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高斯混合模型椭圆体#
绘制通过期望最大化( GaussianMixture
类)和变分推断(具有狄利克雷过程先验的 BayesianGaussianMixture
类模型)获得的两个高斯混合模型的置信椭圆体。
两个模型都可以使用五个组件来拟合数据。请注意,期望最大化模型将必然使用所有五个组件,而变分推断模型实际上只会使用所需的组件数量以获得良好的拟合。在这里我们可以看到,期望最大化模型会任意地分割一些组件,因为它试图拟合过多的组件,而狄利克雷过程模型会自动调整其状态数量。
这个例子没有展示出来,因为我们处于低维空间中,但狄利克雷过程模型的另一个优点是,即使每个簇的示例数量少于数据的维度,由于推断算法的正则化特性,它也可以有效地拟合完整的协方差矩阵。
/app/scikit-learn-main-origin/sklearn/mixture/_base.py:251: ConvergenceWarning:
Best performing initialization did not converge. Try different init parameters, or increase max_iter, tol, or check for degenerate data.
import itertools
import matplotlib as mpl
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from scipy import linalg
from sklearn import mixture
color_iter = itertools.cycle(["navy", "c", "cornflowerblue", "gold", "darkorange"])
def plot_results(X, Y_, means, covariances, index, title):
splot = plt.subplot(2, 1, 1 + index)
for i, (mean, covar, color) in enumerate(zip(means, covariances, color_iter)):
v, w = linalg.eigh(covar)
v = 2.0 * np.sqrt(2.0) * np.sqrt(v)
u = w[0] / linalg.norm(w[0])
# 由于动态规划不会使用它能访问的每个组件,除非它需要它们,我们不应该绘制冗余组件。
if not np.any(Y_ == i):
continue
plt.scatter(X[Y_ == i, 0], X[Y_ == i, 1], 0.8, color=color)
# 绘制椭圆以显示高斯成分
angle = np.arctan(u[1] / u[0])
angle = 180.0 * angle / np.pi # convert to degrees
ell = mpl.patches.Ellipse(mean, v[0], v[1], angle=180.0 + angle, color=color)
ell.set_clip_box(splot.bbox)
ell.set_alpha(0.5)
splot.add_artist(ell)
plt.xlim(-9.0, 5.0)
plt.ylim(-3.0, 6.0)
plt.xticks(())
plt.yticks(())
plt.title(title)
# Number of samples per component
#
#
n_samples = 500
# 生成随机样本,两个组成部分
np.random.seed(0)
C = np.array([[0.0, -0.1], [1.7, 0.4]])
X = np.r_[
np.dot(np.random.randn(n_samples, 2), C),
0.7 * np.random.randn(n_samples, 2) + np.array([-6, 3]),
]
# 使用五个成分通过EM拟合高斯混合模型
gmm = mixture.GaussianMixture(n_components=5, covariance_type="full").fit(X)
plot_results(X, gmm.predict(X), gmm.means_, gmm.covariances_, 0, "Gaussian Mixture")
# 使用五个成分拟合狄利克雷过程高斯混合模型
dpgmm = mixture.BayesianGaussianMixture(n_components=5, covariance_type="full").fit(X)
plot_results(
X,
dpgmm.predict(X),
dpgmm.means_,
dpgmm.covariances_,
1,
"Bayesian Gaussian Mixture with a Dirichlet process prior",
)
plt.show()
Total running time of the script: (0 minutes 0.091 seconds)
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