ClaSPSegmentation#
- class ClaSPSegmentation(period_length=10, n_cps=1, exclusion_radius=0.05)[源代码][源代码]#
ClaSP(分类分数概况)分割。
使用 ClaSP 解决 CPD 问题很简单:我们首先计算轮廓,然后选择其全局最大值作为变化点。以下 CPD 是通过使用定制的递归分割算法获得的。
- 参数:
- period_lengthint, 默认 = 10
滑动窗口的大小,基于数据的周期长度
- n_cpsint, 默认 = 1
要搜索的变更点数量
- exclusion_radius整数
变化点的排除半径,以避免非显著匹配
- 属性:
is_fitted
是否已调用
fit
。
注释
如 @inproceedings{clasp2021} 中所述
title={ClaSP - 时间序列分割}, author={Sch”afer, Patrick 和 Ermshaus, Arik 和 Leser, Ulf}, booktitle={CIKM}, year={2021}
}
示例
>>> from sktime.annotation.clasp import ClaSPSegmentation >>> from sktime.annotation.clasp import find_dominant_window_sizes >>> from sktime.datasets import load_gun_point_segmentation >>> X, true_period_size, cps = load_gun_point_segmentation() >>> dominant_period_size = find_dominant_window_sizes(X) >>> clasp = ClaSPSegmentation(dominant_period_size, n_cps=1) >>> found_cps = clasp.fit_predict(X) >>> profiles = clasp.profiles >>> scores = clasp.scores
方法
change_points_to_segments
(y_sparse[, start, end])将一系列变化点索引转换为段落。
检查估计器是否已被拟合。
clone
()获取一个具有相同超参数的对象副本。
clone_tags
(estimator[, tag_names])从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
create_test_instance
([parameter_set])如果可能,构造 Estimator 实例。
create_test_instances_and_names
([parameter_set])创建所有测试实例的列表及其名称的列表。
dense_to_sparse
(y_dense)将注释器的密集输出转换为稀疏格式。
fit
(X[, Y])拟合训练数据。
fit_predict
(X[, Y])拟合数据,然后进行预测。
fit_transform
(X[, Y])拟合数据,然后进行转换。
get_class_tag
(tag_name[, tag_value_default])获取类标签的值。
从类及其所有父类中获取类标签。
获取 self 的配置标志
获取拟合参数。
获取对象的参数默认值。
get_param_names
([sort])获取对象的参数名称。
get_params
([deep])获取此对象的参数值字典。
get_tag
(tag_name[, tag_value_default, ...])从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
get_tags
()从估计器类获取标签和动态标签覆盖。
get_test_params
([parameter_set])返回估计器的测试参数设置。
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
load_from_path
(serial)从文件位置加载对象。
load_from_serial
(serial)从序列化的内存容器中加载对象。
predict
(X)在测试/部署数据上创建注释。
预测测试/部署数据中的变化点/异常。
返回测试/部署数据上预测注释的分数。
预测测试/部署数据上的片段。
reset
()将对象重置为初始化后的干净状态。
save
([path, serialization_format])将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。
segments_to_change_points
(y_sparse)将片段转换为变化点。
set_config
(**config_dict)将配置标志设置为给定值。
set_params
(**params)设置此对象的参数。
set_random_state
([random_state, deep, ...])为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
set_tags
(**tag_dict)将动态标签设置为给定值。
sparse_to_dense
(y_sparse, index)将注释器的稀疏输出转换为密集格式。
transform
(X)在测试/部署数据上创建注释。
update
(X[, Y])使用新数据和可选的地面实况注释更新模型。
使用新数据更新模型并为其创建注释。
- classmethod get_test_params(parameter_set='default')[源代码][源代码]#
返回估计器的测试参数设置。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回
"default"
集。
- 返回:
- 参数字典或字典列表,默认 = {}
