对象的参数默认值。

返回:
default_dict: dict[str, Any]

键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数,值是 __init__ 中定义的默认值。

classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#

获取对象的参数名称。

参数:
排序bool, 默认=True

是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类 __init__ 中出现的顺序返回(False)。

返回:
param_names: list[str]

cls 的参数名称列表。如果 sort=False,则按它们在类 __init__ 中出现的顺序排列。如果 sort=True,则按字母顺序排列。

get_params(deep=True)[源代码]#

获取此对象的参数值字典。

参数:
深度bool, 默认=True

是否返回组件的参数。

  • 如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。

  • 如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。

返回:
参数带有字符串键的字典

参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:

  • 总是:通过 get_param_names 获取的这个对象的所有参数,其值为该键的参数值,这个对象的值总是与构造时传递的值相同。

  • 如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以其值作为 paramname 出现。

  • 如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。

get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#

从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。

参数:
标签名称str

要检索的标签名称

tag_value_default任意类型,可选;默认=None

如果未找到标签,则使用默认/回退值

raise_error布尔值

当未找到标签时,是否会引发 ValueError

返回:
标签值任何

self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时返回错误,否则返回 tag_value_default

引发:
如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError
self.get_tags().keys()
get_tags()[源代码]#

从估计器类获取标签和动态标签覆盖。

返回:
collected_tagsdict

标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。

is_composite()[源代码]#

检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。

复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。

返回:
composite: bool

一个对象是否有任何参数的值是 BaseObjects。

property is_fitted[源代码]#

是否已调用 fit

classmethod load_from_path(serial)[源代码]#

从文件位置加载对象。

参数:
串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
返回:
反序列化自身,结果输出到 path,通过 cls.save(path)
classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#

从序列化的内存容器中加载对象。

参数:
serial : cls.save(None) 输出的第一个元素输出结果的第一个元素
返回:
反序列化自身,结果输出为 serial,来自 cls.save(None)
predict(X)[源代码]#

在测试/部署数据上创建注释。

参数:
Xpd.DataFrame

要注释的数据(时间序列)。

返回:
Ypd.Series

序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。

predict_points(X)[源代码]#

预测测试/部署数据中的变化点/异常。

参数:
Xpd.DataFrame

要注释的数据,时间序列。

返回:
Ypd.Series

一系列值,表示X中的变化点/异常。

predict_scores(X)[源代码]#

返回测试/部署数据上预测注释的分数。

参数:
Xpd.DataFrame

要注释的数据(时间序列)。

返回:
Ypd.Series

序列 X 的分数的确切格式取决于注释类型。

predict_segments(X)[源代码]#

预测测试/部署数据上的片段。

参数:
Xpd.DataFrame

要注释的数据,时间序列。

返回:
Ypd.Series

一个带有区间索引的序列。每个区间是一个段的范围,相应的值是该段的标签。

reset()[源代码]#

将对象重置为初始化后的干净状态。

使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:

  • 超参数 = __init__ 的参数

  • 包含双下划线的对象属性,即字符串”__”

类和对象方法,以及类属性也不受影响。

返回:
自身

将类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。

注释

等同于 sklearn.clone 但覆盖了 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))

save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#

将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。

行为:如果 path 为 None,则返回内存中的序列化自身;如果 path 是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。

保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。

参数:
路径无或文件位置(字符串或路径)

如果为 None,则将 self 保存到内存中的对象;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:

path=”estimator” 那么在当前工作目录(cwd)会生成一个名为 estimator.zip 的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 那么 estimator.zip 文件将被存储在 /home/stored/ 目录下。

serialization_format: str, default = “pickle”

用于序列化的模块。可用的选项有 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖。

返回:
如果 path 为 None - 内存中序列化的自身
如果 path 是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
static segments_to_change_points(y_sparse)[源代码]#

将片段转换为变化点。

参数:
y_sparsepd.DataFrame

一系列片段。索引必须是区间数据类型,而值应该是片段的整数标签。

返回:
pd.Series

包含每个段落起始索引的序列。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator
>>> segments = pd.Series(
...     [3, -1, 2],
...     index=pd.IntervalIndex.from_breaks([2, 5, 7, 9], closed="left")
... )
>>> BaseSeriesAnnotator.segments_to_change_points(segments)
0    2
1    5
2    7
dtype: int64
set_config(**config_dict)[源代码]#

将配置标志设置为给定值。

参数:
config_dictdict

配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:

显示str, “diagram” (默认), 或 “text”

jupyter 内核如何显示 self 的实例

  • “diagram” = html 盒子图表示

  • “text” = 字符串打印输出

print_changed_onlybool, 默认=True

是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,而不影响组件估计器。

警告str, “on” (默认), 或 “off”

是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告

  • “on” = 将引发来自 sktime 的警告

  • “off” = 不会从 sktime 引发警告

后端:并行str, 可选, 默认=”None”

在广播/矢量化时用于并行化的后端,为以下之一

  • “None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用 joblib.Parallel

  • “joblib”:自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark

  • “dask”:使用 dask,需要在环境中安装 dask

backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (无参数传递)

传递给并行化后端的附加参数作为配置。有效键取决于 backend:parallel 的值:

  • “None”: 没有额外参数, backend_params 被忽略

  • “loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认 joblib 后端 任何有效的 joblib.Parallel 键都可以在这里传递,例如 n_jobs,除了 backend 直接由 backend 控制。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 默认值。

  • “joblib”: 自定义和第三方 joblib 后端,例如 spark。任何 joblib.Parallel 的有效键都可以在这里传递,例如 n_jobs,在这种情况下,backend 必须作为 backend_params 的键传递。如果未传递 n_jobs,它将默认为 -1,其他参数将默认为 joblib 的默认值。

  • “dask”: 任何 dask.compute 的有效键都可以传递,例如,scheduler

返回:
self自我引用。

注释

更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。

set_params(**params)[源代码]#

设置此对象的参数。

该方法适用于简单估计器以及复合对象。参数键字符串 <component>__<parameter> 可用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件 <component> 中的 <parameter>。如果没有 <component>__,字符串 <parameter> 也可以使用,前提是这使得引用明确,例如,没有两个组件的参数名称是 <parameter>

参数:
**参数dict

BaseObject 参数,键必须是 <component>__<parameter> 字符串。如果 __ 后缀在 get_params 键中是唯一的,则可以别名为完整字符串。

返回:
self引用自身(在参数设置之后)
set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#

为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。

通过 estimator.get_params 查找名为 random_state 的参数,并通过 set_params 将其设置为由 random_state 派生的整数。这些整数通过 sample_dependent_seed 的链哈希采样获得,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。

根据 self_policy 应用于 estimator 中的 random_state 参数,并且仅当 deep=True 时,应用于剩余的组件估计器。

注意:即使 self 没有 random_state,或者没有任何组件有 random_state 参数,也会调用 set_params。因此,set_random_state 将重置任何 scikit-base 估计器,即使它们没有 random_state 参数。

参数:
random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None

伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。在多次函数调用中传递整数以获得可重复的输出。

深度bool, 默认=True

是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置 selfrandom_state 参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置 random_state 参数。

self_policystr, 可以是 {“copy”, “keep”, “new”} 之一, 默认=”copy”
  • “复制” : estimator.random_state 被设置为输入 random_state

  • “保持”:estimator.random_state 保持不变

  • “new” : estimator.random_state 被设置为一个新的随机状态,

源自输入 random_state,并且通常与它不同

返回:
self自我引用
set_tags(**tag_dict)[源代码]#

将动态标签设置为给定值。

参数:
**标签字典dict

标签名称:标签值对的字典。

返回:
自我

自我引用。

注释

通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。

static sparse_to_dense(y_sparse, index)[源代码]#

将注释器的稀疏输出转换为密集格式。

参数:
y_sparsepd.Series
  • 如果 y_sparse 是一个带有区间索引的序列,它应该表示每个序列值都是某个区间的标签。未分类的区间应标记为 -1。区间标签绝不能为 0。

  • 如果 y_sparse 的索引不是一组区间,则序列的值应表示变化点/异常的索引。

索引类似数组

根据 y_sparse 进行注释的索引。

返回:
pd.Series

返回一个索引为 index 的系列。* 如果 y_sparse 是一个变化点/异常点的系列,则返回

序列被标记为 0 和 1,取决于索引是否与异常/变化点相关联。其中 1 表示异常/变化点。

  • 如果 y_sparse 是一系列片段,那么返回的序列将根据其索引所属的片段进行标记。不属于任何片段的索引将被标记为 -1。

示例

>>> import pandas as pd
>>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator
>>> y_sparse = pd.Series([2, 5, 7])  # Indices of changepoints/anomalies
>>> index = range(0, 8)
>>> BaseSeriesAnnotator.sparse_to_dense(y_sparse, index=index)
0    0
1    0
2    1
3    0
4    0
5    1
6    0
7    1
dtype: int64
>>> y_sparse = pd.Series(
...     [1, 2, 1],
...     index=pd.IntervalIndex.from_arrays(
...         [0, 4, 6], [4, 6, 10], closed="left"
...     )
... )
>>> index = range(10)
>>> BaseSeriesAnnotator.sparse_to_dense(y_sparse, index=index)
0    1
1    1
2    1
3    1
4    2
5    2
6    1
7    1
8    1
9    1
dtype: int64
transform(X)[源代码]#

在测试/部署数据上创建注释。

参数:
Xpd.DataFrame

要注释的数据(时间序列)。

返回:
Ypd.Series

序列 X 的注释。返回的注释将以密集格式呈现。

update(X, Y=None)[源代码]#

使用新数据和可选的地面实况注释更新模型。

参数:
Xpd.DataFrame

用于更新模型的训练数据(时间序列)。

Ypd.Series, 可选

如果标注者是受监督的,则为训练提供的基础真值标注。

返回:
自身

自我引用。

注释

更新拟合的模型,该模型更新以“_”结尾的属性。

update_predict(X)[源代码]#

使用新数据更新模型并为其创建注释。

参数:
Xpd.DataFrame

用于更新模型的训练数据,时间序列。

返回:
Ypd.Series

序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。

注释

更新拟合的模型,该模型更新以“_”结尾的属性。