备注
转到末尾 以下载完整示例代码。或通过 Binder 在浏览器中运行此示例。
Flood Fill#
Flood fill 是一种算法,用于基于与初始种子点的相似性来识别和/或改变图像中的相邻值 [1]。概念上的类比是许多图形编辑器中的’油漆桶’工具。
基本示例#
首先,我们将从一个基本示例开始,在这个示例中,我们将把一个棋盘格方块从白色变为中灰色。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from skimage import data, filters, color, morphology
from skimage.segmentation import flood, flood_fill
checkers = data.checkerboard()
# Fill a square near the middle with value 127, starting at index (76, 76)
filled_checkers = flood_fill(checkers, (76, 76), 127)
fig, ax = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, 5))
ax[0].imshow(checkers, cmap=plt.cm.gray)
ax[0].set_title('Original')
ax[1].imshow(filled_checkers, cmap=plt.cm.gray)
ax[1].plot(76, 76, 'wo') # seed point
ax[1].set_title('After flood fill')
plt.show()
高级示例#
因为标准的泛洪填充要求邻居严格相等,所以在具有颜色渐变和噪声的真实图像上使用受限。tolerance 关键字参数扩大了初始值允许的范围,使得在真实图像上使用成为可能。
在这里,我们将在摄影师身上进行一些实验。首先,将他的外套从深色变为浅色。
cameraman = data.camera()
# Change the cameraman's coat from dark to light (255). The seed point is
# chosen as (155, 150)
light_coat = flood_fill(cameraman, (155, 150), 255, tolerance=10)
fig, ax = plt.subplots(ncols=2, figsize=(10, 5))
ax[0].imshow(cameraman, cmap=plt.cm.gray)
ax[0].set_title('Original')
ax[0].axis('off')
ax[1].imshow(light_coat, cmap=plt.cm.gray)
ax[1].plot(150, 155, 'ro') # seed point
ax[1].set_title('After flood fill')
ax[1].axis('off')
plt.show()
摄影师的外套是不同深浅的灰色。只有与种子值附近色调相匹配的外套部分发生了变化。
容差实验#
为了更好地直观理解容差参数的工作原理,这里有一组图像,从左上角的种子点开始逐步增加参数。
output = []
for i in range(8):
tol = 5 + 20 * i
output.append(flood_fill(cameraman, (0, 0), 255, tolerance=tol))
# Initialize plot and place original image
fig, ax = plt.subplots(nrows=3, ncols=3, figsize=(12, 12))
ax[0, 0].imshow(cameraman, cmap=plt.cm.gray)
ax[0, 0].set_title('Original')
ax[0, 0].axis('off')
# Plot all eight different tolerances for comparison.
for i in range(8):
m, n = np.unravel_index(i + 1, (3, 3))
ax[m, n].imshow(output[i], cmap=plt.cm.gray)
ax[m, n].set_title(f'Tolerance {5 + 20 * i}')
ax[m, n].axis('off')
ax[m, n].plot(0, 0, 'bo') # seed point
fig.tight_layout()
plt.show()
Flood as mask#
一个姐妹函数 flood 可用,它返回一个标识洪泛区域的掩码,而不是修改图像本身。这对于分割目的和更高级的分析管道非常有用。
这里我们分割猫的鼻子。然而,多通道图像不受 flood[_fill] 支持。相反,我们对红色通道进行 Sobel 滤波以增强边缘,然后以一定的容差填充鼻子。
cat = data.chelsea()
cat_sobel = filters.sobel(cat[..., 0])
cat_nose = flood(cat_sobel, (240, 265), tolerance=0.03)
fig, ax = plt.subplots(nrows=3, figsize=(10, 20))
ax[0].imshow(cat)
ax[0].set_title('Original')
ax[0].axis('off')
ax[1].imshow(cat_sobel)
ax[1].set_title('Sobel filtered')
ax[1].axis('off')
ax[2].imshow(cat)
ax[2].imshow(cat_nose, cmap=plt.cm.gray, alpha=0.3)
ax[2].plot(265, 240, 'wo') # seed point
ax[2].set_title('Nose segmented with `flood`')
ax[2].axis('off')
fig.tight_layout()
plt.show()
在HSV空间中进行洪水填充和掩码后处理#
由于泛洪填充操作在单通道图像上进行,我们在这里将图像转换为HSV(色调饱和度值)空间,以便泛洪相似色调的像素。
在这个例子中,我们还展示了可以利用 skimage.morphology
中的函数对 skimage.segmentation.flood()
返回的二进制掩码进行后处理。
img = data.astronaut()
img_hsv = color.rgb2hsv(img)
img_hsv_copy = np.copy(img_hsv)
# flood function returns a mask of flooded pixels
mask = flood(img_hsv[..., 0], (313, 160), tolerance=0.016)
# Set pixels of mask to new value for hue channel
img_hsv[mask, 0] = 0.5
# Post-processing in order to improve the result
# Remove white pixels from flag, using saturation channel
mask_postprocessed = np.logical_and(mask, img_hsv_copy[..., 1] > 0.4)
# Remove thin structures with binary opening
mask_postprocessed = morphology.binary_opening(mask_postprocessed, np.ones((3, 3)))
# Fill small holes with binary closing
mask_postprocessed = morphology.binary_closing(mask_postprocessed, morphology.disk(20))
img_hsv_copy[mask_postprocessed, 0] = 0.5
fig, ax = plt.subplots(1, 2, figsize=(8, 4))
ax[0].imshow(color.hsv2rgb(img_hsv))
ax[0].axis('off')
ax[0].set_title('After flood fill')
ax[1].imshow(color.hsv2rgb(img_hsv_copy))
ax[1].axis('off')
ax[1].set_title('After flood fill and post-processing')
fig.tight_layout()
plt.show()
脚本总运行时间: (0 分钟 2.183 秒)