创建类的测试实例的参数 每个字典都是用于构造一个“有趣的”测试实例的参数,即
MyClass(**params)
或MyClass(**params[i])
创建一个有效的测试实例。create_test_instance
使用params
中的第一个(或唯一一个)字典
- static change_points_to_segments(y_sparse, start=None, end=None)[源代码]#
将一系列变化点索引转换为段落。
- 参数:
- y_sparsepd.Series
包含变化点索引的序列。
- 开始可选
第一段落的起点。
- 结束可选
最后一段的终点
- 返回:
- pd.Series
一个带有间隔索引的系列,指示各段的起始和结束点。该系列的值是各段的标签。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator >>> change_points = pd.Series([1, 2, 5]) >>> BaseSeriesAnnotator.change_points_to_segments(change_points, 0, 7) [0, 1) -1 [1, 2) 1 [2, 5) 2 [5, 7) 3 dtype: int64
- clone()[源代码]#
获取一个具有相同超参数的对象副本。
克隆是一个在初始化后状态下的不同对象,没有共享引用。此函数等同于返回 self 的 sklearn.clone。
- 引发:
- 如果克隆不符合规范,由于
__init__
存在错误,将引发 RuntimeError。
- 如果克隆不符合规范,由于
注释
如果成功,值等于
type(self)(**self.get_params(deep=False))
。
- clone_tags(estimator, tag_names=None)[源代码]#
从另一个估计器克隆标签作为动态覆盖。
- 参数:
- 估计器继承自
BaseEstimator
的估计器 - 标签名称str 或 str 列表,默认 = None
要克隆的标签名称。如果为 None,则使用估计器中的所有标签作为 tag_names。
- 估计器继承自
- 返回:
- 自我
自我引用。
注释
通过在 tag_set 中设置来自估计器的标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。
- classmethod create_test_instance(parameter_set='default')[源代码]#
如果可能,构造 Estimator 实例。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- 实例使用默认参数的类实例
注释
get_test_params 可以返回字典或字典列表。此函数取 get_test_params 返回的第一个或单个字典,并用该字典构建对象。
- classmethod create_test_instances_and_names(parameter_set='default')[源代码]#
创建所有测试实例的列表及其名称的列表。
- 参数:
- 参数集str, 默认值=”default”
要返回的测试参数集的名称,用于测试。如果没有为某个值定义特殊参数,将返回 “default” 集。
- 返回:
- objscls 实例列表
第 i 个实例是 cls(**cls.get_test_params()[i])
- 名称list of str, 与 objs 长度相同
第 i 个元素是测试中第 i 个 obj 实例的名称,约定为 {cls.__name__}-{i},如果存在多个实例,否则为 {cls.__name__}。
- static dense_to_sparse(y_dense)[源代码]#
将注释器的密集输出转换为稀疏格式。
- 参数:
- y_densepd.Series
如果
y_sparse
只包含 1 和 0,那么 1 代表变化点或异常。如果
y_sparse
仅包含大于 0 的整数,它是一个段数组。
- 返回:
- pd.Series
如果
y_sparse
是一系列变化点/异常点,将返回一个包含变化点/异常点索引的 pandas 系列。如果
y_sparse
是一系列片段,将返回一个带有区间数据类型索引的序列。序列的值将是片段的标签。
- fit(X, Y=None)[源代码]#
拟合训练数据。
- 参数:
- Xpd.DataFrame
用于拟合模型的训练数据(时间序列)。
- Ypd.Series, 可选
如果标注者是受监督的,则为训练提供的基础真值标注。
- 返回:
- 自身
自我引用。
注释
创建一个已拟合的模型,更新以“_”结尾的属性。将 _is_fitted 标志设置为 True。
- fit_predict(X, Y=None)[源代码]#
拟合数据,然后进行预测。
使用给定的注释参数将模型拟合到 X 和 Y,并返回模型所做的注释。
- 参数:
- Xpd.DataFrame, pd.Series 或 np.ndarray
要转换的数据
- Ypd.Series 或 np.ndarray,可选(默认=None)
要预测的数据的目标值。
- 返回:
- selfpd.Series
序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。
- fit_transform(X, Y=None)[源代码]#
拟合数据,然后进行转换。
使用给定的注释参数将模型拟合到 X 和 Y,并返回模型所做的注释。
- 参数:
- Xpd.DataFrame, pd.Series 或 np.ndarray
要转换的数据
- Ypd.Series 或 np.ndarray,可选(默认=None)
要预测的数据的目标值。
- 返回:
- selfpd.Series
序列 X 的注释的确切格式取决于注释类型。
- classmethod get_class_tag(tag_name, tag_value_default=None)[源代码]#
获取类标签的值。
