Note
Go to the end to download the full example code. or to run this example in your browser via Binder
通过信息准则进行Lasso模型选择#
本示例重现了[ZHT2007]_中图2的示例。一个
LassoLarsIC
估计器在糖尿病数据集上进行拟合,并使用AIC和BIC准则选择最佳模型。
Note
需要注意的是,使用:class:~sklearn.linear_model.LassoLarsIC
找到 alpha
的优化依赖于在样本内计算的AIC或BIC准则,因此直接在训练集上进行。这种方法不同于交叉验证程序。关于这两种方法的比较,可以参考以下示例:
Lasso模型选择:AIC-BIC / 交叉验证 .
References
# 作者:scikit-learn 开发者
# SPDX 许可证标识符:BSD-3-Clause
我们将使用糖尿病数据集。
from sklearn.datasets import load_diabetes
X, y = load_diabetes(return_X_y=True, as_frame=True)
n_samples = X.shape[0]
X.head()
Scikit-learn 提供了一个名为 LassoLarsIC
的估计器,该估计器使用赤池信息准则 (AIC) 或贝叶斯信息准则 (BIC) 来选择最佳模型。在拟合此模型之前,我们将对数据集进行缩放。
接下来,我们将拟合两个模型,以比较AIC和BIC报告的值。
from sklearn.linear_model import LassoLarsIC
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
lasso_lars_ic = make_pipeline(StandardScaler(), LassoLarsIC(criterion="aic")).fit(X, y)
为了与 [ZHT2007] 中的定义保持一致,我们需要重新调整 AIC 和 BIC 的尺度。实际上,Zou 等人忽略了一些常数项,这些常数项与从线性模型的最大对数似然推导出的 AIC 原始定义相比。您可以参考 用户指南的数学细节部分 。
import numpy as np
aic_criterion = zou_et_al_criterion_rescaling(
lasso_lars_ic[-1].criterion_,
n_samples,
lasso_lars_ic[-1].noise_variance_,
)
index_alpha_path_aic = np.flatnonzero(
lasso_lars_ic[-1].alphas_ == lasso_lars_ic[-1].alpha_
)[0]
lasso_lars_ic.set_params(lassolarsic__criterion="bic").fit(X, y)
bic_criterion = zou_et_al_criterion_rescaling(
lasso_lars_ic[-1].criterion_,
n_samples,
lasso_lars_ic[-1].noise_variance_,
)
index_alpha_path_bic = np.flatnonzero(
lasso_lars_ic[-1].alphas_ == lasso_lars_ic[-1].alpha_
)[0]
现在我们已经收集了AIC和BIC,我们可以检查两个准则的最小值是否发生在相同的alpha值处。然后,我们可以简化下面的图表。
index_alpha_path_aic == index_alpha_path_bic
np.True_
最终,我们可以绘制AIC和BIC准则以及随后的选择正则化参数。
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot(aic_criterion, color="tab:blue", marker="o", label="AIC criterion")
plt.plot(bic_criterion, color="tab:orange", marker="o", label="BIC criterion")
plt.vlines(
index_alpha_path_bic,
aic_criterion.min(),
aic_criterion.max(),
color="black",
linestyle="--",
label="Selected alpha",
)
plt.legend()
plt.ylabel("Information criterion")
plt.xlabel("Lasso model sequence")
_ = plt.title("Lasso model selection via AIC and BIC")
Total running time of the script: (0 minutes 0.045 seconds)
Related examples