不会返回在实例上定义的动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息。
- 参数:
- 标签名称str
标签值的名称。
- tag_value_default任何
如果未找到标签,则使用默认/回退值。
- 返回:
tag_value
在 self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,则返回 tag_value_default。
- classmethod get_class_tags()[源代码]#
从类及其所有父类中获取类标签。
从 _tags 类属性中检索标签:值对。不返回动态标签(通过 set_tags 或 clone_tags 设置)的信息,这些动态标签是在实例上定义的。
- 返回:
- collected_tagsdict
类标签名称字典:标签值对。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集。
- get_config()[源代码]#
获取 self 的配置标志
- 返回:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。从 _config 类属性通过嵌套继承收集,然后是 _config_dynamic 对象属性的任何覆盖和新标签。
- classmethod get_param_defaults()[源代码]#
获取对象的参数默认值。
- 返回:
- default_dict: dict[str, Any]
键是 cls 中在 __init__ 中定义了默认值的所有参数,值是 __init__ 中定义的默认值。
- classmethod get_param_names(sort=True)[源代码]#
获取对象的参数名称。
- 参数:
- 排序bool, 默认=True
是否按字母顺序返回参数名称(True),或者按它们在类
__init__
中出现的顺序返回(False)。
- 返回:
- param_names: list[str]
cls 的参数名称列表。如果
sort=False
,则按它们在类__init__
中出现的顺序排列。如果sort=True
,则按字母顺序排列。
- get_params(deep=True)[源代码]#
获取此对象的参数值字典。
- 参数:
- 深度bool, 默认=True
是否返回组件的参数。
如果为 True,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,包括组件的参数(= BaseObject 值的参数)。
如果为 False,将返回此对象的参数名称 : 值的字典,但不包括组件的参数。
- 返回:
- 参数带有字符串键的字典
参数的字典,paramname : paramvalue 键值对包括:
总是:通过 get_param_names 获取的这个对象的所有参数,其值为该键的参数值,这个对象的值总是与构造时传递的值相同。
如果 deep=True,还包含组件参数的键/值对,组件的参数被索引为 [componentname]__[paramname],所有 componentname 的参数都以其值作为 paramname 出现。
如果 deep=True,还包含任意级别的组件递归,例如,[componentname]__[componentcomponentname]__[paramname] 等。
- get_tag(tag_name, tag_value_default=None, raise_error=True)[源代码]#
从估计器类获取标签值和动态标签覆盖。
- 参数:
- 标签名称str
要检索的标签名称
- tag_value_default任意类型,可选;默认=None
如果未找到标签,则使用默认/回退值
- raise_error布尔值
当未找到标签时,是否会引发 ValueError
- 返回:
- 标签值任何
self 中 tag_name 标签的值。如果未找到,当 raise_error 为 True 时返回错误,否则返回 tag_value_default。
- 引发:
- 如果 raise_error 为 True,即如果 tag_name 不在其中,则引发 ValueError
- self.get_tags().keys()
- get_tags()[源代码]#
从估计器类获取标签和动态标签覆盖。
- 返回:
- collected_tagsdict
标签名称 : 标签值对的字典。通过嵌套继承从 _tags 类属性中收集,然后从 _tags_dynamic 对象属性中覆盖和新标签。
- is_composite()[源代码]#
检查对象是否由其他 BaseObjects 组成。
复合对象是一个包含对象的对象,作为参数。在实例上调用,因为这可能因实例而异。
- 返回:
- composite: bool
一个对象是否有任何参数的值是 BaseObjects。
- classmethod load_from_path(serial)[源代码]#
从文件位置加载对象。
- 参数:
- 串行ZipFile(path).open(“object”) 的结果
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出到
path
,通过cls.save(path)
- 反序列化自身,结果输出到
- classmethod load_from_serial(serial)[源代码]#
从序列化的内存容器中加载对象。
- 参数:
- serial :
cls.save(None)
输出的第一个元素输出结果的第一个元素
- serial :
- 返回:
- 反序列化自身,结果输出为
serial
,来自cls.save(None)
- 反序列化自身,结果输出为
- predict_points(X)[源代码]#
预测测试/部署数据中的变化点/异常。
- 参数:
- Xpd.DataFrame
要注释的数据,时间序列。
- 返回:
- Ypd.Series
一系列值,表示X中的变化点/异常。
- predict_scores(X)[源代码]#
返回测试/部署数据上预测注释的分数。
- 参数:
- Xpd.DataFrame
要注释的数据(时间序列)。
- 返回:
- Ypd.Series
序列 X 的分数的确切格式取决于注释类型。
- predict_segments(X)[源代码]#
预测测试/部署数据上的片段。
- 参数:
- Xpd.DataFrame
要注释的数据,时间序列。
- 返回:
- Ypd.Series
一个带有区间索引的序列。每个区间是一个段的范围,相应的值是该段的标签。
- reset()[源代码]#
将对象重置为初始化后的干净状态。
使用 reset,使用当前的超参数值(get_params 的结果)运行 __init__。这将移除任何对象属性,除了:
超参数 = __init__ 的参数
包含双下划线的对象属性,即字符串”__”
类和对象方法,以及类属性也不受影响。
- 返回:
- 自身
将类的实例重置为干净的初始化后状态,但保留当前的超参数值。
注释
等同于 sklearn.clone 但覆盖了 self。在调用 self.reset() 之后,self 的值等于 type(self)(**self.get_params(deep=False))
- save(path=None, serialization_format='pickle')[源代码]#
将序列化的自身保存到类字节对象或 (.zip) 文件中。
行为:如果
path
为 None,则返回内存中的序列化自身;如果path
是一个文件位置,则将自身存储在该位置作为一个 zip 文件。保存的文件是包含以下内容的zip文件:_metadata - 包含自身的类,即 type(self) _obj - 序列化的自身。此类使用默认的序列化(pickle)。
- 参数:
- 路径无或文件位置(字符串或路径)
如果为 None,则将 self 保存到内存中的对象;如果为文件位置,则将 self 保存到该文件位置。如果:
path=”estimator” 那么在当前工作目录(cwd)会生成一个名为
estimator.zip
的压缩文件。path=”/home/stored/estimator” 那么estimator.zip
文件将被存储在/home/stored/
目录下。- serialization_format: str, default = “pickle”
用于序列化的模块。可用的选项有 “pickle” 和 “cloudpickle”。请注意,非默认格式可能需要安装其他软依赖。
- 返回:
- 如果
path
为 None - 内存中序列化的自身 - 如果
path
是文件位置 - 带有文件引用的 ZipFile
- 如果
- static segments_to_change_points(y_sparse)[源代码]#
将片段转换为变化点。
- 参数:
- y_sparsepd.DataFrame
一系列片段。索引必须是区间数据类型,而值应该是片段的整数标签。
- 返回:
- pd.Series
包含每个段落起始索引的序列。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator >>> segments = pd.Series( ... [3, -1, 2], ... index=pd.IntervalIndex.from_breaks([2, 5, 7, 9], closed="left") ... ) >>> BaseSeriesAnnotator.segments_to_change_points(segments) 0 2 1 5 2 7 dtype: int64
- set_config(**config_dict)[源代码]#
将配置标志设置为给定值。
- 参数:
- config_dictdict
配置名称 : 配置值对的字典。有效的配置、值及其含义如下所示:
- 显示str, “diagram” (默认), 或 “text”
jupyter 内核如何显示 self 的实例
“diagram” = html 盒子图表示
“text” = 字符串打印输出
- print_changed_onlybool, 默认=True
是否仅打印与默认值不同的自身参数(False),或打印所有参数名称和值(False)。不嵌套,即仅影响自身,而不影响组件估计器。
- 警告str, “on” (默认), 或 “off”
是否引发警告,仅影响来自 sktime 的警告
“on” = 将引发来自 sktime 的警告
“off” = 不会从 sktime 引发警告
- 后端:并行str, 可选, 默认=”None”
在广播/矢量化时用于并行化的后端,为以下之一
“None”: 按顺序执行循环,简单的列表推导
“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 使用
joblib.Parallel
“joblib”:自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
“dask”:使用
dask
,需要在环境中安装dask
包
- backend:parallel:paramsdict, 可选, 默认={} (无参数传递)
传递给并行化后端的附加参数作为配置。有效键取决于
backend:parallel
的值:“None”: 没有额外参数,
backend_params
被忽略“loky”, “multiprocessing” 和 “threading”: 默认
joblib
后端 任何有效的joblib.Parallel
键都可以在这里传递,例如n_jobs
,除了backend
直接由backend
控制。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
默认值。“joblib”: 自定义和第三方
joblib
后端,例如spark
。任何joblib.Parallel
的有效键都可以在这里传递,例如n_jobs
,在这种情况下,backend
必须作为backend_params
的键传递。如果未传递n_jobs
,它将默认为-1
,其他参数将默认为joblib
的默认值。“dask”: 任何
dask.compute
的有效键都可以传递,例如,scheduler
- 返回:
- self自我引用。
注释
更改对象状态,将 config_dict 中的配置复制到 self._config_dynamic。
- set_params(**params)[源代码]#
设置此对象的参数。
该方法适用于简单估计器以及复合对象。参数键字符串
<component>__<parameter>
可用于复合对象,即包含其他对象的对象,以访问组件<component>
中的<parameter>
。如果没有<component>__
,字符串<parameter>
也可以使用,前提是这使得引用明确,例如,没有两个组件的参数名称是<parameter>
。- 参数:
- **参数dict
BaseObject 参数,键必须是
<component>__<parameter>
字符串。如果 __ 后缀在 get_params 键中是唯一的,则可以别名为完整字符串。
- 返回:
- self引用自身(在参数设置之后)
- set_random_state(random_state=None, deep=True, self_policy='copy')[源代码]#
为 self 设置 random_state 伪随机种子参数。
通过
estimator.get_params
查找名为random_state
的参数,并通过set_params
将其设置为由random_state
派生的整数。这些整数通过sample_dependent_seed
的链哈希采样获得,并保证种子随机生成器的伪随机独立性。根据
self_policy
应用于estimator
中的random_state
参数,并且仅当deep=True
时,应用于剩余的组件估计器。注意:即使
self
没有random_state
,或者没有任何组件有random_state
参数,也会调用set_params
。因此,set_random_state
将重置任何scikit-base
估计器,即使它们没有random_state
参数。- 参数:
- random_stateint, RandomState 实例或 None, 默认=None
伪随机数生成器,用于控制随机整数的生成。在多次函数调用中传递整数以获得可重复的输出。
- 深度bool, 默认=True
是否在子估计器中设置随机状态。如果为 False,则仅设置
self
的random_state
参数(如果存在)。如果为 True,则还会在子估计器中设置random_state
参数。- self_policystr, 可以是 {“copy”, “keep”, “new”} 之一, 默认=”copy”
“复制” :
estimator.random_state
被设置为输入random_state
“保持”:
estimator.random_state
保持不变“new” :
estimator.random_state
被设置为一个新的随机状态,
源自输入
random_state
,并且通常与它不同
- 返回:
- self自我引用
- set_tags(**tag_dict)[源代码]#
将动态标签设置为给定值。
- 参数:
- **标签字典dict
标签名称:标签值对的字典。
- 返回:
- 自我
自我引用。
注释
通过在 tag_dict 中设置标签值,将对象状态更改为 self 中的动态标签。
- static sparse_to_dense(y_sparse, index)[源代码]#
将注释器的稀疏输出转换为密集格式。
- 参数:
- y_sparsepd.Series
如果
y_sparse
是一个带有区间索引的序列,它应该表示每个序列值都是某个区间的标签。未分类的区间应标记为 -1。区间标签绝不能为 0。如果
y_sparse
的索引不是一组区间,则序列的值应表示变化点/异常的索引。
- 索引类似数组
根据
y_sparse
进行注释的索引。
- 返回:
- pd.Series
返回一个索引为
index
的系列。* 如果y_sparse
是一个变化点/异常点的系列,则返回序列被标记为 0 和 1,取决于索引是否与异常/变化点相关联。其中 1 表示异常/变化点。
如果
y_sparse
是一系列片段,那么返回的序列将根据其索引所属的片段进行标记。不属于任何片段的索引将被标记为 -1。
示例
>>> import pandas as pd >>> from sktime.annotation.base._base import BaseSeriesAnnotator >>> y_sparse = pd.Series([2, 5, 7]) # Indices of changepoints/anomalies >>> index = range(0, 8) >>> BaseSeriesAnnotator.sparse_to_dense(y_sparse, index=index) 0 0 1 0 2 1 3 0 4 0 5 1 6 0 7 1 dtype: int64 >>> y_sparse = pd.Series( ... [1, 2, 1], ... index=pd.IntervalIndex.from_arrays( ... [0, 4, 6], [4, 6, 10], closed="left" ... ) ... ) >>> index = range(10) >>> BaseSeriesAnnotator.sparse_to_dense(y_sparse, index=index) 0 1 1 1 2 1 3 1 4 2 5 2 6 1 7 1 8 1 9 1 dtype: int64
- transform(X)[源代码]#
在测试/部署数据上创建注释。
- 参数:
- Xpd.DataFrame
要注释的数据(时间序列)。
- 返回:
- Ypd.Series
序列 X 的注释。返回的注释将以密集格式呈现。